PARP4 - PARP4

PARP4
Identifikátory
Aliasy	PARP4, ADPRTL1, ARTD4, PARP-4, PARPL, PH5P, VAULT3, VPARP, VWA5C, p193, člen rodiny polymerů poly (ADP-ribóza) 4
Externí ID	OMIM: 607519 MGI: 2685589 HomoloGene: 124423 Genové karty: PARP4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	24,512,778 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	56,659,794 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • Vazba DNA; • aktivita transferázy, přenos glykosylových skupin; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba enzymu; • Aktivita NAD + ADP-ribosyltransferázy; • aktivita proteinu ADP-ribosylázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána; • vřeteno; • vřetenová mikrotubule; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • buněčné jádro; • cytosol; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• proteinová ADP-ribosylace; • buněčná smrt; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • proces modifikace buněčného proteinu; • zánětlivá reakce; • Oprava DNA; • reakce na drogu; • regulace aktivity telomerázy; • doprava; • mono-ADP-ribosylace proteinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	143
	328417
	ENSG00000102699
	ENSMUSG00000054509
	Q9UKK3
	E9PYK3
	NM_006437
	NM_001145978
	NP_006428
	NP_001139450
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Poly [ADP-ribóza] polymeráza 4 je enzym že u lidí je kódován PARP4 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje protein typu 1 (ADP-ribosyl) transferázy podobný 1, který je schopen katalyzovat reakci poly (ADP-ribosyl) -ation. Tento protein má katalytickou doménu, která je homologní s doménou poly (ADP-ribosyl) transferázy, ale postrádá N-terminál DNA vazebná doména, která aktivuje C-terminál katalytická doména poly (ADP-ribosyl) transferázy. Protože tento protein není schopen vázat DNA přímo, může být jeho aktivita transferázy aktivována dalšími faktory, jako je interakce protein-protein zprostředkovaná rozsáhlým karboxylovým koncem.^[6]

Interakce

PARP4 bylo prokázáno komunikovat s Hlavní protein trezoru.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102699 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000054509 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Stále IH, Vince P, Cowell JK (březen 2000). „Identifikace nového genu (ADPRTL1) kódujícího potenciální protein Poly (ADP-ribosyl) transferázy“. Genomika. 62 (3): 533–6. doi:10.1006 / geno.1999,6024. PMID 10644454.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PARP4 poly (ADP-ribose) polymerase family, member 4“.
^ van Zon, Arend; Mossink Marieke H; Schoester Martijn; Scheffer George L; Scheper Rik J; Sonneveld Pieter; Wiemer Erik A C (březen 2002). "Strukturální domény proteinů trezoru: role domény coiled coil v sestavě trezoru". Biochem. Biophys. Res. Commun. 291 (3): 535–41. doi:10.1006 / bbrc.2002.6472. ISSN 0006-291X. PMID 11855821.
^ Kickhoefer, VA; Siva AC; Kedersha N L; Inman EM; Ruland C; Streuli M; Řím L H (září 1999). „Trezorový protein 193 kD, VPARP, je nová poly (ADP-ribóza) polymeráza“. J. Cell Biol. 146 (5): 917–28. doi:10.1083 / jcb.146.5.917. ISSN 0021-9525. PMC 2169495. PMID 10477748.

