Oligotypizace (taxonomie) - Oligotyping (taxonomy) - Wikipedia

Oligotypizace je diagnostický nebo molekulárně biologické metoda klasifikace organismy krátkými intervaly primárního Sekvence DNA.

„Systémy“ oligotypizace jsou soubory uznaných cílových sekvencí, které identifikují členy kategorií v rámci klasifikace. Klasifikace může být pro účely primární biologické taxonomie, nebo pro funkční klasifikaci.

Klasifikace bakterií

Pro klasifikaci bylo použito oligotypování bakterie,^[1] identifikace genů bakteriální rezistence na antibiotika,^[2] identifikace genetických faktorů u lidských infekčních nemocí,^[3] a provádění testů histokompatibility u dárců / příjemců lidské krve nebo kostní dřeně.

Viz také

Oligotypování (sekvenování)
Taxonomie (biologie)
Bakteriální taxonomie

Reference

^ Roring, S; Brittain, D; Bunschoten, A.E .; Hughes, M. S; Skuce, R. A; van Embden, J. D. A; Neill, S. D (15. března 1998). „Spacerová oligotypizace izolátů Mycobacterium bovis ve srovnání s typizací polymorfismem délky restrikčních fragmentů pomocí sond PGRS, DR a IS6110“. Veterinární mikrobiologie. 61 (1–2): 111–120. doi:10.1016 / S0378-1135 (98) 00178-3.
^ Mabilat, C .; Courvalin, P. (1. listopadu 1990). "Vývoj" oligotypizace "pro charakterizaci a molekulární epidemiologii TEM beta-laktamáz u členů čeledi Enterobacteriaceae". Antimikrobiální látky a chemoterapie. 34 (11): 2210–2216. doi:10.1128 / AAC.34.11.2210. ISSN 0066-4804. PMC 172024. PMID 2073111.
^ Rani, Rajni; Fernandez-Vina, M. A .; Zaheer, S. A .; Beena, K. R .; Stastny, Peter (1. července 1993). "Studie alel HLA třídy II pomocí PCR oligotypizace u pacientů s leprou ze severní Indie". Tkáňové antigeny. 42 (1): 133–137. doi:10.1111 / j.1399-0039.1993.tb02179.x. ISSN 1399-0039. PMID 8284786.

Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Roring, S; Brittain, D; Bunschoten, A.E .; Hughes, M. S; Skuce, R. A; van Embden, J. D. A; Neill, S. D (15. března 1998). „Spacerová oligotypizace izolátů Mycobacterium bovis ve srovnání s typizací polymorfismem délky restrikčních fragmentů pomocí sond PGRS, DR a IS6110“. Veterinární mikrobiologie. 61 (1–2): 111–120. doi:10.1016 / S0378-1135 (98) 00178-3.

[2] Mabilat, C .; Courvalin, P. (1. listopadu 1990). "Vývoj" oligotypizace "pro charakterizaci a molekulární epidemiologii TEM beta-laktamáz u členů čeledi Enterobacteriaceae". Antimikrobiální látky a chemoterapie. 34 (11): 2210–2216. doi:10.1128 / AAC.34.11.2210. ISSN 0066-4804. PMC 172024. PMID 2073111.

[3] Rani, Rajni; Fernandez-Vina, M. A .; Zaheer, S. A .; Beena, K. R .; Stastny, Peter (1. července 1993). "Studie alel HLA třídy II pomocí PCR oligotypizace u pacientů s leprou ze severní Indie". Tkáňové antigeny. 42 (1): 133–137. doi:10.1111 / j.1399-0039.1993.tb02179.x. ISSN 1399-0039. PMID 8284786.

[1]

[2]

[3]