Ortologická MAtrix - Orthologous MAtrix

OMA
Obsah
Popis	ortologie závěr mezi 1000 úplnými genomy.
Kontakt
Laboratoř	ETH Curych
Autoři	Christophe Dessimoz; Adrian Schneider; Adrian Altenhoff; Gaston H. Gonnet
Primární citace	Altenhoff et al.
Datum vydání	2004
Přístup
webová stránka	omabrowser.org
Stáhnout URL	http://omabrowser.org/All/download.html
webová služba URL	wsdl
Smíšený
Uvolnění dat; frekvence	2 vydání ročně

OMA (Ortologická MAtrix) je databáze ortology extrahováno z dostupného úplného genomy.^[1]^[2] Ortologické předpovědi OMA jsou k dispozici v několika formách:

Páry OMA: za dané gen, seznam předpokládaných ortology v jiných druh je poskytován.
Skupiny OMA: sada různých genů druh které jsou všechny ortologický.
Hierarchické skupiny OMA: sada všech genů, které se vyvinuly z jediného genu předků v daném taxonomické rozsah.
Pohled na pár genomu OMA: seznam všech předpokládaných ortology mezi dvěma druh.

Viz také

Reference

^ ^A ^b Altenhoff, Adrian M; Schneider Adrian; Gonnet Gaston H; Dessimoz Christophe (leden 2011). „OMA 2011: odvození ortologie mezi 1000 úplnými genomy“. Nucleic Acids Res. Anglie. 39 (Problém s databází): D289-94. doi:10.1093 / nar / gkq1238. PMC 3013747. PMID 21113020.
^ Altenhoff, Adrian M; Glover, Natasha M; Vlak, Clément-Marie; Kaleb, Klara; Warwick Vesztrocy, Alex; Dylus, David; de Farias, Tarcisio M; Zile, Karina; Stevenson, Charles; Long, Jiao; Redestig, Henning; Gonnet, Gaston H; Dessimoz, Christophe (2018). „Ortologická databáze OMA v roce 2018: získávání evolučních vztahů mezi všemi doménami života prostřednictvím bohatších webových a programových rozhraní“. Výzkum nukleových kyselin. 46 (D1): D477 – D485. doi:10.1093 / nar / gkx1019. ISSN 0305-1048. PMC 5753216. PMID 29106550.

Tento Biologická databáze související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[pmid21113020-1] A ^b Altenhoff, Adrian M; Schneider Adrian; Gonnet Gaston H; Dessimoz Christophe (leden 2011). „OMA 2011: odvození ortologie mezi 1000 úplnými genomy“. Nucleic Acids Res. Anglie. 39 (Problém s databází): D289-94. doi:10.1093 / nar / gkq1238. PMC 3013747. PMID 21113020.

[AltenhoffGlover2018-2] Altenhoff, Adrian M; Glover, Natasha M; Vlak, Clément-Marie; Kaleb, Klara; Warwick Vesztrocy, Alex; Dylus, David; de Farias, Tarcisio M; Zile, Karina; Stevenson, Charles; Long, Jiao; Redestig, Henning; Gonnet, Gaston H; Dessimoz, Christophe (2018). „Ortologická databáze OMA v roce 2018: získávání evolučních vztahů mezi všemi doménami života prostřednictvím bohatších webových a programových rozhraní“. Výzkum nukleových kyselin. 46 (D1): D477 – D485. doi:10.1093 / nar / gkx1019. ISSN 0305-1048. PMC 5753216. PMID 29106550.

[1]

[2]