Protein interagující s polymerázou delta 2 také známý jako Polymerázový delta-interagující protein 38 kDa (PDIP38) je kódován POLDIP2 gen u lidí [5] [6] .
Tento gen kóduje protein, který interaguje s podjednotkou p50 DNA polymerázy. Kódovaný protein také interaguje s proliferujícím buněčným jaderným antigenem. Některé transkripty tohoto genu se překrývají v ocasní orientaci s genem pro tumor nekrotizující faktor, alfa-indukovaný protein 1 (TNFAIP1) [6] . POLDIP2 / PDIP38 je protein měsíčního svitu, který byl identifikován v obou jádrech [7] a mitochondrie [8] [9]
Interakce V jádru se ukázalo, že POLDIP2 komunikovat s PCNA [5] , zatímco v mitochondriích bylo prokázáno, že POLDIP2 interaguje s proteiny tvořícími mitochondriální DNA nukleoid [10] a AAA + proteáza CLPXP [9] [11] kde moduluje jak specifičnost, tak stabilitu tohoto proteolytického stroje.
Reference ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000004142 - Ensembl , Květen 2017^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001100 - Ensembl , Květen 2017^ „Human PubMed Reference:“ . Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna .^ „Myš PubMed Reference:“ . Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna .^ A b Liu L, Rodriguez-Belmonte EM, Mazloum N, Xie B, Lee MY (březen 2003). „Identifikace nového proteinu, PDIP38, který interaguje s podjednotkou p50 delta DNA polymerázy a proliferujícím buněčným jaderným antigenem“ . The Journal of Biological Chemistry . 278 (12): 10041–7. doi :10,1074 / jbc.M208694200 . PMID 12522211 . ^ A b "Entrez Gene: POLDIP2 polymeráza (řízená DNA), delta interagující protein 2" .^ Wong A, Zhang S, Mordue D, Wu JM, Zhang Z, Darzynkiewicz Z a kol. (Říjen 2013). „PDIP38 je translokován do spliceosomů / jaderných skvrn v reakci na poškození DNA indukované UV zářením a je vyžadován pro alternativní sestřih MDM2 indukovaný UV zářením“ . Buněčný cyklus . 12 (19): 3184–93. doi :10,4161 / cc.26221 . PMC 3865014 . PMID 23989611 . ^ Xie B, Li H, Wang Q, Xie S, Rahmeh A, Dai W, Lee MY (červen 2005). "Další charakterizace proteinu interagujícího s lidskou DNA polymerázou delta 38". The Journal of Biological Chemistry . 280 (23): 22375–84. doi :10,1074 / jbc.M414597200 . PMID 15811854 . ^ A b Strack PR, Brodie EJ, Zhan H, Schuenemann VJ, Valente LJ, Saiyed T a kol. (Listopad 2020). „Polymeráza delta-interagující protein 38 (PDIP38) moduluje stabilitu a aktivitu mitochondriální AAA + proteázy CLPXP“ . Komunikační biologie . 3 (1): 646. doi :10.1038 / s42003-020-01358-6 . PMC 7647994 . PMID 33159171 . ^ Cheng X, Kanki T, Fukuoh A, Ohgaki K, Takeya R, Aoki Y a kol. (Prosinec 2005). "PDIP38 se asociuje s proteiny tvořícími mitochondriální DNA nukleoid". Journal of Biochemistry . 138 (6): 673–8. doi :10.1093 / jb / mvi169 . PMID 16428295 . ^ Paredes F, Sheldon K, Lassègue B, Williams HC, Faidley EA, Benavides GA a kol. (Únor 2018). „Poldip2 je protein citlivý na kyslík, který řídí lipoylaci a aktivaci PDH a αKGDH na podporu metabolické adaptace při hypoxii a rakovině“ . Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických . 115 (8): 1789–1794. doi :10.1073 / pnas.1720693115 . PMC 5828627 . PMID 29434038 . Další čtení Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ a kol. (Říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“ . Výzkum genomu . 10 (10): 1546–60. doi :10,1101 / gr. 140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 . Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“ . Výzkum genomu . 10 (11): 1788–95. doi :10,1101 / gr. 143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 . Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“ . Zprávy EMBO . 1 (3): 287–92. doi :10.1093 / embo-reports / kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 . Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A a kol. (Říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“ . Výzkum genomu . 14 (10B): 2136–44. doi :10,1101 / gr. 2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 . Xie B, Li H, Wang Q, Xie S, Rahmeh A, Dai W, Lee MY (červen 2005). „Další charakterizace proteinu interagujícího s lidskou DNA polymerázou delta 38“ . The Journal of Biological Chemistry . 280 (23): 22375–84. doi :10,1074 / jbc.M414597200 . PMID 15811854 . Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H a kol. (Září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka . 122 (6): 957–68. doi :10.1016 / j.cell.2005.08.029 . hdl :11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 . Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N a kol. (Říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda . 437 (7062): 1173–8. doi :10.1038 / nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 . Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F a kol. (Leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“ . Výzkum nukleových kyselin . 34 (Problém s databází): D415-8. doi :10.1093 / nar / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 . Klaile E, Müller MM, Kannicht C, Otto W, Singer BB, Reutter W a kol. (Září 2007). „Receptor buněčné adheze s karcinoembryonálním antigenem související s buněčnou adhezní molekulou 1 reguluje nukleocytoplazmatický přenos DNA polymerázy delta-interagující protein 38“ . The Journal of Biological Chemistry . 282 (36): 26629–40. doi :10,1074 / jbc.M701807200 . PMID 17623671 .