PCDHA3 - PCDHA3

PCDHA3
Protein PCDHA3 PDB 1wuz.png
Identifikátory
AliasyPCDHA3, PCDH-ALPHA3, protocadherin alfa 3
Externí IDOMIM: 606309 MGI: 2447313 HomoloGene: 129613 Genové karty: PCDHA3
Umístění genu (člověk)
Chromozom 5 (lidský)
Chr.Chromozom 5 (lidský)[1]
Chromozom 5 (lidský)
Genomické umístění pro PCDHA3
Genomické umístění pro PCDHA3
Kapela5q31.3Start140,801,028 bp[1]
Konec141,012,347 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PCDHA3 210572 na fs.png

PBB GE PCDHA3 211870 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_031497
NM_018906

NM_138662

RefSeq (protein)

NP_061729
NP_113685

NP_619603

Místo (UCSC)Chr 5: 140,8 - 141,01 MbChr 18: 36,95 - 37,19 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protocadherin alfa-3 je protein že u lidí je kódován PCDHA3 gen.[5][6]

Tento gen je členem protocadherinového alfa genového klastru, jednoho ze tří příbuzných genových klastrů tandemově spojených na chromozom 5 které prokazují neobvyklou genomickou organizaci podobnou organizaci B-buňka a T-buňka shluky genů receptoru.

Shluk genů alfa se skládá z 15 kadherin geny superrodiny související s myšími geny CNR a skládá se ze 13 vysoce podobných a 2 vzdáleněji příbuzných kódujících sekvencí. Tandemové pole 15 N-terminálu exony, nebo variabilní exony, jsou následovány po proudu C-terminál exony neboli konstantní exony, které sdílejí všechny geny v klastru. Velký, nepřerušovaný N-terminál exony každý kóduje šest kadherinových ektodomén, zatímco C-koncové exony kódují cytoplazmatický doména.

Tyto neurální kadherinům podobné buněčné adhezní proteiny jsou integrální plazmatická membrána proteiny, které s největší pravděpodobností hrají klíčovou roli při vytváření a funkci specifických spojení buněk a buněk v mozku. Bylo pozorováno alternativní sestřih a byly navrženy další varianty, ale jejich celovečerní charakter ještě nebyl stanoven.[6]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000255408 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000102312 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Wu Q, Maniatis T (červenec 1999). „Stávkující organizace velké rodiny lidských neurálních kadherinových genů pro buněčnou adhezi“. Buňka. 97 (6): 779–90. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80789-8. PMID  10380929. S2CID  6014717.
  6. ^ A b „Entrez Gene: PCDHA3 protocadherin alpha 3“.

Další čtení