PDCD4 - PDCD4

PDCD4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 KZT, 2 GGF, 2RG8, 2ZU6, 3EIJ
Identifikátory
Aliasy	PDCD4, H731, programovaná buněčná smrt 4 (inhibitor neoplastické transformace), programovaná buněčná smrt 4
Externí ID	OMIM: 608610 MGI: 107490 HomoloGene: 7879 Genové karty: PDCD4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	110,900,006 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	53,929,860 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • cytosol; • nukleoplazma;
Biologický proces	• stárnutí buněk; • regulace procesu metabolismu bílkovin; • negativní regulace buněčného cyklu; • negativní regulace apoptotického procesu; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace aktivity JUN kinázy; • pozitivní regulace apoptotického procesu buněk hladkého svalstva; • negativní regulace diferenciace myofibroblastů; • apoptotický proces; • pozitivní regulace apoptotického procesu endotelových buněk; • Signální dráha BMP; • přechod epitelu do mezenchymu zapojený do vývoje srdečních fibroblastů; • negativní regulace diferenciace buněk hladkého svalstva cév; • pozitivní regulace zánětlivé reakce; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • negativní regulace produkce cytokinů podílející se na zánětlivé reakci; • pozitivní regulace signalizace NIK / NF-kappaB; • interleukin-12 zprostředkovaná signální dráha; • negativní regulace proliferace buněk hladkého svalstva cév; • pozitivní regulace apoptotického procesu s buňkami hladkého svalstva spojeného s cévami;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	27250
	18569
	ENSG00000150593
	ENSMUSG00000024975
	Q53EL6; Q5VZS7
	Q61823
	NM_145341; NM_001199492; NM_014456
	NM_001168491; NM_001168492; NM_011050
	NP_001186421; NP_055271; NP_663314
	NP_001161963; NP_001161964; NP_035180
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Programovaný protein buněčné smrti 4 je protein že u lidí je kódován PDCD4 gen.^[5]^[6] Je to jeden z cílů oncomiR, MIRN21.^[7]

Funkce

Tento gen kóduje protein lokalizovaný v jádře v proliferujících buňkách. Exprese tohoto genu je modulována cytokiny v přirozených zabijácích a T buňkách. Předpokládá se, že genový produkt hraje roli v apoptóze, ale specifická role dosud nebyla stanovena. Byly identifikovány dva přepisy kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že PDCD4 komunikovat s RPS13^[8] , Ribozomální protein L5.^[8], p62, LC3 a ubikvitin [9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150593 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024975 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Azzoni L, Zatsepina O, Abebe B, Bennett IM, Kanakaraj P, Perussia B (1998). „Diferenciální transkripční regulace CD161 a nového genu, 197 / 15a, pomocí IL-2, IL-15 a IL-12 v NK a T buňkách“. Journal of Immunology. 161 (7): 3493–500. PMID 9759869.
^ ^A ^b EntrezGene 27250
^ Frankel LB, Christoffersen NR, Jacobsen A, Lindow M, Krogh A, Lund AH (2008). „Programovaná buněčná smrt 4 (PDCD4) je důležitým funkčním cílem mikroRNA miR-21 v buňkách rakoviny prsu“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (2): 1026–33. doi:10,1074 / jbc.M707224200. PMID 17991735.
^ ^A ^b Kang MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (2002). "Up-regulace PDCD4 v senescentních lidských diploidních fibroblastech". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 293 (1): 617–21. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00264-4. PMID 12054647.

9. Manirujjaman M, Ozaki I, Murata Y, Guo J, Xia J, Nishioka K, Perveen R, Takahashi H, Anzai K, Matsuhashi S (2020). "Degradace nádorového potlačovače PDCD4 je narušena potlačením p62 / SQSTM1 a autofagie". Buňky. 9 (1): 218. doi.org/10.3390/cells9010218.

