OTUB2 - OTUB2

OTUB2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1TFF, 4FJV
Identifikátory
Aliasy	OTUB2, C14orf137, OTB2, OTU2, OTU deubiquitináza, vazba ubikvitin aldehydu 2
Externí ID	OMIM: 608338 MGI: 1915399 HomoloGene: 57056 Genové karty: OTUB2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	94,048,930 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	103,406,350 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita; • aktivita peptidázy; • aktivita peptidázy cysteinového typu; • NEDD8-specifická proteázová aktivita; • ubikvitinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• deubikvitinace bílkovin; • deubikvitinace spojená s proteinem K63; • deubikvitinace spojená s proteinem K48; • proteolýza; • deubikvitinace spojená s proteinem K11;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	78990
	68149
	ENSG00000089723; ENSG00000277276
	ENSMUSG00000021203
	Q96DC9
	Q9CQX0
	NM_023112
	NM_001177841; NM_026580
	NP_075601
	NP_001171312; NP_080856
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubikvitin thioesteráza OTUB2 je enzym že u lidí je kódován OTUB2 gen.^[5]^[6]

Otubainové jsou deubikvitinační cysteinové proteázy (DUB; viz MIM 602519), které patří do nadrodiny proteinu ovariálního nádoru (OTU). Stejně jako ostatní DUB štěpí otubainy proteiny přesně na vazbě ubikvitin (UB; viz MIM 191339) -protein.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000277276 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000089723, ENSG00000277276 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021203 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Balakirev MY, Tcherniuk SO, Jaquinod M, Chroboczek J (duben 2003). „Otubains: nová rodina cysteinových proteáz v ubikvitinové dráze“. EMBO Rep. 4 (5): 517–22. doi:10.1038 / sj.embor.embor824. PMC 1319179. PMID 12704427.
^ ^A ^b „Entrez Gene: OTUB2 OTU doména, ubikvitin aldehydová vazba 2“.

Další čtení

Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Nanao MH, Tcherniuk SO, Chroboczek J, et al. (2005). "Krystalová struktura lidského otubainu 2". EMBO Rep. 5 (8): 783–8. doi:10.1038 / sj.embor.7400201. PMC 1299112. PMID 15258613.
Namciu SJ, Friedman RD, Marsden MD a kol. (2004). "Sekvenční organizace a oblasti připojení matrice genu klastru lidského inhibitoru serinové proteázy na 14q32.1". Mamm. Genom. 15 (3): 162–78. doi:10.1007 / s00335-003-2311-r. PMID 15014966.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Heilig R, Eckenberg R, Petit JL a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 14“. Příroda. 421 (6923): 601–7. doi:10.1038 / nature01348. PMID 12508121.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000277276 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000089723, ENSG00000277276 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021203 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12704427-5] Balakirev MY, Tcherniuk SO, Jaquinod M, Chroboczek J (duben 2003). „Otubains: nová rodina cysteinových proteáz v ubikvitinové dráze“. EMBO Rep. 4 (5): 517–22. doi:10.1038 / sj.embor.embor824. PMC 1319179. PMID 12704427.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: OTUB2 OTU doména, ubikvitin aldehydová vazba 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]