PUF60 - PUF60
Faktor poly (U) vázání-spojování PUF60 je protein že u lidí je kódován PUF60 gen.[5][6][7][8]
Protein kódovaný tímto genem je protein vázající Ro RNP. Interaguje s Ro RNP a jejich interakce je považována za zisk funkce pro Ro RNP. Tento protein také tvoří ternární komplex s daleko upstream elementem (FUSE) a proteinem vázajícím FUSE. Může potlačit reportéra c-myc pomocí FUSE. Je také známo, že cílí na transkripční faktor IIH a inhibuje aktivovanou transkripci. Tento gen je zapojen do poruchy xeroderma pigmentosum. Existují dvě alternativně sestříhané transkriptové varianty tohoto genu kódující různé izoformy. Zdá se, že existují důkazy o mnoha polyadenylačních místech pro tento gen.[8]
Interakce
Bylo prokázáno, že PUF60 komunikovat s U2AF2.[9][10]
Reference
- ^ A b C ENSG00000274081 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000179950, ENSG00000274081 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002524 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Bouffard P, Barbar E, Brière F, Boire G (leden 2000). „Interakční klonování a charakterizace RoBPI, nové vazby proteinu na lidské Ro ribonukleoproteiny“. RNA. 6 (1): 66–78. doi:10.1017 / S1355838200990277. PMC 1369894. PMID 10668799.
- ^ Liu J, He L, Collins I, Ge H, Libutti D, Li J, Egly JM, Levens D (únor 2000). "FBP interagující represor cílí na TFIIH, aby inhiboval aktivovanou transkripci". Molekulární buňka. 5 (2): 331–41. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80428-1. PMID 10882074.
- ^ Hastings ML, Allemand E, Duelli DM, Myers MP, Krainer AR (červen 2007). Valcarcel J (ed.). „Řízení sestřihu pre-mRNA obecnými spojovacími faktory PUF60 a U2AF (65)“. PLOS ONE. 2 (6): e538. Bibcode:2007PLoSO ... 2..538H. doi:10.1371 / journal.pone.0000538. PMC 1888729. PMID 17579712.
- ^ A b "Entrez Gene: SIAHBP1 fúzně vázající protein interagující represor".
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Další čtení
- Page-McCaw PS, Amonlirdviman K, Sharp PA (prosinec 1999). „PUF60: nová spojovací aktivita související s U2AF65“. RNA. 5 (12): 1548–60. doi:10.1017 / S1355838299991938. PMC 1369877. PMID 10606266.
- Poleev A, Hartmann A, Stamm S (červenec 2000). "Trans-působící faktor, izolovaný tříhybridním systémem, který ovlivňuje alternativní sestřih minigenu proteinu amyloidního prekurzoru". European Journal of Biochemistry. 267 (13): 4002–10. doi:10.1046 / j.1432-1327.2000.01431.x. PMID 10866799.
- Liu J, Akoulitchev S, Weber A, Ge H, Chuikov S, Libutti D, Wang XW, Conaway JW, Harris CC, Conaway RC, Reinberg D, Levens D (únor 2001). "Vadná souhra aktivátorů a represorů s TFIH v xeroderma pigmentosum". Buňka. 104 (3): 353–63. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00223-9. PMID 11239393. S2CID 16066683.
- Sandrock B, Egly JM (září 2001). „Kvasinkový čtyřhybridní systém identifikuje kinázu aktivující Cdk jako regulátor XPD helikázy, podjednotky transkripčního faktoru IIH“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (38): 35328–33. doi:10,1074 / jbc.M105570200. PMID 11445587.
- Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (srpen 2004) . "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Aktuální biologie. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
- Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
- Liu J, Kouzine F, Nie Z, Chung HJ, Elisha-Feil Z, Weber A, Zhao K, Levens D (květen 2006). „Systém FUSE / FBP / FIR / TFIIH je molekulární stroj programující pulz výrazu c-myc“. Časopis EMBO. 25 (10): 2119–30. doi:10.1038 / sj.emboj.7601101. PMC 1462968. PMID 16628215.
- Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
- Kew C, Huang W, Fischer J, Ganesan R, Robinson N, Antebi A (červen 2020). „Evolučně konzervovaná regulace imunity spojovacím faktorem RNP-6 / PUF60“. eLife. 9: e57591. doi:10,7554 / eLife.57591. PMC 7332298. PMID 32538777.
externí odkazy
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro faktor PUF60 vázající se na lidské poly (U) vázání
Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |