Chemoreceptor hlístice - Nematode chemoreceptor

Nematodový chemoreceptor, Sra
Identifikátory
SymbolSra_chemorcpt
PfamPF02117
InterProIPR000344

Chemoreceptory hlístic jsou chemoreceptory z hlístice.

Zvířata rozpoznávají širokou škálu chemikálií pomocí svých smyslů chuti a čichu. Hlístice Caenorhabditis elegans má pouze 14 typů chemosenzorický neuron, přesto je schopen reagovat na desítky chemikálií, protože každý neuron detekuje několik podnětů. Více než 40 vysoce odlišných transmembránové proteiny které by mohly přispět k této funkční rozmanitosti, byly popsány.[1] Většina kandidátských genů receptorů je v klastrech podobných genů; Zdá se, že 11 z nich je exprimováno v malých podskupinách chemosenzorických neuronů. Jeden typ neuronu může potenciálně exprimovat alespoň 4 různé geny receptoru.[1] Některé z nich mohou kódovat receptory pro ve vodě rozpustné atraktanty, repelenty a feromony, které jsou odlišnými členy Receptor spojený s G-proteinem rodina.[1] Sekvence rodiny Srů C. elegans receptory podobné proteiny obsahují 6-7 hydrofobních, domnělých transmembránových oblastí. Ty lze odlišit od ostatních proteinů 7TM (zejména těch, o nichž je známo, že spojují G-proteiny) podle jejich vlastních charakteristických podpisů TM.

Bylo identifikováno více než 1300 potenciálních genů chemoreceptorů C. elegans, které mají obecně předponu sr pro hadí receptor. Mezi superrodiny receptorů patří Sra (Sra, Srb, Srab, Sre), Str (Srh, Str, Sri, Srd, Srj, Srm, Srn) a Srg (Srx, Srt, Srg, Sru, Srv, Srxa), stejně jako rodiny Srw, Srz, Srbc, Srsx a Srr.[1][2][3] Mnoho z těchto proteinů má homology Caenorhabditis briggsae.

Tyto receptory jsou vzdáleně příbuzné Receptory podobné rhodopsinu.[4]

Reference

  1. ^ A b C d Troemel ER, Chou JH, Dwyer ND, Colbert HA, Bargmann CI (1995). „Odlišných sedm transmembránových receptorů je kandidátem chemosenzorických receptorů v C. elegans.“ Buňka. 83 (2): 207–218. doi:10.1016/0092-8674(95)90162-0. PMID  7585938.
  2. ^ Robertson, HM; Thomas, JH (6. ledna 2006). „Domnělé rodiny chemoreceptorů C. elegans“. WormBook: 1–12. doi:10.1895 / wormbook.1.66.1. PMC  4781013. PMID  18050473.
  3. ^ Chen, N; Pai, S; Zhao, Z; Mah, A; Newbury, R; Johnsen, RC; Altun, Z; Moerman, DG; Baillie, DL; Stein, LD (4. ledna 2005). "Identifikace rodiny chemosenzorických genů hlístic". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (1): 146–51. Bibcode:2005PNAS..102..146C. doi:10.1073 / pnas.0408307102. PMC  539308. PMID  15618405.
  4. ^ Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (září 2011). „Nezávislé HHsearch, Needleman - založené na Wunschových analýzách a analýzách motivů odhalily celkovou hierarchii většiny rodin receptorů spřažených s G proteinem“. Molekulární biologie a evoluce. 28 (9): 2471–80. doi:10,1093 / molbev / msr061. PMID  21402729.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000344