PDE1A - PDE1A

PDE1A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1LXQ
Identifikátory
Aliasy	PDE1A, CAM-PDE-1A, HCAM-1, HCAM1, HSfosfodiesteráza 1A, CAM-PDE 1A
Externí ID	OMIM: 171890 MGI: 1201792 HomoloGene: 21043 Genové karty: PDE1A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	182,523,192 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	80,129,458 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita fosforečné diesterové hydrolázy; • kalmodulin-dependentní cyklická nukleotidová fosfodiesterázová aktivita; • aktivita hydrolázy; • Aktivita 3 ', 5'-cyklického nukleotidu fosfodiesterázy; • vazba kovových iontů; • kalmodulinová vazba; • aktivita 3 ', 5'-cyklické-GMP fosfodiesterázy regulovaná vápníkem a kalmodulinem; • cGMP vazba; • Aktivita 3 ', 5'-cyklické-AMP fosfodiesterázy; • Aktivita 3 ', 5'-cyklické-GMP fosfodiesterázy;
Buněčná složka	• cytosol; • cytoplazma; • buněčné jádro; • tělo neuronových buněk;
Biologický proces	• cGMP katabolický proces; • cAMP katabolický proces; • signální transdukce; • regulace apoptotického procesu buněk hladkého svalstva; • regulace proliferace buněk hladkého svalstva; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5136
	18573
	ENSG00000115252
	ENSMUSG00000059173
	P54750; Q9Y633
	Q61481
NM_001003683; NM_001258312; NM_001258313; NM_001258314; NM_005019;
	NM_001363871
NM_001009978; NM_001009979; NM_001159582; NM_016744; NM_001355140;
	NM_001355141; NM_001355142; NM_001355143; NM_001355144
NP_001003683; NP_001245241; NP_001245242; NP_001245243; NP_005010;
	NP_001350800; NP_001245241.1
NP_001009978; NP_001009979; NP_001153054; NP_058024; NP_001342069;
	NP_001342070; NP_001342071; NP_001342073
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

3 ', 5'-cyklická nukleotid fosfodiesteráza 1A závislá na vápníku / kalmodulinu je enzym že u lidí je kódován PDE1A gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115252 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059173 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Loughney K, Martins TJ, Harris EA, Sadhu K, Hicks JB, Sonnenburg WK, Beavo JA, Ferguson K (únor 1996). „Izolace a charakterizace cDNA odpovídající dvěma lidským kalciím, 3 ', 5'-cyklickými nukleotidovými fosfodiesterázami regulovanými kalmodulinem“. J Biol Chem. 271 (2): 796–806. doi:10.1074 / jbc.271.2.796. PMID 8557689.
^ Michibata H, Yanaka N, Kanoh Y, Okumura K, Omori K (květen 2001). "Lidská Ca2 + / kalmodulin-dependentní fosfodiesteráza PDE1A: nové sestřihové varianty, jejich specifická exprese, genomová organizace a chromozomální lokalizace". Biochim Biophys Acta. 1517 (2): 278–87. doi:10.1016 / s0167-4781 (00) 00293-1. PMID 11342109.
^ „Entrezův gen: PDE1A fosfodiesteráza 1A, závislá na kalmodulinu“.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Snyder PB, Florio VA, Ferguson K, Loughney K (1999). „Izolace, exprese a analýza sestřihových variant lidské fosfodiesterázy stimulované lidským Ca2 + / kalmodulinem (PDE1A)“. Buňka. Signál. 11 (7): 535–44. doi:10.1016 / S0898-6568 (99) 00027-3. PMID 10405764.
Zauli G, Milani D, Mirandola P a kol. (2001). „HIV-1 Tat protein down-reguluje expresi transkripčního faktoru CREB v neuronálních buňkách PC12 cestou fosfatidylinositol 3-kinázy / AKT / cyklické nukleosidové fosfodiesterázy“. FASEB J.. 15 (2): 483–91. doi:10.1096 / fj.00-0354com. PMID 11156964. S2CID 26315564.
Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S a kol. (2001). "Vytvoření knihoven exprese proteinů v celém genomu pomocí náhodné aktivace genové exprese". Nat. Biotechnol. 19 (5): 440–5. doi:10.1038/88107. PMID 11329013. S2CID 25064683.
Yan C, Zhao AZ, Sonnenburg WK, Beavo JA (2001). "Fázová a buněčně specifická exprese kalmodulin-dependentních fosfodiesteráz v myších varlat". Biol. Reprod. 64 (6): 1746–54. doi:10.1095 / biolreprod64.6.1746. PMID 11369604.
Fidock M, Miller M, Lanfear J (2002). "Izolace a diferenciální tkáňová distribuce dvou lidských cDNA kódujících sestřihové varianty PDE1". Buňka. Signál. 14 (1): 53–60. doi:10.1016 / S0898-6568 (01) 00207-8. PMID 11747989.
Ritter M, Buechler C, Boettcher A a kol. (2002). „Klonování a charakterizace nového proteinu vázajícího apolipoprotein A-I, AI-BP, vylučovaného buňkami proximálních tubulů ledvin v reakci na HDL nebo ApoA-I“. Genomika. 79 (5): 693–702. doi:10.1006 / geno.2002.6761. PMID 11991719.
Lefièvre L, de Lamirande E, Gagnon C (2003). „Přítomnost cyklických nukleotidových fosfodiesteráz PDE1A, existujících jako stabilní komplex s kalmodulinem, a PDE3A v lidských spermiích“. Biol. Reprod. 67 (2): 423–30. doi:10.1095 / biolreprod67.2.423. PMID 12135876.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Goraya TA, Masada N, Ciruela A, Cooper DM (2004). „K aktivaci Ca2 + -kalmodulin-dependentní fosfodiesterázy 1A je nutný trvalý vstup Ca2 +“. J. Biol. Chem. 279 (39): 40494–504. doi:10,1074 / jbc.M313441200. PMID 15272012.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Nagel DJ, Aizawa T, Jeon KI a kol. (2006). "Role jaderné Ca2 + / kalmodulinem stimulované fosfodiesterázy 1A v růstu a přežití buněk vaskulárního hladkého svalstva". Circ. Res. 98 (6): 777–84. doi:10.1161 / 01.RES.0000215576.27615.fd. PMC 4114760. PMID 16514069.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115252 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059173 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8557689-5] Loughney K, Martins TJ, Harris EA, Sadhu K, Hicks JB, Sonnenburg WK, Beavo JA, Ferguson K (únor 1996). „Izolace a charakterizace cDNA odpovídající dvěma lidským kalciím, 3 ', 5'-cyklickými nukleotidovými fosfodiesterázami regulovanými kalmodulinem“. J Biol Chem. 271 (2): 796–806. doi:10.1074 / jbc.271.2.796. PMID 8557689.

[pmid11342109-6] Michibata H, Yanaka N, Kanoh Y, Okumura K, Omori K (květen 2001). "Lidská Ca2 + / kalmodulin-dependentní fosfodiesteráza PDE1A: nové sestřihové varianty, jejich specifická exprese, genomová organizace a chromozomální lokalizace". Biochim Biophys Acta. 1517 (2): 278–87. doi:10.1016 / s0167-4781 (00) 00293-1. PMID 11342109.

[entrez-7] „Entrezův gen: PDE1A fosfodiesteráza 1A, závislá na kalmodulinu“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]