PDLIM7 - PDLIM7

PDLIM7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2Q3G
Identifikátory
Aliasy	PDLIM7, LMP1, LMP3, PDZ a LIM doména 7
Externí ID	OMIM: 605903 MGI: 1914649 HomoloGene: 3980 Genové karty: PDLIM7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	177,497,606 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	55,513,676 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktinová vazba; • svalová vazba alfa-aktininu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • prohrábnout; • cytoskelet; • buněčné jádro; • stresové vlákno; • ohnisková adheze; • aktinový cytoskelet; • cytosol; • Z disk; • vláknitý aktin;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • diferenciace buněk; • pozitivní regulace diferenciace osteoblastů; • receptorem zprostředkovaná endocytóza; • organizace aktinového cytoskeletu; • zkostnatění; • axonové vedení; • vývoj srdce; • vývoj svalové struktury;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9260
	67399
	ENSG00000196923
	ENSMUSG00000021493
	Q9NR12
	Q3TJD7
	NM_005451; NM_203352; NM_203353; NM_213636
	NM_001114087; NM_001114088; NM_026131
	NP_005442; NP_976227; NP_998801
	NP_001107559; NP_001107560; NP_080407
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

PDZ a LIM doménový protein 7 je protein že u lidí je kódován PDLIM7 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je zástupcem rodiny proteinů složených z konzervovaných domén PDZ a LIM. Domény LIM jsou navrženy tak, aby fungovaly při rozpoznávání proteinů a proteinů v různých kontextech, včetně transkripce a vývoje genů, a při cytoskeletální interakci. Domény LIM tohoto proteinu se vážou na protein kinázy, zatímco doména PDZ se váže na aktinová vlákna. Genový produkt se podílí na sestavení komplexu spojeného s aktinovými vlákny nezbytného pro přenos mitogenní signalizace ret / ptc2. Biologická funkce bude pravděpodobně funkce adaptéru, přičemž doména PDZ lokalizuje proteiny vázající LIM na aktinová vlákna jak kosterního svalstva, tak nesvalových tkání. Alternativní sestřih tohoto genu vede k několika variantám transkriptu.^[6]

Interakce

PDLIM7 bylo prokázáno komunikovat s TPM2.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196923 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021493 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Liu Y, Hair GA, Boden SD, Viggeswarapu M, Titus L (březen 2002). "Nadměrně exprimované LIM mineralizační proteiny nevyžadují pro indukci kosti LIM domény." Journal of Bone and Mineral Research. 17 (3): 406–14. doi:10.1359 / jbmr.2002.17.3.406. PMID 11874232. S2CID 26089809.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PDLIM7 PDZ and LIM domain 7 (enigma)“.
^ Guy PM, Kenny DA, Gill GN (červen 1999). „Doména PDZ enigmy proteinu LIM se váže na beta-tropomyosin“. Molekulární biologie buňky. 10 (6): 1973–84. doi:10,1091 / mbc. 10. 6. 1973. PMC 25398. PMID 10359609.

Další čtení

Bach I (březen 2000). Msgstr "Doména LIM: regulace podle asociace". Mechanismy rozvoje. 91 (1–2): 5–17. doi:10.1016 / S0925-4773 (99) 00314-7. PMID 10704826. S2CID 16093470.
Wu RY, Gill GN (říjen 1994). Msgstr "Rozpoznávání LIM domény těsného obratu obsahujícího tyrosin". The Journal of Biological Chemistry. 269 (40): 25085–90. PMID 7929196.
Kuroda S, Tokunaga C, Kiyohara Y, Higuchi O, Konishi H, Mizuno K a kol. (Prosinec 1996). "Protein-protein interakce zinkových prstů LIM domén s proteinkinázou C". The Journal of Biological Chemistry. 271 (49): 31029–32. doi:10.1074 / jbc.271.49.31029. PMID 8940095.
Durick K, Gill GN, Taylor SS (duben 1998). „Shc a Enigma jsou vyžadovány pro mitogenní signalizaci pomocí Ret / ptc2“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (4): 2298–308. doi:10,1128 / mcb.18.4.2298. PMC 121481. PMID 9528800.
Guy PM, Kenny DA, Gill GN (červen 1999). „Doména PDZ enigmy proteinu LIM se váže na beta-tropomyosin“. Molekulární biologie buňky. 10 (6): 1973–84. doi:10,1091 / mbc. 10. 6. 1973. PMC 25398. PMID 10359609.
Borrello MG, Mercalli E, Perego C, Degl'Innocenti D, Ghizzoni S, Arighi E a kol. (Srpen 2002). "Diferenciální interakce proteinu Enigma se dvěma izoformami RET". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 296 (3): 515–22. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00886-0. PMID 12176011.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N a kol. (Říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Sangadala S, Boden SD, Viggeswarapu M, Liu Y, Titus L (červen 2006). „LIM mineralizační protein-1 potencuje citlivost kostní morfogenetické bílkoviny prostřednictvím nové interakce se Smurf1 vedoucí ke snížení ubikvitinace Smadů“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (25): 17212–9. doi:10,1074 / jbc.M511013200. PMID 16611643.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF a kol. (Květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Barrès R, Grémeaux T, Gual P, Gonzalez T, Gugenheim J, Tran A a kol. (Listopad 2006). „Enigma interaguje s adaptorovým proteinem s doménami PH a SH2, aby kontrolovala remodelaci cytoskeletu aktinu vyvolanou aktinem a translokaci transportéru glukózy 4“. Molekulární endokrinologie. 20 (11): 2864–75. doi:10.1210 / me.2005-0455. PMC 1892539. PMID 16803868.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196923 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021493 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11874232-5] Liu Y, Hair GA, Boden SD, Viggeswarapu M, Titus L (březen 2002). "Nadměrně exprimované LIM mineralizační proteiny nevyžadují pro indukci kosti LIM domény." Journal of Bone and Mineral Research. 17 (3): 406–14. doi:10.1359 / jbmr.2002.17.3.406. PMID 11874232. S2CID 26089809.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PDLIM7 PDZ and LIM domain 7 (enigma)“.

[pmid10359609-7] Guy PM, Kenny DA, Gill GN (červen 1999). „Doména PDZ enigmy proteinu LIM se váže na beta-tropomyosin“. Molekulární biologie buňky. 10 (6): 1973–84. doi:10,1091 / mbc. 10. 6. 1973. PMC 25398. PMID 10359609.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]