NBR1 - NBR1

NBR1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1WJ6, 2 BKF, 2CP8, 2G4S, 2L8J, 2 MWG, 2MJ5, 4OLE
Identifikátory
Aliasy	NBR1, 1A1-3B, IAI3B, M17S2, MIG19, soused BRCA1 genu 1, autofagický nákladní receptor, NBR1 autofagický nákladní receptor
Externí ID	OMIM: 166945 MGI: 108498 HomoloGene: 7438 Genové karty: NBR1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	43,211,689 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	101,581,951 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • mitogenem aktivovaná vazba proteinkinázy; • ubikvitinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • M pásmo; • autofagozom; • cytosol; • pozdní endosom; • lysozom; • extracelulární exosom; • membrána; • cytoplazmatický váček; • pre-autofagozomální struktura; • mitochondrie; • nukleoplazma; • jaderné těleso; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• oligomerizace proteinu; • negativní regulace diferenciace osteoblastů; • regulace stresem aktivované kaskády MAPK; • regulace mineralizace kostí; • makroautofagie;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4077
	17966
	ENSG00000188554
	ENSMUSG00000017119
	Q14596
	P97432
	NM_001291571; NM_001291572; NM_005899; NM_031858; NM_031862
	NM_001252220; NM_001252222; NM_001252223; NM_008676
	NP_001278500; NP_001278501; NP_005890; NP_114068
	NP_001239149; NP_001239151; NP_001239152; NP_032702
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Soused proteinu genu 1 BRCA1 je protein že u lidí je kódován NBR1 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem byl původně identifikován jako ovariální nádorový antigen sledovaný u rakoviny vaječníků. Kódovaný protein obsahuje motiv B-box / coiled coil, který je přítomen v mnoha genech s transformačním potenciálem. Tento gen je umístěn v oblasti chromozomu 17q21.1, která je v těsné blízkosti tumor supresorového genu BRCA1. Pro tento gen byly identifikovány tři alternativně sestříhané varianty kódující stejný protein.^[6] Jedna implikovaná funkce spočívá v autofagii, kde působí jako receptor nákladu v selektivní autofagii.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že NBR1 komunikovat s FEZ1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000188554 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000017119 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Campbell IG, Nicolai HM, Foulkes WD, Senger G, Stamp GW, Allan G, Boyer C, Jones K, Bast RC Jr, Solomon E (září 1994). „Nový gen kódující protein B-boxu v oblasti BRCA1 v 17q21.1.“. Hum Mol Genet. 3 (4): 589–594. doi:10,1093 / hmg / 3,4,589. PMID 8069304.
^ ^A ^b „Entrez Gene: soused NBR1 genu 1 BRCA1“.
^ Kirkin, Vladimir (2009). "Role pro ubikvitin v selektivní autofagii". Molekulární buňka. 34 (3): 259–269. doi:10.1016 / j.molcel.2009.04.026. PMID 19450525.
^ Whitehouse, Caroline; Chambers Julie; Howe Kathy; Cobourne Martyn; Sharpe Paul; Solomon Ellen (leden 2002). „NBR1 interaguje s fascikulací a prodloužením proteinu zeta-1 (FEZ1) a proteinu vázajícího vápník a integrin (CIB) a vykazuje vývojově omezenou expresi v neurální trubici“. Eur. J. Biochem. 269 (2): 538–545. doi:10.1046 / j.0014-2956.2001.02681.x. ISSN 0014-2956. PMID 11856312.

Další čtení

Miki Y, Swensen J, Shattuck-Eidens D a kol. (1994). „Silný kandidát na gen pro citlivost na rakovinu prsu a vaječníků BRCA1“. Věda. 266 (5182): 66–71. Bibcode:1994Sci ... 266 ... 66M. doi:10.1126 / science.7545954. PMID 7545954.
Harshman K, Bell R, Rosenthal J a kol. (1995). „Srovnání metod pozičního klonování použitých k izolaci genu BRCA1“. Hučení. Mol. Genet. 4 (8): 1259–1266. doi:10,1093 / hmg / 4,8,1259. PMID 7581362.
Nomura N, Nagase T, Miyajima N a kol. (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. II. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0041-KIAA0080) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 1 (5): 223–229. doi:10.1093 / dnares / 1.5.223. PMID 7584044.
Brown MA, Nicolai H, Xu CF a kol. (1995). "Regulace BRCA1". Příroda. 372 (6508): 733. Bibcode:1994 Natur.372..733B. doi:10.1038 / 372733a0. PMID 7997258. S2CID 40825012.
Brown MA, Xu CF, Nicolai H a kol. (1996). „5 'konec genu BRCA1 leží v duplikované oblasti lidského chromozomu 17q21“. Onkogen. 12 (12): 2507–13. PMID 8700509.
Dimitrov S, Brennerova M, Forejt J (2001). "Profily exprese a intergenní struktura genů Brca1 a Nbr1 orientovaných proti sobě". Gen. 262 (1–2): 89–98. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00549-7. PMID 11179671.
Whitehouse C, Chambers J, Howe K a kol. (2002). „NBR1 interaguje s fascikulací a prodloužením proteinu zeta-1 (FEZ1) a proteinu vázajícího vápník a integrin (CIB) a vykazuje vývojově omezenou expresi v neurální trubici“. Eur. J. Biochem. 269 (2): 538–545. doi:10.1046 / j.0014-2956.2001.02681.x. PMID 11856312.
Wistow G, Bernstein SL, Ray S a kol. (2002). „Exprimovaná analýza sekvenční značky dospělé lidské duhovky pro projekt NEIBank: faktory reakce na steroidy a podobnosti s pigmentovým epitelem sítnice“. Mol. Vis. 8: 185–95. PMID 12107412.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Lamark T, Perander M, Outzen H a kol. (2003). "Interakční kódy v rodině savčích proteinů obsahujících doménu Phox a Bem1p". J. Biol. Chem. 278 (36): 34568–34581. doi:10,1074 / jbc.M303221200. PMID 12813044.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Lange S, Xiang F, Yakovenko A, et al. (2005). "Kinázová doména titinu řídí expresi svalových genů a přeměnu bílkovin". Věda. 308 (5728): 1599–1603. Bibcode:2005Sci ... 308.1599L. CiteSeerX 10.1.1.383.9888. doi:10.1126 / science.1110463. PMID 15802564. S2CID 2809403.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–1178. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000188554 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000017119 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8069304-5] Campbell IG, Nicolai HM, Foulkes WD, Senger G, Stamp GW, Allan G, Boyer C, Jones K, Bast RC Jr, Solomon E (září 1994). „Nový gen kódující protein B-boxu v oblasti BRCA1 v 17q21.1.“. Hum Mol Genet. 3 (4): 589–594. doi:10,1093 / hmg / 3,4,589. PMID 8069304.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: soused NBR1 genu 1 BRCA1“.

[7] Kirkin, Vladimir (2009). "Role pro ubikvitin v selektivní autofagii". Molekulární buňka. 34 (3): 259–269. doi:10.1016 / j.molcel.2009.04.026. PMID 19450525.

[pmid11856312-8] Whitehouse, Caroline; Chambers Julie; Howe Kathy; Cobourne Martyn; Sharpe Paul; Solomon Ellen (leden 2002). „NBR1 interaguje s fascikulací a prodloužením proteinu zeta-1 (FEZ1) a proteinu vázajícího vápník a integrin (CIB) a vykazuje vývojově omezenou expresi v neurální trubici“. Eur. J. Biochem. 269 (2): 538–545. doi:10.1046 / j.0014-2956.2001.02681.x. ISSN 0014-2956. PMID 11856312.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]