NDST1 - NDST1

NDST1

Protein NDST1 PDB 1nst.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
1NST

Identifikátory

NDST1, HSST, NST1, MRT46, N-deacetyláza / N-sulfotransferáza 1, N-deacetyláza a N-sulfotransferáza 1

Externí ID

OMIM: 600853 MGI: 104719 HomoloGene: 20386 Genové karty: NDST1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 5 (lidský)^[1]

Kapela	5q33.1	Start	150,485,818 bp^[1]
Kapela	5q33.1	Konec	150,558,211 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 18 (myš)^[2]

Kapela	18 \| 18 D3	Start	60,684,494 bp^[2]
Kapela	18 \| 18 D3	Konec	60,748,650 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy • aktivita sulfotransferázy • aktivita deacetylázy • katalytická aktivita • aktivita hydrolázy • Aktivita N-acetylglukosamin-deacetylázy • GO: 0001948 vazba na proteiny • [heparan sulfát -glukosamin N-sulfotransferázová aktivita] • aktivita N-acetylglukosaminyltransferázy heparan sulfát • aktivita heparan sulfát sulfotransferázy
Buněčná složka	• integrální součást membrány • Golgiho aparát • membrána • Golgiho membrána
Biologický proces	• vývoj septa srdce • proces biosyntézy heparinu • embryonální neurokranium morfogeneze • vývoj koronární vaskulatury • respirační plynná výměna • signální dráha receptoru pro růstový faktor fibroblastů • vývoj aorty • vývoj srdce • proces biosyntézy glykosaminoglykanu • morfogeneze zvířecích orgánů • embryonální morfogeneze viscerokranu • biosyntetický proces polysacharidů • vývoj předního mozku • metabolismus • sulfatace proteinů • zánětlivá reakce • vývoj středního mozku • metabolický proces glykosaminoglykanu • proces biosyntézy heparansulfátu proteoglykanu • proces biosyntézy heparansulfátu proteoglykanu, proces biosyntézy polysacharidového řetězce • pozitivní regulace kaskády MAPK • pozitivní regulace vyhlazené signální dráhy • metabolický proces sloučeniny síry
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


3340


15531


ENSG00000070614


ENSMUSG00000054008


P52848


Q3UHN9

RefSeq (mRNA)


NM_001301063 NM_001543

NM_008306 NM_001348100 NM_001348101 NM_001348102 NM_001348103
NM_001348146

RefSeq (protein)


NP_001287992 NP_001534

NP_032332 NP_001335029 NP_001335030 NP_001335031 NP_001335032
NP_001335075

Místo (UCSC)

Chr 5: 150,49 - 150,56 Mb

Chr 18: 60,68 - 60,75 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Bifunkční heparan sulfát N-deacetyláza / N-sulfotransferáza 1 je enzym. v lidé, je kódován NDST1 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000070614 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000054008 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dixon J, Loftus SK, Gladwin AJ, Scambler PJ, Wasmuth JJ, Dixon MJ (srpen 1995). „Klonování lidského genu pro heparansulfát-N-deacetylázu / N-sulfotransferázu z kandidátské oblasti syndromu Treacher Collins při 5q32-q33,1“. Genomika. 26 (2): 239–44. doi:10.1016/0888-7543(95)80206-2. PMID 7601448.
^ Humphries DE, Sullivan BM, Aleixo MD, Stow JL (srpen 1997). „Lokalizace lidské heparan glukosaminyl N-deacetylázy / N-sulfotransferázy do trans-Golgiho sítě“. Biochem J.. 325. (Pt 2) (2): 351–7. doi:10.1042 / bj3250351. PMC 1218567. PMID 9230113.
^ "Entrez Gene: NDST1 N-deacetyláza / N-sulfotransferáza (heparan glukosaminyl) 1".

Další čtení

Sueyoshi T, Kakuta Y, Pedersen LC a kol. (1998). "Role Lys614 v sulfotransferázové aktivitě lidského heparan sulfát N-deacetylázy / N-sulfotransferázy". FEBS Lett. 433 (3): 211–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00913-2. PMID 9744796. S2CID 9055616.
Aikawa J, Esko JD (1999). "Molekulární klonování a exprese třetího člena rodiny heparan sulfát / heparin GlcNAc N-deacetyláza / N-sulfotransferáza". J. Biol. Chem. 274 (5): 2690–5. doi:10.1074 / jbc.274.5.2690. PMID 9915799.
Kakuta Y, Sueyoshi T, Negishi M, Pedersen LC (1999). "Krystalová struktura domény sulfotransferázy lidského heparan sulfátu N-deacetylázy / N-sulfotransferázy 1". J. Biol. Chem. 274 (16): 10673–6. doi:10.1074 / jbc.274.16.10673. PMID 10196134.
Pikas DS, Eriksson I, Kjellén L (2000). „Nadměrná exprese různých izoforem glukosaminyl-N-deacetylázy / N-sulfotransferázy vede k odlišným vzorům heparan sulfátu N-sulfatace“. Biochemie. 39 (15): 4552–8. doi:10.1021 / bi992524l. PMID 10758005.
Mura CV, Becker MI, Orellana A, Wolff D (2002). "Imunopurifikace Golgiho váčků magnetickým tříděním". J. Immunol. Metody. 260 (1–2): 263–71. doi:10.1016 / S0022-1759 (01) 00546-4. PMID 11792394.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Bengtsson J, Eriksson I, Kjellén L (2003). "Výrazné účinky na strukturu heparan sulfátu různými mutacemi aktivního místa v NDST-1". Biochemie. 42 (7): 2110–5. doi:10.1021 / bi026928g. PMID 12590599.
van den Born J, Pikas DS, Pisa BJ a kol. (2003). „Protilátkový test na aktivitu N-deacetylázy heparansulfátu / heparinu N-deacetylázy / N-sulfotransferázy (NDST): nové charakteristiky NDST-1 a -2“. Glykobiologie. 13 (1): 1–10. doi:10.1093 / glycob / cwg011. PMID 12634318.
Nakayama K, Natori Y, Sato T a kol. (2004). "Změněná exprese NDST-1 messenger RNA v puromycin aminonukleosidové nefróze". J. Lab. Clin. Med. 143 (2): 106–14. doi:10.1016 / j.lab.2003.10.012. PMID 14966466.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.