POLR2K - POLR2K

POLR2K
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5FLM, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5YYB, 5IY7, 5IY8, 5YYD, 5IY6
Identifikátory
Aliasy	POLR2K, ABC10-alfa, RPABC4, RPB10alpha, RPB12, RPB7.0, hRPB7.0, hsRPB10a, podjednotka K polymerázy (RNA) II, podjednotka K polymerázy II, K podjednotka RNA polymerázy II, I a III
Externí ID	OMIM: 606033 MGI: 102725 HomoloGene: 86049 Genové karty: POLR2K
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	100,154,003 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	36,177,010 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba iontů zinku; • Aktivita RNA polymerázy II; • vazba kovových iontů; • Aktivita RNA polymerázy III; • Aktivita 5'-3 'RNA polymerázy zaměřená na DNA; • Aktivita RNA polymerázy I.;
Buněčná složka	• cytosol; • nukleoplazma; • Komplex RNA-polymerázy I zaměřený na DNA; • Komplex DNA polymerázy III zaměřený na DNA; • DNA zaměřená RNA polymeráza II, jádrový komplex; • buněčné jádro;
Biologický proces	• ukončení transkripce RNA polymerázy I.; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • pozitivní regulace genové exprese, epigenetická; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Uzávěr mRNA 7-methylguanosinu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • transkripce snRNA z promotoru RNA polymerázy II; • signální dráha receptoru pro růstový faktor fibroblastů; • RNA metabolický proces; • regulace umlčování genů miRNA; • transkripce, chráněná DNA; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • pozitivní regulace produkce interferonu typu I.; • udržování populace somatických kmenových buněk; • pozitivní regulace virové transkripce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5440
	17749
	ENSG00000147669
	ENSMUSG00000045996
	P53803
	Q63871
	NM_005034
	NM_001039368; NM_023127
	NP_005025
	NP_001034457; NP_075616
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

DNA řízené RNA polymerázy I, II a III podjednotky RPABC4 je protein že u lidí je kódován POLR2K gen.

Tento gen kóduje jednu z nejmenších podjednotek RNA polymerázy II, polymerázy odpovědné za syntézu messengerové RNA v eukaryotech. Tato podjednotka je sdílena dalšími dvěma DNA polymerázami zaměřenými na DNA.^[5]

Interakce

POLR2K bylo prokázáno komunikovat s POLR2C.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147669 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045996 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: POLR2K polymeráza (RNA) II (řízená DNA) polypeptid K, 7,0 kDa“.
^ Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (červenec 1997). „Interakce mezi podjednotkami lidské RNA polymerázy II“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (27): 16815–21. doi:10.1074 / jbc.272.27.16815. PMID 9201987.

