NEIL2 - NEIL2

NEIL2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1VZP
Identifikátory
Aliasy	NEIL2, NEH2, NEI2, nei jako DNA glykosyláza 2
Externí ID	OMIM: 608933 MGI: 2686058 HomoloGene: 17032 Genové karty: NEIL2
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	63,193,856 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba mikrotubulů; • vazba iontů zinku; • aktivita hydrolázy, hydrolýza N-glykosylových sloučenin; • vazba kovových iontů; • aktivita hydrolázy, působící na glykosylové vazby; • poškozená vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • katalytická aktivita; • aktivita lyázy; • vazba nukleové kyseliny; • Aktivita lyázy DNA (apurinické nebo apyrimidinové místo); • aktivita hydrolázy; • Aktivita DNA N-glykosylázy; • aktivita DNA - (apurinové nebo apyrimidinové místo) lyázy třídy I;
Buněčná složka	• cytoplazma; • mikrotubulární cytoskelet; • vřetenová mikrotubule; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• oprava nukleotidovou excizí; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • depyrimidace; • metabolismus; • oprava základní excize; • Oprava DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	252969
	382913
	ENSG00000154328
	ENSMUSG00000035121
	Q969S2
	Q6R2P8
	NM_001135746; NM_001135747; NM_001135748; NM_145043
	NM_201610
NP_001129218; NP_001129219; NP_001129220; NP_659480; NP_001336368;
	NP_001336369; NP_001336370; NP_001336371
	NP_963904
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Endonukleáza podobná VIII je enzym že u lidí je kódován NEIL2 gen.^[4]^[5]^[6]

NEIL2 patří do třídy DNA glykosyláz homologních s bakteriální rodinou Fpg / Nei. Tyto glykosylázy iniciují první krok v opravě excize bazí štěpením bází poškozených reaktivními formami kyslíku a zavedením štěpení řetězce DNA prostřednictvím asociované lyasové reakce (Bandaru et al., 2002) [dodáno OMIM]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035121 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hazra TK, Kow YW, Hatahet Z, Imhoff B, Boldogh I, Mokkapati SK, Mitra S, Izumi T (srpen 2002). "Identifikace a charakterizace nové lidské DNA glykosylázy pro opravu lézí odvozených od cytosinu". J Biol Chem. 277 (34): 30417–20. doi:10.1074 / jbc.C200355200. PMID 12097317.
^ Das S, Chattopadhyay R, Bhakat KK, Boldogh I, Kohno K, Prasad R, Wilson SH, Hazra TK (září 2007). „Stimulace opravy excize oxidované báze zprostředkované NEIL2 prostřednictvím interakce YB-1 během oxidačního stresu“. J Biol Chem. 282 (39): 28474–84. doi:10,1074 / jbc.M704672200. PMC 2679419. PMID 17686777.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NEIL2 nei like 2 (E. coli)“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Takao M, Kanno S, Kobayashi K a kol. (2003). „Záložní glykosyláza u knock-out myší Nth1 je funkční homolog Nei (endonukleáza VIII)“. J. Biol. Chem. 277 (44): 42205–13. doi:10,1074 / jbc.M206884200. PMID 12200441.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Bandaru V, Sunkara S, Wallace SS, Bond JP (2003). „Nová lidská DNA glykosyláza, která odstraňuje oxidační poškození DNA a je homologní s endonukleázou VIII z Escherichia coli.“ Oprava DNA (Amst.). 1 (7): 517–29. doi:10.1016 / S1568-7864 (02) 00036-8. PMID 12509226.
Dou H, Mitra S, Hazra TK (2004). „Oprava oxidovaných bází ve strukturách bublin DNA lidskými glykosylázami NEIL1 a NEIL2“. J. Biol. Chem. 278 (50): 49679–84. doi:10,1074 / jbc.M308658200. PMID 14522990.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Katafuchi A, Nakano T, Masaoka A a kol. (2004). „Diferenciální specificita humánních homologů endonukleázy III a VIII Escherichia coli pro léze oxidační báze“. J. Biol. Chem. 279 (14): 14464–71. doi:10,1074 / jbc.M400393200. PMID 14734554.
Bhakat KK, Hazra TK, Mitra S (2004). "Acetylace lidské DNA glykosylázy NEIL2 a inhibice její aktivity". Nucleic Acids Res. 32 (10): 3033–9. doi:10.1093 / nar / gkh632. PMC 434438. PMID 15175427.
Das A, Rajagopalan L, Mathura VS a kol. (2004). „Identifikace domény se zinkovým prstem v lidském proteinu NEIL2 (Nei-like-2)“. J. Biol. Chem. 279 (45): 47132–8. doi:10,1074 / jbc.M406224200. PMID 15339932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Das A, Wiederhold L, Leppard JB a kol. (2007). „Oprava oxidovaných bází v DNA iniciovaná NEIL2, nezávislá na APE: Důkaz opravného komplexu v lidských buňkách“. Oprava DNA (Amst.). 5 (12): 1439–48. doi:10.1016 / j.dnarep.2006.07.003. PMC 2805168. PMID 16982218.
Broderick P, Bagratuni T, Vijayakrishnan J, et al. (2006). „Hodnocení genů NTHL1, NEIL1, NEIL2, MPG, TDG, UNG a SMUG1 v rodinné predispozici k kolorektálnímu karcinomu“. Rakovina BMC. 6: 243. doi:10.1186/1471-2407-6-243. PMC 1624846. PMID 17029639.
Katafuchi A, Matsubara M, Terato H a kol. (2007). "Poškození specificity lidských DNA glykosyláz pro oxidační pyrimidinové léze". Symp Serial Nucleic Acids (Oxf). 48 (48): 175–6. doi:10.1093 / nass / 48.1.175. PMID 17150535.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCm38Ensembl-1] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035121 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12097317-4] Hazra TK, Kow YW, Hatahet Z, Imhoff B, Boldogh I, Mokkapati SK, Mitra S, Izumi T (srpen 2002). "Identifikace a charakterizace nové lidské DNA glykosylázy pro opravu lézí odvozených od cytosinu". J Biol Chem. 277 (34): 30417–20. doi:10.1074 / jbc.C200355200. PMID 12097317.

[pmid17686777-5] Das S, Chattopadhyay R, Bhakat KK, Boldogh I, Kohno K, Prasad R, Wilson SH, Hazra TK (září 2007). „Stimulace opravy excize oxidované báze zprostředkované NEIL2 prostřednictvím interakce YB-1 během oxidačního stresu“. J Biol Chem. 282 (39): 28474–84. doi:10,1074 / jbc.M704672200. PMC 2679419. PMID 17686777.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: NEIL2 nei like 2 (E. coli)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]