OLE RNA - OLE RNA

Ozdobná velká extremofilní RNA
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence OLE
Identifikátory
Symbol	OLE
Rfam	RF01071
Další údaje
RNA typ	Gen
Domény	Bakterie
TAK	SO: 0001263
PDB struktur	PDBe

OLE RNA (Ozdobná velká extremofilní RNA) je konzervovaný RNA struktura přítomná v určitých bakterie.^[1] Průměrná RNA je zhruba 610 nukleotidy v délce. Jediné známé RNA, které jsou delší než OLE RNA, jsou ribozymy tak jako intron skupiny II a ribozomální RNA. Výjimečná délka a vysoce konzervovaná struktura OLE RNA podnítila hypotézu, že OLE RNA může být ribozymem nebo jinak provádět složitý biochemický úkol.

OLE RNA se nacházejí převážně v pořadí Clostridiales, ale jiné druhy Firmicutes obsahují také OLE RNA. Organismy obsahující OLE RNA jsou převážně extremophiles a anaeroby.

OLE RNA se přepisují jako RNA a experimentuje se s nimi Bacillus halodurans ukázat, že je přepsán do a mRNA s 10 dalšími geny. Sousední geny jsou konzervovány v blízkosti OLE RNA u většiny druhů, které ji obsahují, ale v Desulfitobacterium hafniense jsou umístěny jinde na internetu chromozóm. OLE RNA jsou zpracovány z většího transkriptu na kratší RNA, která zhruba odpovídá konzervované ~ 610-nukleotidové struktuře. Geny kódující proteinovou třídu neznámé funkce jsou typicky lokalizovány bezprostředně za OLE RNA a přítomnost této proteinové třídy koreluje u druhů s přítomností OLE RNA. Tato korelace naznačuje možnou funkční asociaci mezi RNA a proteinem.

Reference

externí odkazy

• Stránka pro OLE_RNA v Rfam

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.