PMPCA - PMPCA

PMPCA
Identifikátory
Aliasy	PMPCA, Alpha-MPP, INPP5E, P-55, SCAR2, peptidáza, mitochondriální zpracování alfa podjednotky, CLA1, CPD3, peptidáza, mitochondriální zpracování podjednotky alfa
Externí ID	OMIM: 613036 MGI: 1918568 HomoloGene: 6078 Genové karty: PMPCA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	136,423,761 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	26,397,122 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy; • aktivita hydrolázy; • aktivita metalopeptidázy; • aktivita metaloendopeptidázy; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • katalytická aktivita; • aktivita endopeptidázy;
Buněčná složka	• mitochondriální matice; • mitochondrie; • membrána; • mitochondriální vnitřní membrána; • extracelulární; • mitochondriální zpracování peptidázový komplex;
Biologický proces	• proteolýza; • zpracování proteinů zapojené do cílení proteinů na mitochondrie; • mitochondriální transmembránový transport iontů vápníku;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23203
	66865
	ENSG00000165688
	ENSMUSG00000026926
	Q10713; Q5SXN9
	Q9DC61
	NM_001282944; NM_001282946; NM_015160
	NM_173180
	NP_001269873; NP_001269875; NP_055975
	NP_775272
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Mitochondriální podjednotka peptidázového zpracování alfa je enzym že u lidí je kódován PMPCA gen.^[5]^[6]^[7] Tento gen PMPCA kódoval protein, který je členem rodiny peptidáz M16. Tento protein se nachází v mitochondriální matrici a katalyzuje štěpení hlavních peptidů prekurzorových proteinů nově importovaných do mitochondrií, i když funguje pouze jako součást heterodimerního komplexu.

Struktura

Prekurzorový protein alfa podjednotky peptidázového zpracování mitochondrií má velikost 58,2 KDa a skládá se z 525 aminokyselin. Prekurzorový protein obsahuje 33 aminokyselinový N-koncový fragment jako mitochondriální cílovou sekvenci. Po štěpení má vyzrálý PMPCA protein velikost 54,6 KDa a má teoretickou hodnotu pI 5,88.

Funkce

Mitochondriální peptidáza (MPP) je metaloendopeptidáza, která obsahuje dvě strukturně příbuzné podjednotky, podjednotku alfa a mitochondriální podjednotka peptidázového zpracování beta, který pracuje společně pro svou katalytickou funkci.^[8] Obsahující katalytické místo, beta podjednotka PMPCB protein štěpí presekvence (tranzitní peptidy) z prekurzorů mitochondriálních proteinů a uvolňuje N-koncové tranzitní peptidy z prekurzorových proteinů importovaných do mitochondrie, obvykle s Arg v poloze P2.

Interakce

Jako alfa podjednotka mitochondriální zpracovávající peptidázy tvoří PMPCA heterodimer s podjednotkou PMPCB.

Klinický význam

Většina mitochondriálních proteinů je nukleárně kódována, což vyžaduje správnou translokaci mitochondriálních cílových proteinů. Mnoho mitochondriálních proteinů je syntetizováno ve formě prekurzoru, který obsahuje sekvenci zaměřenou na mitochondrie. Tyto prekurzory jsou obvykle štěpeny peptidázami a proteázami dříve, než dorazí do své suborganelární polohy. Je pravděpodobné, že změněná aktivita mitochondriálních zpracovatelských peptidáz je nezbytná pro zajištění správného zrání mitochondriálních proteinů a že změněná aktivita těchto proteáz bude mít dramatické účinky na aktivitu, stabilitu a sestavování mitochondriálních proteinů. Důkazy ukázaly, že MPP se účastnil proteolytického zrání Frataxinu, proteinu odpovědného za homeostázu železa.^[9] Proto bylo prokázáno, že nedostatek MPP je zapojen do Friedreichovy ataxie, autossomické recesivní neurodegenerativní poruchy^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165688 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000026926 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (březen 1996). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
^ Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, Sazuka T, Seki N, Sato S, Tabata S, Ishikawa K, Kawarabayasi Y, Kotani H a kol. (Červenec 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. III. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0081-KIAA0120) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 2 (1): 37–43. doi:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
^ „Entrez Gene: PMPCA peptidáza (mitochondriální zpracování) alfa“.
^ Teixeira PF, Glaser E (únor 2013). „Zpracování peptidáz v mitochondriích a chloroplastech“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1833 (2): 360–70. doi:10.1016 / j.bbamcr.2012.03.012. PMID 22495024.
^ Branda SS, Yang ZY, Chew A, Isaya G (červen 1999). „Mitochondriální intermediární peptidáza a homolog kvasinkového frataxinu společně udržují homeostázu mitochondriálního železa v Saccharomyces cerevisiae“. Lidská molekulární genetika. 8 (6): 1099–110. doi:10,1093 / hmg / 8,6.1099. PMID 10332043.
^ Cavadini P, Adamec J, Taroni F, Gakh O, Isaya G (prosinec 2000). „Dvoustupňové zpracování lidského frataxinu mitochondriálním zpracováním peptidázy. Prekurzorové a intermediární formy jsou štěpeny různými rychlostmi“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (52): 41469–75. doi:10,1074 / jbc.M006539200. PMID 11020385.
^ Patel PI, Isaya G (červenec 2001). „Friedreichova ataxie: od expanze triplet-repeat GAA k deficitu frataxinu“. American Journal of Human Genetics. 69 (1): 15–24. doi:10.1086/321283. PMC 1226030. PMID 11391483.

