NUDT15 - NUDT15

NUDT15
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5BON
Identifikátory
Aliasy	NUDT15, MTH2, NUDT15D, nudix hydroláza 15.
Externí ID	OMIM: 615792 MGI: 2443366 HomoloGene: 10109 Genové karty: NUDT15
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	48,047,221 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	73,548,242 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita 8-oxo-7,8-dihydroguanosin trifosfát pyrofosfatázy; • aktivita hydrolázy; • vazba kovových iontů; • Aktivita 8-oxo-7,8-dihydrodeoxyguanosin trifosfát pyrofosfatázy; • aktivita nukleosid-difosfatázy; • aktivita nukleotid difosfatázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita NADH pyrofosfatázy; • aktivita nukleosid-trifosfát-difosfatázy;
Buněčná složka	• cytosol;
Biologický proces	• katabolický proces s malou molekulou obsahující nukleobázi; • katabolický proces dGTP; • GO: 0007067 mitotický buněčný cyklus; • purinový nukleotidový katabolický proces; • Ochrana DNA; • exogenní katabolický proces léčiva; • regulace katabolického procesu proteinu proteinu; • nukleosid fosfát katabolický proces; • reakce na reaktivní formy kyslíku; • purinový deoxyribonukleosid trifosfát katabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55270
	214254
	ENSG00000136159
	ENSMUSG00000033405
	Q9NV35
	Q8BG93
	NM_018283; NM_001304745
	NM_172527; NM_001360484
	NP_001291674; NP_060753
	NP_766115; NP_001347413
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Nudix hydroláza 15 je protein že u lidí je kódováno NUDT15 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje enzym, který patří do nadrodiny Nudix hydrolázy. Členové této nadrodiny katalyzují hydrolýzu nukleosiddifosfátů, včetně substrátů, jako je 8-oxo-dGTP, které jsou výsledkem oxidačního poškození a mohou během replikace DNA vyvolat chybné párování bází a způsobit transverze. Kódovaný enzym je negativní regulátor aktivace a toxicity thiopurinu. Mutace v tomto genu vedou ke špatnému metabolismu thiopurinů a jsou spojeny s časnou leukopenií vyvolanou thiopurinem. Bylo identifikováno více pseudogenů tohoto genu.

Varianty zárodečné linie NUDT15 (např. Missense SNP: rs116855232, indukující R139C) byly spojeny s klinickým použitím thiopurinů (např. Merkaptopurinu) v akutní lymfoblastická leukémie^[6]^[7] stejně jako zánětlivá onemocnění střev, aby nedošlo k leukopenii vyvolané thiopurinem.^[8]^[9] Tyto varianty také vykazují etnickou specifičnost (např. Varianta alely rs116855232 je vysoká u východoasijských a hispánských obyvatel, ale nízká u bělochů a Afričanů). Bylo také zjištěno, že vzácné funkční varianty, dokonce i singletony v tomto genu, mají vztah k myelotoxicitě vyvolané thiopurinem,^[10] k určení počáteční dávky pomocí thiopurinu by měl být proveden návrh celého genového screeningu.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136159 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033405 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: Nudix hydrolase 15“.
^ Moriyama T, Nishii R, Perez-Andreu V, Yang W, Klussmann FA, Zhao X a kol. (Duben 2016). „NUDT15 polymorfismy mění metabolismus thiopurinu a hematopoetickou toxicitu“. Genetika přírody. 48 (4): 367–73. doi:10,1038 / ng.3508. PMC 5029084. PMID 26878724.
^ Yang JJ, Landier W, Yang W, Liu C, Hageman L, Cheng C a kol. (Duben 2015). „Zděděná varianta NUDT15 je genetický determinant intolerance merkaptopurinu u dětí s akutní lymfoblastickou leukémií.“. Journal of Clinical Oncology. 33 (11): 1235–42. doi:10.1200 / JCO.2014.59.4671. PMC 4375304. PMID 25624441.
^ Yang SK, Hong M, Baek J, Choi H, Zhao W, Jung Y a kol. (Září 2014). „Běžná varianta missense u NUDT15 uděluje náchylnost k leukopenii vyvolané thiopurinem“. Genetika přírody. 46 (9): 1017–20. doi:10,1038 / ng.3060. PMC 4999337. PMID 25108385.
^ Yin D, Xia X, Zhang J, Zhang S, Liao F, Zhang G a kol. (Únor 2017). „Dopad polymorfismů NUDT15 na myelotoxicitu vyvolanou thiopuriny a toleranční dávku thiopurinů“. Cílový cíl. 8 (8): 13575–13585. doi:10.18632 / oncotarget.14594. PMC 5355121. PMID 28088792.
^ Moriyama, T; Yang, YL; Nishii, R; Ariffin, H; Liu, C; Lin, TN; Yang, W; Lin, DT; Yu, CH; Kham, S; Pui, CH; Evans, WE; Jeha, S; Relling, MV; Yeoh, AE; Yang, JJ (28. června 2017). "Nové varianty v NUDT15 a intolerance thiopurinu u dětí s akutní lymfoblastickou leukémií různého původu “. Krev. 130 (10): 1209–1212. doi:10.1182 / krev-2017-05-782383. PMC 5606007. PMID 28659275.

