POLR1C - POLR1C

POLR1C
Identifikátory
Aliasy	POLR1C, RPA39, RPA40, RPA5, RPAC1, TCS3, AC40, RPC40, HLD11, polymeráza (RNA) I podjednotka C, RNA polymeráza I podjednotka C, RNA polymeráza I a III podjednotka C
Externí ID	OMIM: 610060 MGI: 103288 HomoloGene: 3586 Genové karty: POLR1C
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	43,562,419 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	46,248,054 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • aktivita dimerizace bílkovin; • Aktivita RNA polymerázy III; • Aktivita 5'-3 'RNA polymerázy zaměřená na DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita RNA polymerázy I.;
Buněčná složka	• cytosol; • nukleoplazma; • Komplex DNA polymerázy III zaměřený na DNA; • buněčné jádro; • Komplex RNA-polymerázy I zaměřený na DNA;
Biologický proces	• transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • ukončení transkripce RNA polymerázy I.; • pozitivní regulace genové exprese, epigenetická; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • pozitivní regulace produkce interferonu typu I.;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9533
	20016
	ENSG00000171453
	ENSMUSG00000067148
	O15160
	P52432
	NM_004875; NM_203290; NM_001318876; NM_001363658
	NM_009085
	NP_001305805; NP_976035; NP_001350587
	NP_033111
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

DNA řízené RNA polymerázy I a III podjednotky RPAC1 je protein že u lidí je kódován POLR1C gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že POLR1C komunikovat s CD3EAP,^[8] POLR1E^[8]^[9]^[10] a POLR1D.^[11]^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171453 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067148 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
^ Dundr M, Hoffmann-Rohrer U, Hu Q, Grummt I, Rothblum LI, Phair RD, Misteli T (listopad 2002). "Kinetická kostra pro savčí RNA polymerázu in vivo". Věda. 298 (5598): 1623–6. Bibcode:2002Sci ... 298.1623D. doi:10.1126 / science.1076164. PMID 12446911. S2CID 36392120.
^ „Entrez Gene: POLR1C polymeráza (RNA) I polypeptid C, 30 kDa“.
^ ^A ^b Yamamoto K, Yamamoto M, Hanada K, Nogi Y, Matsuyama T, Muramatsu M (červenec 2004). „Mnohočetné interakce protein-protein pomocí faktoru PAF49 asociovaného s RNA polymerázou I a role PAF49 v transkripci rRNA“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (14): 6338–49. doi:10.1128 / MCB.24.14.6338-6349.2004. PMC 434256. PMID 15226435.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Seither P, Zatsepina O, Hoffmann M, Grummt I (září 1997). "Konstitutivní a silná asociace PAF53 s RNA polymerázou I". Chromozom. 106 (4): 216–25. doi:10.1007 / s004120050242. PMID 9254723. S2CID 23487728.
^ Yao Y, Yamamoto K, Nishi Y, Nogi Y, Muramatsu M (prosinec 1996). „Myší RNA polymeráza I 16-kDa podjednotka schopná asociovat s 40-kDa podjednotkou je homolog kvasinkové AC19 podjednotky RNA polymeráz I a III“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (51): 32881–5. doi:10.1074 / jbc.271.51.32881. PMID 8955128.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Další čtení

Yao Y, Yamamoto K, Nishi Y, Nogi Y, Muramatsu M (prosinec 1996). „Myší RNA polymeráza I 16-kDa podjednotka schopná asociovat s 40-kDa podjednotkou je homolog kvasinkové AC19 podjednotky RNA polymeráz I a III“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (51): 32881–5. doi:10.1074 / jbc.271.51.32881. PMID 8955128.
Seither P, Zatsepina O, Hoffmann M, Grummt I (září 1997). "Konstitutivní a silná asociace PAF53 s RNA polymerázou I". Chromozom. 106 (4): 216–25. doi:10.1007 / s004120050242. PMID 9254723. S2CID 23487728.
Dammann R, Pfeifer GP (březen 1998). "Klonování a charakterizace podjednotky lidské RNA polymerázy I hRPA40". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1396 (2): 153–7. doi:10.1016 / s0167-4781 (97) 00206-6. PMID 9540830.
Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (Červenec 1998). "Identifikace genů exprimovaných v lidských CD34 (+) hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách pomocí exprimovaných sekvenčních značek a účinného klonování cDNA v plné délce". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (14): 8175–80. Bibcode:1998PNAS ... 95,8175M. doi:10.1073 / pnas.95.14.8175. PMC 20949. PMID 9653160.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (leden 2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Aktuální biologie. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Shiratori M, Suzuki T, Itoh C, Goto M, Furuichi Y, Matsumoto T (duben 2002). „WRN helikáza urychluje transkripci ribozomální RNA jako složky komplexu spojeného s RNA polymerázou I“. Onkogen. 21 (16): 2447–54. doi:10.1038 / sj.onc.1205334. PMID 11971179.
Hu P, Wu S, Sun Y, Yuan CC, Kobayashi R, Myers MP, Hernandez N (listopad 2002). „Charakterizace lidské RNA polymerázy III identifikuje ortology pro podjednotky RNA polymerázy III Saccharomyces cerevisiae“ (PDF). Molekulární a buněčná biologie. 22 (22): 8044–55. doi:10.1128 / MCB.22.22.8044-8055.2002. PMC 134740. PMID 12391170.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (únor 2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Přírodní buněčná biologie. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Yamamoto K, Yamamoto M, Hanada K, Nogi Y, Matsuyama T, Muramatsu M (červenec 2004). „Mnohočetné interakce protein-protein pomocí faktoru PAF49 asociovaného s RNA polymerázou I a role PAF49 v transkripci rRNA“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (14): 6338–49. doi:10.1128 / MCB.24.14.6338-6349.2004. PMC 434256. PMID 15226435.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171453 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067148 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11042152-5] Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.

[pmid12446911-6] Dundr M, Hoffmann-Rohrer U, Hu Q, Grummt I, Rothblum LI, Phair RD, Misteli T (listopad 2002). "Kinetická kostra pro savčí RNA polymerázu in vivo". Věda. 298 (5598): 1623–6. Bibcode:2002Sci ... 298.1623D. doi:10.1126 / science.1076164. PMID 12446911. S2CID 36392120.

[entrez-7] „Entrez Gene: POLR1C polymeráza (RNA) I polypeptid C, 30 kDa“.

[pmid15226435-8] A ^b Yamamoto K, Yamamoto M, Hanada K, Nogi Y, Matsuyama T, Muramatsu M (červenec 2004). „Mnohočetné interakce protein-protein pomocí faktoru PAF49 asociovaného s RNA polymerázou I a role PAF49 v transkripci rRNA“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (14): 6338–49. doi:10.1128 / MCB.24.14.6338-6349.2004. PMC 434256. PMID 15226435.

[pmid17353931-9] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid9254723-10] Seither P, Zatsepina O, Hoffmann M, Grummt I (září 1997). "Konstitutivní a silná asociace PAF53 s RNA polymerázou I". Chromozom. 106 (4): 216–25. doi:10.1007 / s004120050242. PMID 9254723. S2CID 23487728.

[pmid8955128-11] Yao Y, Yamamoto K, Nishi Y, Nogi Y, Muramatsu M (prosinec 1996). „Myší RNA polymeráza I 16-kDa podjednotka schopná asociovat s 40-kDa podjednotkou je homolog kvasinkové AC19 podjednotky RNA polymeráz I a III“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (51): 32881–5. doi:10.1074 / jbc.271.51.32881. PMID 8955128.

[pmid16189514-12] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]