Další čtení

Jean L, Risler JL, Nagase T a kol. (1999). „Jaderný protein PH5P nadrodiny inter-alfa-inhibitorů: chybějící spojení mezi poly (ADP-ribóza) polymerázou a rodinou inter-alfa-inhibitorů a nový aktér opravy DNA?“. FEBS Lett. 446 (1): 6–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00173-8. PMID 10100603.
Soldani C, Scovassi AI (2003). "Štěpení poly (ADP-ribóza) polymerázy-1 během apoptózy: aktualizace". Apoptóza. 7 (4): 321–8. doi:10.1023 / A: 1016119328968. PMID 12101391.
Bouchard VJ, Rouleau M, Poirier GG (2003). "PARP-1, determinant buněčného přežití v reakci na poškození DNA". Exp. Hematol. 31 (6): 446–54. doi:10.1016 / S0301-472X (03) 00083-3. PMID 12829019.
Soares MB, Bonaldo MF, Jelene P a kol. (1994). "Konstrukce a charakterizace normalizované knihovny cDNA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (20): 9228–32. Bibcode:1994PNAS ... 91.9228S. doi:10.1073 / pnas.91.20.9228. PMC 44785. PMID 7937745.
Nagase T, Seki N, Ishikawa K a kol. (1996). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. V. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0161-KIAA0200) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 3 (1): 17–24. doi:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID 8724849.
Kickhoefer VA, Siva AC, Kedersha NL a kol. (1999). „Trezorový protein 193 kD, VPARP, je nová poly (ADP-ribóza) polymeráza“. J. Cell Biol. 146 (5): 917–28. doi:10.1083 / jcb.146.5.917. PMC 2169495. PMID 10477748.
Kickhoefer VA, Stephen AG, Harrington L a kol. (2000). „Trezory a telomeráza sdílejí společnou podjednotku, TEP1“. J. Biol. Chem. 274 (46): 32712–7. doi:10.1074 / jbc.274.46.32712. PMID 10551828.
Siva AC, Raval-Fernandes S, Stephen AG a kol. (2001). „Upregulace trezorů může být nutná, ale nedostatečná pro multidrogovou rezistenci“. Int. J. Cancer. 92 (2): 195–202. doi:10.1002 / 1097-0215 (200102) 9999: 9999 <:: AID-IJC1168> 3.0.CO; 2-7. PMID 11291045.
van Zon A, Mossink MH, Schoester M a kol. (2001). „Několik RNA lidského trezoru. Exprese a asociace s komplexem trezoru“. J. Biol. Chem. 276 (40): 37715–21. doi:10,1074 / jbc.M106055200. PMID 11479319.
van Zon A, Mossink MH, Schoester M a kol. (2002). "Strukturální domény proteinů trezoru: role domény coiled coil v sestavě trezoru". Biochem. Biophys. Res. Commun. 291 (3): 535–41. doi:10.1006 / bbrc.2002.6472. PMID 11855821.
Mazzon E, Dugo L, Li JH a kol. (2002). „GPI 6150, inhibitor PARP, snižuje poškození tlustého střeva způsobené kyselinou dinitrobenzensulfonovou u potkanů“. Biochem. Pharmacol. 64 (2): 327–37. doi:10.1016 / S0006-2952 (02) 01075-4. PMID 12123754.
Liu TJ, Lin SY, Chau YP (2002). „Inhibice aktivace poly (ADP-ribóza) polymerázy tlumí smrt nekrotických buněk indukovanou beta-lapachonem v lidských buňkách osteosarkomu“. Toxicol. Appl. Pharmacol. 182 (2): 116–25. doi:10.1006 / taap.2002.9438. PMID 12140175.
Nie Z, Phenix BN, Lum JJ a kol. (2003). „HIV-1 proteáza zpracovává prokaspázu 8 za účelem mitochondriálního uvolňování cytochromu c, štěpení kaspázy a jaderné fragmentace“. Buněčná smrt se liší. 9 (11): 1172–84. doi:10.1038 / sj.cdd.4401094. PMID 12404116.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Dunham A, Matthews LH, Burton J a kol. (2004). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 13“. Příroda. 428 (6982): 522–8. Bibcode:2004 Natur.428..522D. doi:10.1038 / nature02379. PMC 2665288. PMID 15057823.
Liu Y, Snow BE, Kickhoefer VA a kol. (2004). „Vault poly (ADP-ribóza) polymeráza je spojena s savčí telomerázou a je postradatelná pro funkci telomerasy a strukturu trezoru in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 24 (12): 5314–23. doi:10.1128 / MCB.24.12.5314-5323.2004. PMC 419898. PMID 15169895.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102699 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000054509 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10644454-5] Stále IH, Vince P, Cowell JK (březen 2000). „Identifikace nového genu (ADPRTL1) kódujícího potenciální protein Poly (ADP-ribosyl) transferázy“. Genomika. 62 (3): 533–6. doi:10.1006 / geno.1999,6024. PMID 10644454.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PARP4 poly (ADP-ribose) polymerase family, member 4“.

[pmid11855821-7] van Zon, Arend; Mossink Marieke H; Schoester Martijn; Scheffer George L; Scheper Rik J; Sonneveld Pieter; Wiemer Erik A C (březen 2002). "Strukturální domény proteinů trezoru: role domény coiled coil v sestavě trezoru". Biochem. Biophys. Res. Commun. 291 (3): 535–41. doi:10.1006 / bbrc.2002.6472. ISSN 0006-291X. PMID 11855821.

[pmid10477748-8] Kickhoefer, VA; Siva AC; Kedersha N L; Inman EM; Ruland C; Streuli M; Řím L H (září 1999). „Trezorový protein 193 kD, VPARP, je nová poly (ADP-ribóza) polymeráza“. J. Cell Biol. 146 (5): 917–28. doi:10.1083 / jcb.146.5.917. ISSN 0021-9525. PMC 2169495. PMID 10477748.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]