Další čtení

Yu Y, Cai JP, Tu B, Wu L, Zhao Y, Liu X a kol. (Červenec 2009). „Jaderný antigen proliferujících buněk je chráněn před degradací vytvořením komplexu s MutT Homolog2“. The Journal of Biological Chemistry. 284 (29): 19310–20. doi:10.1074 / jbc.M109.015289. PMC 2740556. PMID 19419956.
Hori M, Satou K, Harashima H, Kamiya H (květen 2010). „Potlačení mutageneze 8-hydroxy-2'-deoxyguanosin-5'-trifosfátem (7,8-dihydro-8-oxo-2'-deoxyguanosin-5'-trifosfát) lidským MTH1, MTH2 a NUDT5." Radikální biologie a medicína zdarma. 48 (9): 1197–201. doi:10.1016 / j.freeradbiomed.2010.02.002. hdl:2115/43020. PMID 20144704.
Tanaka Y, Kato M, Hasegawa D, Urayama KY, Nakadate H, Kondoh K a kol. (Říjen 2015). „Citlivost na toxicitu 6-MP způsobená variantou NUDT15 u japonských dětí s akutní lymfoblastickou leukémií“. British Journal of Hematology. 171 (1): 109–15. doi:10.1111 / bjh.13518. PMID 26033531.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9NV35 (Nukleotid trifosfát difosfatáza NUDT15) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136159 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033405 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: Nudix hydrolase 15“.

[6] Moriyama T, Nishii R, Perez-Andreu V, Yang W, Klussmann FA, Zhao X a kol. (Duben 2016). „NUDT15 polymorfismy mění metabolismus thiopurinu a hematopoetickou toxicitu“. Genetika přírody. 48 (4): 367–73. doi:10,1038 / ng.3508. PMC 5029084. PMID 26878724.

[7] Yang JJ, Landier W, Yang W, Liu C, Hageman L, Cheng C a kol. (Duben 2015). „Zděděná varianta NUDT15 je genetický determinant intolerance merkaptopurinu u dětí s akutní lymfoblastickou leukémií.“. Journal of Clinical Oncology. 33 (11): 1235–42. doi:10.1200 / JCO.2014.59.4671. PMC 4375304. PMID 25624441.

[8] Yang SK, Hong M, Baek J, Choi H, Zhao W, Jung Y a kol. (Září 2014). „Běžná varianta missense u NUDT15 uděluje náchylnost k leukopenii vyvolané thiopurinem“. Genetika přírody. 46 (9): 1017–20. doi:10,1038 / ng.3060. PMC 4999337. PMID 25108385.

[9] Yin D, Xia X, Zhang J, Zhang S, Liao F, Zhang G a kol. (Únor 2017). „Dopad polymorfismů NUDT15 na myelotoxicitu vyvolanou thiopuriny a toleranční dávku thiopurinů“. Cílový cíl. 8 (8): 13575–13585. doi:10.18632 / oncotarget.14594. PMC 5355121. PMID 28088792.

[10] Moriyama, T; Yang, YL; Nishii, R; Ariffin, H; Liu, C; Lin, TN; Yang, W; Lin, DT; Yu, CH; Kham, S; Pui, CH; Evans, WE; Jeha, S; Relling, MV; Yeoh, AE; Yang, JJ (28. června 2017). "Nové varianty v NUDT15 a intolerance thiopurinu u dětí s akutní lymfoblastickou leukémií různého původu “. Krev. 130 (10): 1209–1212. doi:10.1182 / krev-2017-05-782383. PMC 5606007. PMID 28659275.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]