NeuGRID - NeuGRID
 | Tento článek obsahuje a seznam doporučení, související čtení nebo externí odkazy, ale jeho zdroje zůstávají nejasné, protože mu chybí vložené citace. (únor 2014) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
 Logo NeuGRID | |
| URL | neugrid4you |
|---|---|
| Aktuální stav | Aktivní |
neuGRID je webový portál zaměřený na (i) pomoc neurovědy dělat vysokou propustnost zobrazování výzkum,[1] a (ii) poskytnout klinickým neurologům automatizované diagnostické zobrazovací markery neurodegenerativních onemocnění pro diagnostiku jednotlivých pacientů. Uživatelsky přívětivé prostředí neuGRIDu je přizpůsobeno řadě uživatelů od studentů po starší neurovědy pracující v oblastech Alzheimerova choroba, psychiatrické nemoci, a nemoci bílé hmoty. NeuGRID si klade za cíl stát se rozšířeným zdrojem pro analýzy zobrazování mozku.[2]
Proces
Prostřednictvím jediného virtuálního webového portálu Science Gateway se uživatelé přihlašují a přistupují k „virtuální“ zobrazovací laboratoři.[3] Zde mohou uživatelé nahrávat, používat a sdílet algoritmy pro analýzu zobrazování mozku,[4] mít přístup k velkým datovým sadám pro neuroimaging a provádět výpočtově náročné analýzy po celou dobu se specializovanou podporou a tréninkem. Díky distribuovaným službám a mřížka /mrak výpočetní zdroje, analýzy s neuGRID jsou mnohem rychlejší než laboratorní analýzy tradičního stylu. NeuGRID proof-of-concept byl proveden v roce 2009, kdy došlo k Alzheimerově chorobě biomarker (3D kortikální tloušťka s Freesurferem a CIVET) byla extrahována z 6 500 MR skenů za 2 týdny versus 5 let, které by byly provedeny v tradičním prostředí.
Dějiny
NeuGRID byl poprvé financován Evropskou komisí DG INFSO v rámci EU 7. rámcový program od roku 2008 do roku 2011. Zde byla vyvinuta infrastruktura hardwaru a middlewaru. Druhá vlna byla v roce 2011 financována Evropská komise, nyní DG CONNECT, v rámci projektu neuGRID pro vás (N4U)s hlavním cílem rozšířit uživatelské služby o intuitivnější a grafičtější rozhraní. N4U skončila v dubnu 2015.
Konsorcium
Počáteční konsorcium neuGRID zahrnovalo 8 evropských partnerů z Itálie, Francie, Velké Británie, Nizozemska, Švédska, Španělska a Švýcarska. N4U zahrnovalo 9 evropských partnerů (z toho 6 již v neuGRID) a 2 severoameričany. Mezinárodní partneři byli zapojeni díky podpůrné akci znovu financované DG INFSO (outGRID, http://www.outgrid.eu ). Koordinátorem všech tří projektů je Giovanni B Frisoni, neurolog z IRCCS Fatebenefratelli, Národního centra pro Alzheimerovu chorobu v italské Brescii.
Poznámky
- ^ Barkhof, Frederik (2012). „Lepší využití našich výzkumných údajů o MRI mozku“. Evropská radiologie. 22 (7): 1395–6. doi:10.1007 / s00330-012-2408-3. PMC 3366293. PMID 22427183.
- ^ Redolfi, Alberto; McClatchey, Richard; Anjum, Ashiq; Zijdenbos, Alex; Manset, David; Barkhof, Frederik; Spenger, Christian; Legré, Yannik; Wahlund, Lars-Olof; Di San Pietro, Chiara Barattieri; Frisoni, Giovanni B (2009). "Gridové infrastruktury pro výpočetní neurovědu: příklad NeuGRID". Budoucí neurologie. 4 (6): 703–22. doi:10,2217 / fnl.09,53.
- ^ Frisoni, Giovanni B .; Redolfi, Alberto; Manset, David; Rousseau, Marc-Étienne; Toga, Arthur; Evans, Alan C. (2011). "Virtuální zobrazovací laboratoře pro objevování markerů u neurodegenerativních onemocnění". Recenze přírody Neurologie. 7 (8): 429–38. doi:10.1038 / nrneurol.2011.99. PMID 21727938.
- ^ Anjum, Ashiq; Bloodsworth, Peter; Habib, Irfan; Lansdale, Tom; McClatchey, Richard; Mehmood, Yasir; Konsorcium neuGRID (2009). "Opakovaně použitelné služby z projektu neuGRID pro aplikace zdraví založené na mřížce". Studie ve zdravotnických technologiích a informatice. 147 (978): 283–8. arXiv:1202.5516. Bibcode:2012arXiv1202.5516A. doi:10.3233/978-1-60750-027-8-283. PMID 19593068.
Další publikace
Neurovědecké studie, kde byl neuGRID použit jako zdroj
- Redolfi, A; Bosco, P; Manset, D; Frisoni, GB; Konsorcium Neugrid (2013). „Vyšetřování mozku a konceptualizace mozku“. Funkční neurologie. 28 (3): 175–90. PMC 3812741. PMID 24139654.
- Cover, Keith S .; Van Schijndel, Ronald A .; Van Dijk, Bob W .; Redolfi, Alberto; Knol, Dirk L .; Frisoni, Giovanni B .; Barkhof, Frederik; Vrenken, Hugo; NeuGRID; Iniciativa Neuroimaging Alzheimer's Disease (2011). „Posouzení reprodukovatelnosti opatření atrofie mozku SienaX a Siena pomocí skenů MPN-RAGE MRI ADNI back-to-back“. Psychiatrický výzkum: Neuroimaging. 193 (3): 182–90. doi:10.1016 / j.pscychresns.2011.02.012. PMID 21764565.
- Frisoni, Giovanni B .; Fox, Nick C .; Jack Jr, Clifford R .; Scheltens, Philip; Thompson, Paul M. (2010). „Klinické využití strukturální MRI u Alzheimerovy choroby“. Recenze přírody Neurologie. 6 (2): 67–77. doi:10.1038 / nrneurol.2009.215. PMC 2938772. PMID 20139996.