Neuronální protein PAS domény 4 - Neuronal PAS domain protein 4

NPAS4
Identifikátory
Aliasy	NPAS4Le-PAS, NXF, PASD10, bHLHe79, protein neuronální PAS domény 4
Externí ID	OMIM: 608554 MGI: 2664186 HomoloGene: 15333 Genové karty: NPAS4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	66,426,707 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	4,990,316 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• postsynapse; • komplex regulátoru transkripce; • buněčné jádro;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • buněčná odpověď na kortikosteronový stimul; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • vývoj nervového systému; • učení se; • krátkodobá paměť; • dlouhodobá paměť; • diferenciace buněk; • regulace synaptického přenosu, GABAergic; • chování sociálního organismu; • regulace synaptické plasticity; • excitační postsynaptický potenciál; • inhibiční postsynaptický potenciál; • inhibiční synapse shromáždění; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	266743
	225872
	ENSG00000174576
	ENSMUSG00000045903
	Q8IUM7
	Q8BGD7
	NM_178864; NM_001318804
	NM_153553
	NP_001305733; NP_849195
	NP_705781
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Neuronální protein PAS domény 4 je protein že u lidí je kódován NPAS4 gen.^[5] Gen NPAS4 je okamžitý časný gen závislý na neuronální aktivitě, který byl identifikován jako transkripční faktor. Protein reguluje transkripci genů, které řídí vývoj inhibičního synapsí, synaptickou plasticitu a naposledy také chování^[6].

Funkce

NXF je členem základní třídy transkripčních regulátorů helix-loop-helix-PER (MIM 602260) -ARNT (MIM 126110) -SIM (viz SIM2; MIM 600892) (bHLH-PAS), které se účastní širokého rozsahu fyziologických a vývojových událostí (Ooe et al., 2004 [PubMed 14701734]). [poskytl OMIM, březen 2008].

Npas4 byl zobrazen uživatelem Dr. Brenda Bloodgood hrát kritickou roli při regulaci plasticity inhibičních neuronů. Zjistila, že Npas4 pomáhá regulovat plasticitu tím, že organizuje redistribuci synaptických vstupů a předpíná je směrem k dendritům nad těly neuronových buněk, což zvyšuje dendritickou plasticitu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000174576 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045903 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: Neuronální PAS doménový protein 4“. Citováno 2017-10-15.
^ Funahashi Y, Ariza A, Emi R, Xu Y, Shan W, Suzuki K, Kozawa K, Ahammad RU, Wu M, Takano T, Yura Y, Kuroda K, Nagai T, Amano M, Yamada K, Kaibuchi K (2019) . „Fosforylace Npas4 pomocí MAPK reguluje expresi a chování genů souvisejících s odměnami“. Zprávy buněk. 29 (10): 3235–3252.e9. doi:10.1016 / j.celrep.2019.10.116. PMID 31801086.
^ Bloodgood, Brenda L .; Sharma, Nikhil; Browne, Heidi Adlman; Trepman, Alissa Z .; Greenberg, Michael E. (7.7.2013). „Transkripční faktor závislý na aktivitě NPAS4 reguluje doménově specifickou inhibici“. Příroda. 503 (7474): 121–125. doi:10.1038 / příroda12743. ISSN 1476-4687. PMC 4169177. PMID 24201284.

Další čtení

Ooe N, Saito K, Mikami N, Nakatuka I, Kaneko H (2004). „Identifikace nového základního faktoru helix-loop-helix-PAS, NXF, odhaluje kompetitivní a pozitivní regulační roli Sim2 v expresi genu dendriticko-cytoskeletonového modulátoru drebrinového genu“. Mol. Buňka. Biol. 24 (2): 608–16. doi:10.1128 / mcb.24.2.608-616.2004. PMC 343817. PMID 14701734.
Bersten DC, Bruning JB, Peet DJ, Whitelaw ML (2014). "Lidské varianty v komplexu transkripčních faktorů neuronální základní helix-smyčka-helix / bHLH / PAS" narušují funkci NPAS4 / ARNT2 ". PLOS ONE. 9 (1): e85768. doi:10.1371 / journal.pone.0085768. PMC 3894988. PMID 24465693.
Klaric TS, Thomas PQ, Dottori M, Leong WK, Koblar SA, Lewis MD (2014). „Snížení exprese Npas4 vede ke zpožděné neurální diferenciaci myších embryonálních kmenových buněk“. Stem Cell Res Ther. 5 (3): 64. doi:10.1186 / scrt453. PMC 4076635. PMID 24887558.
Funahashi Y, Ariza A, Emi R, Xu Y, Shan W, Suzuki K, Kozawa K, Ahammad RU, Wu M, Takano T, Yura Y, Kuroda K, Nagai T, Amano M, Yamada K, Kaibuchi K (2019) . „Fosforylace Npas4 pomocí MAPK reguluje expresi a chování genů souvisejících s odměnami“. Zprávy buněk. 29 (10): 3235–3252.e9. doi:10.1016 / j.celrep.2019.10.116. PMID 31801086.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000174576 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045903 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: Neuronální PAS doménový protein 4“. Citováno 2017-10-15.

[6] Funahashi Y, Ariza A, Emi R, Xu Y, Shan W, Suzuki K, Kozawa K, Ahammad RU, Wu M, Takano T, Yura Y, Kuroda K, Nagai T, Amano M, Yamada K, Kaibuchi K (2019) . „Fosforylace Npas4 pomocí MAPK reguluje expresi a chování genů souvisejících s odměnami“. Zprávy buněk. 29 (10): 3235–3252.e9. doi:10.1016 / j.celrep.2019.10.116. PMID 31801086.

[7] Bloodgood, Brenda L .; Sharma, Nikhil; Browne, Heidi Adlman; Trepman, Alissa Z .; Greenberg, Michael E. (7.7.2013). „Transkripční faktor závislý na aktivitě NPAS4 reguluje doménově specifickou inhibici“. Příroda. 503 (7474): 121–125. doi:10.1038 / příroda12743. ISSN 1476-4687. PMC 4169177. PMID 24201284.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]