PPP1R9A - PPP1R9A

PPP1R9A

Protein PPP1R9A PDB 1wf8.png

Dostupné struktury

Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
1WF8

Identifikátory

PPP1R9ANRB1, NRBI, Neurabin-I, regulační podjednotka proteinové fosfatázy 1, 9A

Externí ID

OMIM: 602468 MGI: 2442401 HomoloGene: 14247 Genové karty: PPP1R9A

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 7 (lidský)^[1]

Kapela	7q21.3	Start	94,907,202 bp^[1]
Kapela	7q21.3	Konec	95,296,415 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 6 (myš)^[2]

Kapela	6 A1 \| 6 1,86 cM	Start	4,902,917 bp^[2]
Kapela	6 A1 \| 6 1,86 cM	Konec	5,165,661 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu • specifické vazby na proteinovou doménu • vazba proteinové fosfatázy 1 • GO: 0001948 vazba na proteiny • Vazba GTPázy • aktinová vazba • vazba aktinového vlákna • vazba na C-konec proteinu • vazba protein kinázy • vazba iontového kanálu • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu
Buněčná složka	• krk dendritické páteře • cytosol • filopodium • růstový kužel • neuromuskulární spojení • dendritická páteř • synapse • růstový kužel lamellipodium • buněčné spojení • tělo neuronových buněk • kortikální aktinový cytoskelet • neuronová projekce • cytoskelet • lamellipodium • cytoplazma • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota • aktinový cytoskelet • dendrit • postsynaptický aktinový cytoskelet • glutamátergická synapse
Biologický proces	• regulace sestavy filopodia • diferenciace buněk • regulace strukturní plasticity synapsí • regulace sestavy synapsí • stárnutí • buněčná odpověď na toxickou látku • vývoj neuronů • pozitivní regulace vývoje dendritické páteře • vývoj nervového systému • vývoj mnohobuněčných organismů • regulace polymerace aktinových vláken • excitační postsynaptický potenciál • negativní regulace dlouhodobé synaptické potenciace • negativní regulace spontánní sekrece neurotransmiteru • pozitivní regulace dlouhodobé synaptické deprese • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů • negativní regulace sestavy napěťových vláken • regulace morfogeneze dendritické páteře • pozitivní regulace aktivity proteinkinázy • organizace aktinových vláken • vápníkem zprostředkovaná signalizace • vývoj projekce neuronů • modulace chemického synaptického přenosu • postsynaptická aktinová cytoskeletová organizace
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


55607


243725


ENSG00000158528


ENSMUSG00000032827


Q9ULJ8


n / a

RefSeq (mRNA)


NM_001166160 NM_001166161 NM_001166162 NM_001166163 NM_017650


NM_181595 NM_001363809

RefSeq (protein)

NP_001159632 NP_001159633 NP_001159634 NP_001159635 NP_060120
NP_001159635.1


n / a

Místo (UCSC)

Chr 7: 94,91 - 95,3 Mb

Chr 6: 4,9 - 5,17 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Neurabin-1 je protein že u lidí je kódován PPP1R9A gen.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158528 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032827 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Ishikawa K, Kikuno R, Hirosawa M, Nomura N, Ohara O (leden 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (5): 337–45. doi:10.1093 / dnares / 6.5.337. PMID 10574462.
^ „Entrez Gene: PPP1R9A protein fosfatáza 1, regulační (inhibitor) podjednotka 9A“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Nakanishi H, Obaishi H, Satoh A a kol. (1997). „Neurabin: Nový protein vázající aktinové vlákno na neurální tkáň podílející se na tvorbě neuritů“. J. Cell Biol. 139 (4): 951–61. doi:10.1083 / jcb.139.4.951. PMC 2139968. PMID 9362513.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
McAvoy T, Allen PB, Obaishi H a kol. (1999). "Regulace interakce neurabinu I s proteinovou fosfatázou 1 fosforylací". Biochemie. 38 (39): 12943–9. doi:10.1021 / bi991227d. PMID 10504266.
Stephens DJ, Banting G (1999). „Přímá interakce membránového proteinu trans-Golgiho sítě, TGN38, s proteinem vázajícím F-aktin, neurabinem“. J. Biol. Chem. 274 (42): 30080–6. doi:10.1074 / jbc.274.42.30080. PMID 10514494.
Oliver CJ, Terry-Lorenzo RT, Elliott E a kol. (2002). „Cílení na proteinovou fosfatázu 1 (PP1) na aktinový cytoskelet: komplex neururinu I / PP1 reguluje buněčnou morfologii“. Mol. Buňka. Biol. 22 (13): 4690–701. doi:10.1128 / MCB.22.13.4690-4701.2002. PMC 133892. PMID 12052877.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Human Chromosome 7: DNA Sequence and Biology“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA a kol. (2003). „Sekvence DNA lidského chromozomu 7“. Příroda. 424 (6945): 157–64. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.