Další čtení

Göke R, Gregel C, Göke A, Arnold R, Schmidt H, Lankat-Buttgereit B (2004). „Programmed Cell Death Protein 4 (PDCD4) Acts as a Tumor Suppressor in Neuroendocrine Tumor Cells“. Annals of the New York Academy of Sciences. 1014: 220–1. doi:10.1196 / annals.1294.024. PMID 15153438. S2CID 9284462.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: Jednoduchá metoda pro nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Shibahara K, Asano M, Ishida Y, Aoki T, Koike T, Honjo T (1995). "Izolace nového myšího genu MA-3, který je indukován po programované buněčné smrti". Gen. 166 (2): 297–301. doi:10.1016/0378-1119(95)00607-9. PMID 8543179.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-konec". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Yoshinaga H, Matsuhashi S, Fujiyama C, Masaki Z (1999). „Nový lidský gen PDCD4 (H731) exprimovaný v proliferativních buňkách je exprimován v epiteliálních buňkách prsu malých kanálků, jak odhalila protilátka anti-H731“. Pathology International. 49 (12): 1067–77. doi:10.1046 / j.1440-1827.1999.00995.x. PMID 10632927. S2CID 968499.
Soejima, H .; Miyoshi, O .; Yoshinaga, H .; Masaki, Z .; Ozaki, I .; Kajiwara, S .; Niikawa, N .; Matsuhashi, S .; Mukai, T. (1999). "Úkol¹ programovaného genu buněčné smrti 4 (PDCD4) do lidského chromozomového pásma 10q24 hybridizací in situ ". Cytogenetický a genomový výzkum. 87 (1–2): 113–4. doi:10.1159/000015408. PMID 10640828. S2CID 34560093.
Kang MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (2002). "Up-regulace PDCD4 v senescentních lidských diploidních fibroblastech". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 293 (1): 617–21. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00264-4. PMID 12054647.
Chen Y, Knösel T, Kristiansen G, Pietas A, Garber ME, Matsuhashi S, Ozaki I, Petersen I (2003). „Ztráta exprese PDCD4 u lidské rakoviny plic koreluje s progresí nádoru a prognózou“. The Journal of Pathology. 200 (5): 640–6. doi:10,1002 / cesta. 1378. PMID 12898601. S2CID 25899458.
Yang HS, Cho MH, Zakowicz H, Hegamyer G, Sonenberg N, Colburn NH (2004). „Nová funkce domén MA-3 v transformátoru a supresoru translace Pdcd4 je nezbytná pro její vazbu na eukaryotický iniciační faktor 4A“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (9): 3894–906. doi:10.1128 / MCB.24.9.3894-3906.2004. PMC 387765. PMID 15082783.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). "Robustní fosfoproteomické profilování tyrosinových fosforylačních stránek z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie". Analytická chemie. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Göke R, Barth P, Schmidt A, Samans B, Lankat-Buttgereit B (2004). „Programovaný protein 4 buněčné smrti potlačuje CDK1 / cdc2 indukcí p21Waf1 / Cip1“. AJP: Buněčná fyziologie. 287 (6): C1541–6. doi:10.1152 / ajpcell.00025.2004. PMID 15317660.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2004). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Palamarchuk A, Efanov A, Maximov V, Aqeilan RI, Croce CM, Pekarsky Y (2005). „Akt fosforyluje a reguluje protein potlačující nádory Pdcd4“. Výzkum rakoviny. 65 (24): 11282–6. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-3469. PMID 16357133.
Yang HS, Matthews CP, Clair T, Wang Q, Baker AR, Li CC, Tan TH, Colburn NH (2006). "Tumorigenesis Suppressor Pdcd4 down-reguluje mitogenem aktivovaná protein kináza kináza kináza kináza 1 výraz k potlačení invaze buněk karcinomu tlustého střeva". Molekulární a buněčná biologie. 26 (4): 1297–306. doi:10.1128 / MCB.26.4.1297-1306.2006. PMC 1367180. PMID 16449643.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150593 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024975 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9759869-5] Azzoni L, Zatsepina O, Abebe B, Bennett IM, Kanakaraj P, Perussia B (1998). „Diferenciální transkripční regulace CD161 a nového genu, 197 / 15a, pomocí IL-2, IL-15 a IL-12 v NK a T buňkách“. Journal of Immunology. 161 (7): 3493–500. PMID 9759869.

[entrez-6] A ^b EntrezGene 27250

[7] Frankel LB, Christoffersen NR, Jacobsen A, Lindow M, Krogh A, Lund AH (2008). „Programovaná buněčná smrt 4 (PDCD4) je důležitým funkčním cílem mikroRNA miR-21 v buňkách rakoviny prsu“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (2): 1026–33. doi:10,1074 / jbc.M707224200. PMID 17991735.

[pmid12054647-8] A ^b Kang MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (2002). "Up-regulace PDCD4 v senescentních lidských diploidních fibroblastech". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 293 (1): 617–21. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00264-4. PMID 12054647.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]