NUDT21 - NUDT21
Podjednotka faktoru štěpnosti a polyadenylační specificity 5 (CPSF5) je enzym že u lidí je kódován NUDT21 gen.[4][5] Patří k Rodina Nudix hydroláz.
Protein kódovaný tímto genem je jednou podjednotkou faktor štěpení Pro štěpení 3 'RNA a polyadenylační zpracování je vyžadován im komplex.[6] Interakce proteinu s RNA je jedním z prvních kroků při sestavování komplexu zpracování na 3 'konci a usnadňuje nábor dalších faktorů zpracování. Tento gen kóduje 25kD podjednotku proteinového komplexu, který je složen ze čtyř polypeptidů.[5]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167005 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Ruegsegger U, Blank D, Keller W (červenec 1998). „Faktor štěpení lidského pre-mRNA Im souvisí se spliceozomálními SR proteiny a může být rekonstituován in vitro z rekombinantních podjednotek“. Mol Cell. 1 (2): 243–53. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80025-8. PMID 9659921.
- ^ A b "Entrezův gen: motiv typu NUDT21 nudix (nukleosidový difosfát vázaný na skupinu X) 21".
- ^ Hardy, J. G .; Norbury, C. J. (15. srpna 2016). „Faktor štěpení Im (CFIm) jako regulátor alternativní polyadenylace“. Transakce s biochemickou společností. 44 (4): 1051–1057. doi:10.1042 / BST20160078. PMID 27528751.
Další čtení
- Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (1996). „Čištění a charakterizace lidského štěpného faktoru Im zapojeného do 3 'koncového zpracování prekurzorů messengerové RNA“. J. Biol. Chem. 271 (11): 6107–13. doi:10.1074 / jbc.271.11.6107. PMID 8626397.
- de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W a kol. (2000). „Lidský pre-mRNA štěpný faktor IIm obsahuje homology kvasinkových proteinů a přemosťuje další dva štěpné faktory“. EMBO J.. 19 (21): 5895–904. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5895. PMC 305781. PMID 11060040.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Kim H, Lee Y (2002). "Interakce poly (A) polymerázy s 25-kDa podjednotkou štěpného faktoru I". Biochem. Biophys. Res. Commun. 289 (2): 513–8. doi:10.1006 / bbrc.2001.5992. PMID 11716503.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Awasthi S, Alwine JC (2003). "Sdružení polyadenylačního štěpného faktoru I s U1 snRNP". RNA. 9 (11): 1400–9. doi:10,1261 / rna.5104603. PMC 1287061. PMID 14561889.
- Brown KM, GM Gilmartin (2004). "Mechanismus pro regulaci zpracování pre-mRNA 3 'lidským štěpným faktorem Im". Mol. Buňka. 12 (6): 1467–76. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00453-2. PMID 14690600.
- Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
- Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S a kol. (2005). „Zřetelné motivy sekvence v podjednotce 68 kDa štěpného faktoru Im zprostředkovávají vazbu RNA, interakce protein-protein a subcelulární lokalizaci“ (PDF). J. Biol. Chem. 279 (34): 35788–97. doi:10,1074 / jbc.M403927200. PMID 15169763. S2CID 39752996.
- Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |