PLXNA2 - PLXNA2

PLXNA2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3Q3J
Identifikátory
Aliasy	PLXNA2OCT, PLXN2, plexin A2
Externí ID	OMIM: 601054 MGI: 107684 HomoloGene: 56427 Genové karty: PLXNA2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	208,244,384 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	194,816,869 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita receptoru semaforinu; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • komplex semaforinového receptoru; • membrána; • integrální součást plazmatické membrány;
Biologický proces	• somitogeneze; • signální dráha receptoru buněčného povrchu; • regulace prodloužení axonu při vedení axonu; • tangenciální migrace prekurzoru buněk cerebelární granule; • pobočkový neuron navádění axonů; • tvorba pupenů končetin; • vývoj neurální trubice; • semaforin-plexinová signální dráha; • signální transdukce; • vývoj hltanového systému; • lokalizace centrozomu; • regulace buněčné migrace; • negativní regulace buněčné adheze; • regulace tvaru buňky; • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 regulace aktivity GTPázy; • pozitivní regulace axonogeneze; • semaforin-plexinová signální dráha zapojená do vedení axonů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5362
	18845
	ENSG00000076356
	ENSMUSG00000026640
	O75051
	P70207
	NM_025179
	NM_008882
	NP_079455
	NP_032908
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Plexin-A2 je protein že u lidí je kódováno PLXNA2 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena plexin - Rodina semaforin ko-receptory. Semafory jsou velká rodina sekretovaných nebo na membránu vázaných proteinů, které zprostředkovávají odpudivé účinky hledání axonů v době vývoj nervového systému. Podskupinu semaforinů rozpoznávají komplexy transmembránových receptorů plexin-A / neuropilin, což spouští kaskádu přenosu signálu, která vede k axon odpor. Předpokládá se, že tento člen rodiny plexin-A přenáší signály z semaforin-3A a -3C.^[6]

V některých studiích je gen PLXNA2 spojován s schizofrenie.^[7] a úzkost.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000076356 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026640 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Maestrini E, Tamagnone L, Longati P, Cremona O, Gulisano M, Bione S, Tamanini F, Neel BG, Toniolo D, Comoglio PM (březen 1996). "Rodina transmembránových proteinů s homologií k receptoru růstového faktoru MET-hepatocytů". Proc Natl Acad Sci USA. 93 (2): 674–8. doi:10.1073 / pnas.93.2.674. PMC 40111. PMID 8570614.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PLXNA2 plexin A2“.
^ Přehled genů všech publikovaných studií asociace schizofrenie pro PLXNA2 Archivováno 2009-02-21 na Wayback Machine - база данных SZGene, сайт Fórum pro výzkum schizofrenie
^ Wray NR, James MR, Mah SP, Nelson M, Andrews G, Sullivan PF, Montgomery GW, Birley AJ, Braun A, Martin NG (březen 2007). „Úzkost a komorbidita související s PLXNA2“. Oblouk. Gen. psychiatrie. 64 (3): 318–26. doi:10.1001 / archpsyc.64.3.318. PMID 17339520. Archivovány od originál dne 2009-07-20. Citováno 2009-02-11.

Další čtení

Negishi M, Oinuma I, Katoh H (2005). "Plexiny: vedení axonů a přenos signálu". Buňka. Mol. Life Sci. 62 (12): 1363–71. doi:10.1007 / s00018-005-5018-2. PMID 15818466.
Seki N, Ohira M, Nagase T a kol. (1998). "Charakterizace cDNA klonů v knihovnách cDNA s frakcionací podle velikosti z lidského mozku". DNA Res. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.
Tamagnone L, Artigiani S, Chen H a kol. (1999). „Plexiny jsou velkou rodinou receptorů pro transmembránové, vylučované a GPI ukotvené semaforiny u obratlovců“. Buňka. 99 (1): 71–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID 10520995.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). „Interakce protein – protein mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–84. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), rozsáhlá snaha o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Mah S, Nelson MR, Delisi LE a kol. (2006). „Identifikace semaforinového receptoru PLXNA2 jako kandidáta na náchylnost k schizofrenii“. Mol. Psychiatrie. 11 (5): 471–8. doi:10.1038 / sj.mp.4001785. PMID 16402134.
Fujii T, Iijima Y, Kondo H a kol. (2007). "Nepotvrzení asociace mezi genem PLXNA2 a schizofrenií v japonské populaci". Prog. Neuropsychopharmacol. Biol. Psychiatrie. 31 (4): 873–7. doi:10.1016 / j.pnpbp.2007.01.027. PMID 17346868.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000076356 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026640 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8570614-5] Maestrini E, Tamagnone L, Longati P, Cremona O, Gulisano M, Bione S, Tamanini F, Neel BG, Toniolo D, Comoglio PM (březen 1996). "Rodina transmembránových proteinů s homologií k receptoru růstového faktoru MET-hepatocytů". Proc Natl Acad Sci USA. 93 (2): 674–8. doi:10.1073 / pnas.93.2.674. PMC 40111. PMID 8570614.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PLXNA2 plexin A2“.

[SZGene-7] Přehled genů všech publikovaných studií asociace schizofrenie pro PLXNA2 Archivováno 2009-02-21 na Wayback Machine - база данных SZGene, сайт Fórum pro výzkum schizofrenie

[pmid17339520-8] Wray NR, James MR, Mah SP, Nelson M, Andrews G, Sullivan PF, Montgomery GW, Birley AJ, Braun A, Martin NG (březen 2007). „Úzkost a komorbidita související s PLXNA2“. Oblouk. Gen. psychiatrie. 64 (3): 318–26. doi:10.1001 / archpsyc.64.3.318. PMID 17339520. Archivovány od originál dne 2009-07-20. Citováno 2009-02-11.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]