OriDB - OriDB
 | |
|---|---|
| Obsah | |
| Popis | Počátek replikace DNA databáze. |
| Organismy | Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe |
| Kontakt | |
| Laboratoř | Nieduszynski laboratoř. |
| Primární citace | Siow al. (2012)[1] |
| Datum vydání | 2006, 2012 |
| Přístup | |
| webová stránka | http://cerevisiae.oridb.org, http://pombe.oridb.org |
| Smíšený | |
| Licence | Volný, uvolnit |
OriDB je biologická databáze potvrzených a předpovězených Místa původu replikace DNA v modelových organismech Saccharomyces cerevisiae a Schizosaccharomyces pombe.[1][2]
Databáze původu DNA replikace (OriDB) poskytuje přístup k seřazeným publikovaným souborům dat, které předpovídaly a / nebo potvrdily umístění počátků replikace. Každé potenciální místo původu replikace je uvedeno jako potvrzené, pravděpodobné nebo pochybné v závislosti na úrovni podpůrných dat. U každého webu jsou k dispozici další informace, včetně:
- genomické umístění místa původu;
- the Sekvence DNA;
- grafické zobrazení původního webu, které obsahuje experimentální data;
- publikované studie, které navrhovaly původ;
- odkazy na příslušné původní studie.
Kromě toho existuje grafický prohlížeč, který umožňuje uživatelům vybrat chromozomální oblasti a zobrazit vybrané datové sady. Všechny původní datové sady prezentované v OriDB jsou k dispozici ke stažení.
Viz také
Reference
- ^ A b Siow, CC; Nieduszynska, SR; Müller, CA; Nieduszynski, CA (leden 2012). „OriDB, databáze původu replikace DNA aktualizována a rozšířena“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (Problém s databází): D682-6. doi:10.1093 / nar / gkr1091. PMC 3245157. PMID 22121216.
- ^ Nieduszynski, CA; Hiraga, S; Ak, P; Benham, CJ; Donaldson, AD (leden 2007). „OriDB: databáze původu replikace DNA“. Výzkum nukleových kyselin. 35 (Problém s databází): D40-6. doi:10.1093 / nar / gkl758. PMC 1781122. PMID 17065467.
externí odkazy
 | Tento Biologická databáze související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |