MYCBP2 - MYCBP2

MYCBP2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3 GBW, 3HWJ
Identifikátory
Aliasy	MYCBP2, PAM, Myc-bp2, Phr, MYC vazebný protein 2, E3 ubikvitinová proteinová ligáza, PHR1, MYC vazebný protein 2
Externí ID	OMIM: 610392 MGI: 2179432 HomoloGene: 9005 Genové karty: MYCBP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	77,327,094 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	103,346,814 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktivita transferázy; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů; • vazba iontů zinku; • Proběhla vazba GTPázy; • aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• membrána; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytoskelet; • mikrotubulární cytoskelet; • axon; • buněčná projekce; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • ubikvitinace bílkovin; • transkripce, chráněná DNA; • vedení motorických neuronů axonem; • pobočkový neuron navádění axonů; • projekce centrálního nervového systému neuron axonogeneze; • regulace lokalizace proteinů; • negativní regulace proteinového katabolického procesu; • buněčná morfogeneze podílející se na diferenciaci neuronů; • neuromuskulární proces; • regulace organizace cytoskeletu; • regulace axonového vedení; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin; • cirkadiánní regulace genové exprese; • rytmický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23077
	105689
	ENSG00000005810
	ENSMUSG00000033004
	O75592
	Q7TPH6
	NM_015057
	NM_207215
	NP_055872
	NP_997098
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Pravděpodobná E3 ubikvitin-protein ligáza MYCBP2 také známý jako protein vázající myc 2 nebo proteinové asociace s myc (PAM) je enzym že u lidí je kódován MYCBP2 gen.^[5]^[6]

Struktura

PAM obsahuje a N-terminál leucinový zip, centrální MOJE C -vázání a C-terminál histon -vázající proteinové homologické domény.^[5]

Interakce

MYCBP2 bylo prokázáno komunikovat s Moje C.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000005810 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033004 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Guo Q, Xie J, Dang CV, Liu ET, Bishop JM (září 1998). „Identifikace velkého proteinu vázajícího Myc, který obsahuje opakování podobná RCC1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (16): 9172–7. doi:10.1073 / pnas.95.16.9172. PMC 21311. PMID 9689053.
^ „Entrez Gene: MYCBP2 MYC binding protein 2“.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2002). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (6): 355–64. doi:10.1093 / dnares / 5.6.355. PMID 10048485.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Murthy V, Han S, Beauchamp RL, Smith N, Haddad LA, Ito N, Ramesh V (2004). „Pam a jeho ortologický highwire interagují s komplexem TSC1.TSC2 a mohou jej negativně regulovat.“. J. Biol. Chem. 279 (2): 1351–8. doi:10,1074 / jbc.M310208200. PMID 14559897.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
Pierre SC, Häusler J, Birod K, Geisslinger G, Scholich K (2004). „PAM zprostředkovává trvalou inhibici signalizace cAMP sfingosin-1-fosfátem“. EMBO J.. 23 (15): 3031–40. doi:10.1038 / sj.emboj.7600321. PMC 514936. PMID 15257286.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). „Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace“. Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Gao X, Patel TB (2005). „Zbytky histidinu 912 a 913 v proteinu spojeném s Myc jsou nezbytné pro inhibici aktivity adenylyl cyklázy“. Mol. Pharmacol. 67 (1): 42–9. doi:10,1124 / mol 104,005355. PMID 15470080.
Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (2005). „Cílená proteomická analýza 14-3-3 sigma, efektoru p53 běžně umlčeného při rakovině“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (6): 785–95. doi:10,1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000005810 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033004 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9689053-5] A ^b ^C Guo Q, Xie J, Dang CV, Liu ET, Bishop JM (září 1998). „Identifikace velkého proteinu vázajícího Myc, který obsahuje opakování podobná RCC1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (16): 9172–7. doi:10.1073 / pnas.95.16.9172. PMC 21311. PMID 9689053.

[entrez-6] „Entrez Gene: MYCBP2 MYC binding protein 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]