MUPCDH - MUPCDH

CDHR5
Identifikátory
Aliasy	CDHR5, MU-PCDH, MUCDHL, MUPCDH, MLPCDH, člen rodiny související s kadherinem 5
Externí ID	OMIM: 606839 MGI: 1919290 HomoloGene: 69345 Genové karty: CDHR5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	626,078 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	141,276,786 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba beta-katenin; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba molekul buněčné adheze;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • překlenovací složka plazmatické membrány; • kartáčová hraniční membrána; • jáma potažená klatrinem; • buněčná membrána; • extracelulární exosom; • membrána; • buněčná projekce; • microvillus membrána; • apikální plazmatická membrána;
Biologický proces	• buněčná adheze; • regulace délky microvillus; • homofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze plazmatické membrány; • intermikrovilární adheze; • diferenciace buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	53841
	72040
	ENSG00000099834; ENSG00000273572
	ENSMUSG00000025497
	Q9HBB8
	Q8VHF2
	NM_001171968; NM_017717; NM_021924; NM_031264; NM_031265
	NM_001114322; NM_028069
	NP_001165439; NP_068743; NP_112554
	NP_001107794; NP_082345
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Mucin a kadherin podobný protein je protein že u lidí je kódován MUPCDH gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen je nový gen podobný mucinu, který je členem nadrodiny kadherinů. Zatímco kóduje nepolymorfní tandemové repetice bohaté na prolin, serin a threonin podobné mucinovým proteinům, gen také obsahuje sekvenci kódující motivy vázající vápník, které se nacházejí ve všech kadherinech. Úloha hybridní extracelulární oblasti a specifická funkce tohoto proteinu dosud nebyla stanovena. Bylo identifikováno alternativní sestřih, s pozorovanou variací vedoucí k přítomnosti nebo nepřítomnosti domén. Kromě toho dochází k sestřihu v 5 'UTR, ale přepisy zahrnující tyto variace nebyly popsány úplně.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000273572 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099834, ENSG00000273572 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025497 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Paris MJ, Williams BR (leden 2001). "Charakterizace 500kb kontig překlenující oblast mezi c-Ha-Ras a MUC2 na chromozomu 11p15.5". Genomika. 69 (2): 196–202. doi:10,1006 / geno.2000.6339. PMID 11031102.
^ Goldberg M, Peshkovsky C, Shifteh A, Al-Awqati Q (září 2000). „mu-Protocadherin, nový vývojově regulovaný protocadherin s mucinovými doménami“. J Biol Chem. 275 (32): 24622–9. doi:10,1074 / jbc.M000234200. PMID 10801787. S2CID 42493271.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MUCDHL mucin a podobný kadherinu“.

Další čtení

Yagi T, Takeichi M (2000). "Cadherin superrodiny geny: funkce, genomová organizace a neurologická rozmanitost". Genes Dev. 14 (10): 1169–80. doi:10.1101 / gad.14.10.1169 (neaktivní 11. 10. 2020). PMID 10817752.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
Goldberg M, Wei M, Tycko B a kol. (2002). „Identifikace a analýza exprese lidského genu mu-protocadherinu ve ledvinách plodu a dospělých“. Dopoledne. J. Physiol. Renal Physiol. 283 (3): F454–63. doi:10.1152 / ajprenal.00012.2002. PMID 12167596. S2CID 615952.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Goldberg M, Wei M, Yuan L a kol. (2003). "Bialelická exprese HRAS a MUCDHL u člověka a myši". Hučení. Genet. 112 (4): 334–42. doi:10.1007 / s00439-003-0907-7. PMID 12589428. S2CID 1143721.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), rozsáhlá snaha o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). "Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039. S2CID 21903526.
Liu T, Qian WJ, Gritsenko MA a kol. (2006). „Analýza lidského plazmatu N-glykoproteomu pomocí odečtení imunoafinity, chemie hydrazidů a hmotnostní spektrometrie“. J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. doi:10.1021 / pr0502065. PMC 1850943. PMID 16335952.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000273572 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099834, ENSG00000273572 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025497 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11031102-5] Paris MJ, Williams BR (leden 2001). "Charakterizace 500kb kontig překlenující oblast mezi c-Ha-Ras a MUC2 na chromozomu 11p15.5". Genomika. 69 (2): 196–202. doi:10,1006 / geno.2000.6339. PMID 11031102.

[pmid10801787-6] Goldberg M, Peshkovsky C, Shifteh A, Al-Awqati Q (září 2000). „mu-Protocadherin, nový vývojově regulovaný protocadherin s mucinovými doménami“. J Biol Chem. 275 (32): 24622–9. doi:10,1074 / jbc.M000234200. PMID 10801787. S2CID 42493271.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: MUCDHL mucin a podobný kadherinu“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]