MRPS18A - MRPS18A

MRPS18A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3J7Y, 3J9M
Identifikátory
Aliasy	MRPS18A, HumanS18b, MRP-S18-3, MRPS18-3, S18bmt, mitochondriální ribozomální protein S18A, S18mt-a, MRP-S18-a
Externí ID	OMIM: 611981 MGI: 1915815 HomoloGene: 32391 Genové karty: MRPS18A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	43,687,791 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	46,128,910 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• strukturní složka ribozomu; • vazba rRNA na malou ribozomální podjednotku;
Buněčná složka	• mitochondriální vnitřní membrána; • ribozom; • intracelulární; • mitochondrie; • mitochondriální malá ribozomální podjednotka; • cytosolická malá ribozomální podjednotka; • mitochondriální velká ribozomální podjednotka;
Biologický proces	• mitochondriální translační prodloužení; • mitochondriální translační ukončení; • biosyntéza bílkovin; • mitochondriální překlad;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55168
	68565
	ENSG00000096080
	ENSMUSG00000023967
	Q9NVS2
	Q99N85
	NM_001193343; NM_018135
	NM_026768
	NP_001180272; NP_060605
	NP_081044
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

28S ribozomální protein S18a, mitochondriální je protein že u lidí je kódován MRPS18A gen.^[5]^[6]^[7]

Savčí mitochondriální ribozomální proteiny jsou kódovány jadernými geny a pomáhají při syntéze proteinů v mitochondriích. Mitochondriální ribozomy (mitoribozomy) sestávají z malé podjednotky 28S a velké podjednotky 39S. Mají odhadem 75% složení proteinu k rRNA ve srovnání s prokaryotickými ribozomy, kde je tento poměr obrácen. Další rozdíl mezi savčími mitoribozomy a prokaryotickými ribozomy je v tom, že tyto obsahují 5S rRNA. Mezi různými druhy se proteiny obsahující mitoribozom velmi liší v sekvenci a někdy v biochemických vlastnostech, což znemožňuje snadné rozpoznání sekvenční homologií. Tento gen kóduje protein 28S podjednotky, který patří do rodiny ribosomálních proteinů S18P. Kódovaný protein je jedním ze tří, který má významnou sekvenční podobnost s bakteriálními proteiny S18. Primární sekvence tří lidských mitochondriálních proteinů S18 nejsou navzájem více příbuzné, než jsou prokaryotické proteiny S18. Pseudogen odpovídající tomuto genu se nachází na chromozomu 3p.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000096080 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023967 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (květen 2001). „Malá podjednotka savčího mitochondriálního ribozomu. Identifikace úplného doplňku přítomných ribozomálních proteinů“. J Biol Chem. 276 (22): 19363–74. doi:10,1074 / jbc.M100727200. PMID 11279123.
^ Kenmochi N, Suzuki T, Uechi T, Magoori M, Kuniba M, Higa S, Watanabe K, Tanaka T (září 2001). „Humánní mitochondriální ribozomální proteinové geny: mapování 54 genů na chromozomy a důsledky pro lidské poruchy“. Genomika. 77 (1–2): 65–70. doi:10.1006 / geno.2001.6622. PMID 11543634.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MRPS18A mitochondriální ribozomální protein S18A“.

Další čtení

Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Zhang Z, Gerstein M (2003). "Identifikace a charakterizace více než 100 mitochondriálních ribozomálních proteinových pseudogenů v lidském genomu". Genomika. 81 (5): 468–80. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID 12706105.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Suzuki T, Terasaki M, Takemoto-Hori C a kol. (2001). „Proteomická analýza mitochondriálního ribosomu savců. Identifikace proteinových složek v malé podjednotce 28 S.“. J. Biol. Chem. 276 (35): 33181–95. doi:10,1074 / jbc.M103236200. PMID 11402041.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000096080 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023967 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11279123-5] Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (květen 2001). „Malá podjednotka savčího mitochondriálního ribozomu. Identifikace úplného doplňku přítomných ribozomálních proteinů“. J Biol Chem. 276 (22): 19363–74. doi:10,1074 / jbc.M100727200. PMID 11279123.

[pmid11543634-6] Kenmochi N, Suzuki T, Uechi T, Magoori M, Kuniba M, Higa S, Watanabe K, Tanaka T (září 2001). „Humánní mitochondriální ribozomální proteinové geny: mapování 54 genů na chromozomy a důsledky pro lidské poruchy“. Genomika. 77 (1–2): 65–70. doi:10.1006 / geno.2001.6622. PMID 11543634.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: MRPS18A mitochondriální ribozomální protein S18A“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]