Další čtení

Srinivasan M, Kalousek F, Curthoys NP (1995). „In vitro charakterizace mitochondriálního zpracování a potenciální funkce podjednotky 68-kDa renální glutaminázy“. J. Biol. Chem. 270 (3): 1185–90. doi:10.1074 / jbc.270.3.1185. PMID 7836378.
Luciano P, Geoffroy S, Brandt A a kol. (1997). "Funkční spolupráce podjednotek peptidázového zpracování mitochondrií". J. Mol. Biol. 272 (2): 213–25. doi:10.1006 / jmbi.1997.1231. PMID 9299349.
Nagao Y, Kitada S, Kojima K a kol. (2000). „Oblast mitochondriální zpracování peptidázové alfa podjednotky bohatá na glyciny je nezbytná pro vazbu a štěpení prekurzorových proteinů“. J. Biol. Chem. 275 (44): 34552–6. doi:10,1074 / jbc.M003110200. PMID 10942759.
Harris RA, Yang A, Stein RC a kol. (2002). "Klastrová analýza rozsáhlé databáze proteinové mapy exprese buněčné linie lidské rakoviny prsu". Proteomika. 2 (2): 212–23. doi:10.1002 / 1615-9861 (200202) 2: 2 <212 :: AID-PROT212> 3.0.CO; 2-H. PMID 11840567.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Hassel S, Eichner A, Yakymovych M, et al. (2004). "Proteiny spojené s kostním morfogenetickým proteinovým receptorem typu II (BMPR-II) a identifikované pomocí dvourozměrné gelové elektroforézy a hmotnostní spektrometrie". Proteomika. 4 (5): 1346–58. doi:10.1002 / pmic.200300770. PMID 15188402. S2CID 6773754.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165688 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000026926 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8590280-5] Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (březen 1996). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.

[pmid7788527-6] Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, Sazuka T, Seki N, Sato S, Tabata S, Ishikawa K, Kawarabayasi Y, Kotani H a kol. (Červenec 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. III. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0081-KIAA0120) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 2 (1): 37–43. doi:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.

[entrez-7] „Entrez Gene: PMPCA peptidáza (mitochondriální zpracování) alfa“.

[8] Teixeira PF, Glaser E (únor 2013). „Zpracování peptidáz v mitochondriích a chloroplastech“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1833 (2): 360–70. doi:10.1016 / j.bbamcr.2012.03.012. PMID 22495024.

[9] Branda SS, Yang ZY, Chew A, Isaya G (červen 1999). „Mitochondriální intermediární peptidáza a homolog kvasinkového frataxinu společně udržují homeostázu mitochondriálního železa v Saccharomyces cerevisiae“. Lidská molekulární genetika. 8 (6): 1099–110. doi:10,1093 / hmg / 8,6.1099. PMID 10332043.

[10] Cavadini P, Adamec J, Taroni F, Gakh O, Isaya G (prosinec 2000). „Dvoustupňové zpracování lidského frataxinu mitochondriálním zpracováním peptidázy. Prekurzorové a intermediární formy jsou štěpeny různými rychlostmi“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (52): 41469–75. doi:10,1074 / jbc.M006539200. PMID 11020385.

[11] Patel PI, Isaya G (červenec 2001). „Friedreichova ataxie: od expanze triplet-repeat GAA k deficitu frataxinu“. American Journal of Human Genetics. 69 (1): 15–24. doi:10.1086/321283. PMC 1226030. PMID 11391483.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]