POLDIP2 - POLDIP2

POLDIP2
Identifikátory
AliasyPOLDIP2, PDIP38, POLD4, p38, protein 2 interagující s polymerázou (DNA) 2, protein 2 interagující s DNA polymerázou 2
Externí IDOMIM: 611519 MGI: 1915061 HomoloGene: 9201 Genové karty: POLDIP2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomická poloha pro POLDIP2
Genomická poloha pro POLDIP2
Kapela17q11.2Start28,346,633 bp[1]
Konec28,357,527 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE POLDIP2 217806 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_015584
NM_001290145

NM_026389

RefSeq (protein)

NP_001277074
NP_056399

NP_080665

Místo (UCSC)Chr 17: 28,35 - 28,36 MbChr 11: 78,51 - 78,52 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein interagující s polymerázou delta 2 také známý jako Polymerázový delta-interagující protein 38 kDa (PDIP38) je kódován POLDIP2 gen u lidí [5][6].

Tento gen kóduje protein, který interaguje s podjednotkou p50 DNA polymerázy. Kódovaný protein také interaguje s proliferujícím buněčným jaderným antigenem. Některé transkripty tohoto genu se překrývají v ocasní orientaci s genem pro tumor nekrotizující faktor, alfa-indukovaný protein 1 (TNFAIP1) [6]. POLDIP2 / PDIP38 je protein měsíčního svitu, který byl identifikován v obou jádrech [7] a mitochondrie [8][9]

Interakce

V jádru se ukázalo, že POLDIP2 komunikovat s PCNA [5], zatímco v mitochondriích bylo prokázáno, že POLDIP2 interaguje s proteiny tvořícími mitochondriální DNA nukleoid [10] a AAA + proteáza CLPXP [9][11] kde moduluje jak specifičnost, tak stabilitu tohoto proteolytického stroje.

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000004142 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001100 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b Liu L, Rodriguez-Belmonte EM, Mazloum N, Xie B, Lee MY (březen 2003). „Identifikace nového proteinu, PDIP38, který interaguje s podjednotkou p50 delta DNA polymerázy a proliferujícím buněčným jaderným antigenem“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (12): 10041–7. doi:10,1074 / jbc.M208694200. PMID  12522211.
  6. ^ A b "Entrez Gene: POLDIP2 polymeráza (řízená DNA), delta interagující protein 2".
  7. ^ Wong A, Zhang S, Mordue D, Wu JM, Zhang Z, Darzynkiewicz Z a kol. (Říjen 2013). „PDIP38 je translokován do spliceosomů / jaderných skvrn v reakci na poškození DNA indukované UV zářením a je vyžadován pro alternativní sestřih MDM2 indukovaný UV zářením“. Buněčný cyklus. 12 (19): 3184–93. doi:10,4161 / cc.26221. PMC  3865014. PMID  23989611.
  8. ^ Xie B, Li H, Wang Q, Xie S, Rahmeh A, Dai W, Lee MY (červen 2005). "Další charakterizace proteinu interagujícího s lidskou DNA polymerázou delta 38". The Journal of Biological Chemistry. 280 (23): 22375–84. doi:10,1074 / jbc.M414597200. PMID  15811854.
  9. ^ A b Strack PR, Brodie EJ, Zhan H, Schuenemann VJ, Valente LJ, Saiyed T a kol. (Listopad 2020). „Polymeráza delta-interagující protein 38 (PDIP38) moduluje stabilitu a aktivitu mitochondriální AAA + proteázy CLPXP“. Komunikační biologie. 3 (1): 646. doi:10.1038 / s42003-020-01358-6. PMC  7647994. PMID  33159171.
  10. ^ Cheng X, Kanki T, Fukuoh A, Ohgaki K, Takeya R, Aoki Y a kol. (Prosinec 2005). "PDIP38 se asociuje s proteiny tvořícími mitochondriální DNA nukleoid". Journal of Biochemistry. 138 (6): 673–8. doi:10.1093 / jb / mvi169. PMID  16428295.
  11. ^ Paredes F, Sheldon K, Lassègue B, Williams HC, Faidley EA, Benavides GA a kol. (Únor 2018). „Poldip2 je protein citlivý na kyslík, který řídí lipoylaci a aktivaci PDH a αKGDH na podporu metabolické adaptace při hypoxii a rakovině“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 115 (8): 1789–1794. doi:10.1073 / pnas.1720693115. PMC  5828627. PMID  29434038.

Další čtení