Rodina NhaE - NhaE family - Wikipedia

The Rodina NhaE (TC # 2.A.111 ) patří do Nadrodina iontových transportérů (IT).[1][2][3] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny NhaE lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.

Rodina NhaH se skládá z proteinů z gramnegativních bakterií (např. Leptospira, Azotobacter, Neisseria, Ralstonia, Chlorobium a Rhizobiální druh). Proteiny mají asi 480 aas s 12-14 domnělými TMS.

Otevřený čtecí rámec (ORF) z genomu Neisseria meningitidis zobrazující podobnost s typem Na na NhaE+/ H+ antiporters byl vyjádřen v E-coli a charakterizované schopností přenosu sodíku. The N. meningitidis antiporter (NmNhaE) byl schopen doplnit E-coli kmen bez Na+/ H+ antiporters (KNabc) s ohledem na schopnost růst v přítomnosti vysokých koncentrací NaCl nebo LiCl. Testy iontového transportu v evercovaných vezikulích připravených z kmene KNabc exprimujících NmNhaE z plazmidu potvrdily jeho schopnost translokovat Na+ a Li+.[4]

Zobecněná reakce katalyzovaná NhaE je,

Na+ nebo Li+ (v) + H. (in) + H+ (ven) ⇌ Na+ nebo Li+ (out) + H+ (v)

Viz také

Reference

  1. ^ Prakash, Shraddha; Cooper, Garret; Singhi, Soumya; Saier, Milton H. (2003-12-03). „Nadrodina iontových transportérů“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrány. 1618 (1): 79–92. doi:10.1016 / j.bbamem.2003.10.010. ISSN  0006-3002. PMID  14643936.
  2. ^ Lolkema, Juke S .; Slotboom, Dirk Jan (11.04.2003). „Klasifikace 29 rodin sekundárních transportních proteinů do jedné strukturní třídy pomocí analýzy profilu hydropatie“ (PDF). Journal of Molecular Biology. 327 (5): 901–909. doi:10.1016 / s0022-2836 (03) 00214-6. ISSN  0022-2836. PMID  12662917.
  3. ^ Rabus, R .; Jack, D. L .; Kelly, D. J .; Saier, M. H. (01.12.1999). „TRAP transportéry: prastará rodina sekundárních aktivních transportérů závislých na extracytoplazmatickém rozpustném receptoru“. Mikrobiologie. 145 (Pt 12) (12): 3431–3445. doi:10.1099/00221287-145-12-3431. ISSN  1350-0872. PMID  10627041.
  4. ^ Sousa, Pedro M. F .; Videira, Marco A. M .; Vorburger, Thomas; Silva, Sara T. N .; Moir, James W .; Steuber, Julia; Melo, Ana M. P. (01.03.2013). „Nový antiporter Na (+) / H (+) typu NhaE patogenní bakterie Neisseria meningitidis.“ Archiv mikrobiologie. 195 (3): 211–217. doi:10.1007 / s00203-012-0856-4. ISSN  1432-072X. PMID  23208205. S2CID  1704372.

Do tato úprava, tento článek používá obsah z „2.A.111 Rodina Na + / H + Antiporter-E (NhaE)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.