Další čtení

Jeang KT (1998). "Tat, kináza asociovaná s Tat a transkripce". Journal of Biomedical Science. 5 (1): 24–7. doi:10.1007 / BF02253352. PMID 9570510.
Yankulov K, Bentley D (červen 1998). "Kontrola transkripce: Tat kofaktory a transkripční prodloužení". Aktuální biologie. 8 (13): R447-9. doi:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID 9651670. S2CID 15480646.
Romano G, Kasten M, De Falco G, Micheli P, Khalili K, Giordano A (prosinec 1999). "Regulační funkce Cdk9 a cyklinu T1 při expresi genu pro transaktivační dráhu HIV tat". Journal of Cellular Biochemistry. 75 (3): 357–68. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID 10536359.
Marcello A, Zoppé M, Giacca M (březen 2001). "Více režimů transkripční regulace transaktivátorem HIV-1 Tat". IUBMB Life. 51 (3): 175–81. doi:10.1080/152165401753544241. PMID 11547919. S2CID 10931640.
Howe KJ (září 2002). „RNA polymeráza II provádí symfonii činností zpracování před mRNA“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1577 (2): 308–24. doi:10.1016 / s0167-4781 (02) 00460-8. PMID 12213660.
Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (září 2006). „Regulace transkripce HIV-1: molekulární cíle pro chemoterapeutickou intervenci“. Recenze lékařského výzkumu. 26 (5): 595–625. doi:10.1002 / med.20081. PMC 7168390. PMID 16838299.
Harrich D, McMillan N, Munoz L, Apolloni A, Meredith L (prosinec 2006). „Vedou různé Tat interakce k novým antiretrovirovým lékovým cílům?“. Aktuální drogové cíle. 7 (12): 1595–606. doi:10.2174/138945006779025338. PMID 17168834.
Jang KL, Collins MK, Latchman DS (1992). „Protein viru lidské imunodeficience zvyšuje transkripci lidských Alu opakovaných sekvencí zvýšením aktivity buněčného transkripčního faktoru TFIIIC.“ Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. 5 (11): 1142–7. PMID 1403646.
Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (duben 1992). „HIV-1 Tat působí in vitro ve spojení s faktory prodlužování buněk jako faktor procesivity“. Geny a vývoj. 6 (4): 655–66. doi:10,1101 / gad. 6.4.455. PMID 1559613.
Southgate C, Zapp ML, Green MR (červen 1990). "Aktivace transkripce HIV-1 Tat proteinem uvázaným na rodící se RNA prostřednictvím jiného proteinu". Příroda. 345 (6276): 640–2. Bibcode:1990 Natur.345..640S. doi:10.1038 / 345640a0. PMID 2190099. S2CID 4233742.
Wu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (srpen 1995). „Specifická vazba RNA polymerázy II na transaktivující oblast RNA viru lidské imunodeficience je regulována buněčnými kofaktory a Tat“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (16): 7153–7. Bibcode:1995PNAS ... 92,7153W. doi:10.1073 / pnas.92.16.7153. PMC 41297. PMID 7638159.
Shpakovski GV, Acker J, Wintzerith M, Lacroix JF, Thuriaux P, Vigneron M (září 1995). „Čtyři podjednotky, které sdílejí tři třídy RNA polymerázy, jsou funkčně zaměnitelné mezi Homo sapiens a Saccharomyces cerevisiae.“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (9): 4702–10. doi:10,1128 / mcb.15.9.4702. PMC 230713. PMID 7651387.
Herrmann CH, Rice AP (březen 1995). „Lentivirové Tat proteiny se specificky asociují s buněčnou proteinovou kinázou TAK, která hyperfosforyluje karboxylterminální doménu velké podjednotky RNA polymerázy II: kandidát na kofaktor Tat“. Journal of Virology. 69 (3): 1612–20. doi:10.1128 / JVI.69.3.1612-1620.1995. PMC 188757. PMID 7853496.
Keen NJ, Gait MJ, Karn J (březen 1996). „Virus lidské imunodeficience typu 1 Tat je nedílnou součástí aktivovaného komplexu transkripce a prodloužení“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (6): 2505–10. Bibcode:1996PNAS ... 93,2505K. doi:10.1073 / pnas.93.6.2505. PMC 39827. PMID 8637904.
Yang X, Herrmann CH, Rice AP (červenec 1996). „Tat proteiny viru lidské imunodeficience se specificky asociují s TAK in vivo a pro svou funkci vyžadují karboxy-terminální doménu RNA polymerázy II“. Journal of Virology. 70 (7): 4576–84. doi:10.1128 / JVI.70.7.4576-4584.1996. PMC 190394. PMID 8676484.
Agostini I, Navarro JM, Rey F, Bouhamdan M, Spire B, Vigne R, Sire J (září 1996). "Transaktivátor viru lidské imunodeficience typu 1 Vpr: spolupráce s doménami aktivátoru vázaného na promotor a vazba na TFIIB". Journal of Molecular Biology. 261 (5): 599–606. doi:10.1006 / jmbi.1996.0485. PMID 8800208.
Zhou Q, Sharp PA (říjen 1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Okamoto H, Sheline CT, Corden JL, Jones KA, Peterlin BM (říjen 1996). „Transaktivace proteinem Tat viru lidské imunodeficience vyžaduje C-koncovou doménu RNA polymerázy II“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (21): 11575–9. Bibcode:1996PNAS ... 9311575O. doi:10.1073 / pnas.93.21.11575. PMC 38099. PMID 8876177.
Chun RF, Jeang KT (listopad 1996). "Požadavky na karboxyl-terminální doménu RNA polymerázy II pro aktivovanou transkripci lidských retrovirů, lidský lymfocytární virus T-buněk I a HIV-1". The Journal of Biological Chemistry. 271 (44): 27888–94. doi:10.1074 / jbc.271.44.27888. PMID 8910388.
Parada CA, Roeder RG (listopad 1996). „Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-vyvolaná fosforylace její karboxy-terminální domény“. Příroda. 384 (6607): 375–8. Bibcode:1996 Natur.384..375P. doi:10.1038 / 384375a0. PMID 8934526. S2CID 4278432.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147669 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045996 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] „Entrez Gene: POLR2K polymeráza (RNA) II (řízená DNA) polypeptid K, 7,0 kDa“.

[pmid9201987-6] Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (červenec 1997). „Interakce mezi podjednotkami lidské RNA polymerázy II“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (27): 16815–21. doi:10.1074 / jbc.272.27.16815. PMID 9201987.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]