MORF4L1 - MORF4L1

MORF4L1

Protein MORF4L1 PDB 2aql.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2AQL, 2EFI, 2F5J, 2F5K, 2 LKM, 2N1D

Identifikátory

MORF4L1, Eaf3, HsT17725, MEAF3, MORFRG15, MRG15, S863-6, FWP006, faktor úmrtnosti 4 jako 1

Externí ID

OMIM: 607303 MGI: 1096551 HomoloGene: 86043 Genové karty: MORF4L1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 15 (lidský)^[1]

Kapela	15q25.1	Start	78,810,487 bp^[1]
Kapela	15q25.1	Konec	78,898,139 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 9 (myš)^[2]

Kapela	9 \| 9 E3.1	Start	90,091,665 bp^[2]
Kapela	9 \| 9 E3.1	Konec	90,114,774 bp^[2]

Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba N-konce proteinu • GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba chromatinu
Buněčná složka	• buněčné jádro • nukleoplazma • jaderná skvrna • Komplex Sin3 • Komplex NuA4 histon-acetyltransferáza • komplex histon-acetyltransferáza
Biologický proces	• remodelace chromatinu • DNA rekombinace • umlčování chromatinu • regulace transkripce, DNA-šablony • acetylace histonu H2A • transkripce, chráněná DNA • buněčná odpověď na stimul poškození DNA • oprava dvouvláknového zlomu pomocí homologní rekombinace • acetylace histonu H4 • regulace růstu • histonová deacetylace • Oprava DNA • organizace chromatinu • buněčná proliferace • acetylace histonů
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


10933


21761


ENSG00000185787


ENSMUSG00000062270


Q9UBU8


P60762

RefSeq (mRNA)


NM_206839 NM_001265603 NM_001265604 NM_001265605 NM_006791


NM_001039147 NM_024431 NM_001357780

RefSeq (protein)


NP_001252532 NP_001252533 NP_001252534 NP_006782 NP_996670


NP_001034236 NP_077751 NP_001344709

Místo (UCSC)

Chr 15: 78,81 - 78,9 Mb

Chr 9: 90,09 - 90,11 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Faktor úmrtnosti 4 podobný protein 1 je protein že u lidí je kódován MORF4L1 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

MORF4L1 bylo prokázáno komunikovat s MYST1,^[8] Protein retinoblastomu^[8]^[9] a MRFAP1.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185787 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000062270 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
^ Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
^ „Entrez Gene: MORF4L1 faktor úmrtnosti 4 jako 1“.
^ ^A ^b ^C Pardo PS, Leung JK, Lucchesi JC, Pereira-Smith OM (prosinec 2002). „MRG15, nový chromodoménový protein, je přítomen ve dvou odlišných multiproteinových komplexech zapojených do transkripční aktivace“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (52): 50860–6. doi:10,1074 / jbc.M203839200. PMID 12397079.
^ ^A ^b Leung JK, Berube N, Venable S, Ahmed S, Timchenko N, Pereira-Smith OM (říjen 2001). „MRG15 aktivuje promotor B-myb tvorbou jaderného komplexu s proteinem retinoblastomu a novým proteinem PAM14“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (42): 39171–8. doi:10,1074 / jbc.M103435200. PMID 11500496.

Další čtení

Doyon Y, Côté J (duben 2004). "Vysoce konzervativní a multifunkční komplex NuA4 HAT". Aktuální názor na genetiku a vývoj. 14 (2): 147–54. doi:10.1016 / j.gde.2004.02.009. PMID 15196461.
Pena AN, Pereira-Smith OM (duben 2007). „Úloha rodiny genů MORF / MRG v buněčném růstu, diferenciaci, opravě DNA a tím stárnutí“. Annals of the New York Academy of Sciences. 1100 (1): 299–305. doi:10.1196 / annals.1395.031. PMID 17460191.
Bertram MJ, Bérubé NG, Hang-Swanson X, Ran Q, Leung JK, Bryce S, Spurgers K, Bick RJ, Baldini A, Ning Y, Clark LJ, Parkinson EK, Barrett JC, Smith JR, Pereira-Smith OM (únor 1999). „Identifikace genu, který obrací nesmrtelný fenotyp podmnožiny buněk a je členem nové rodiny genů podobných transkripčním faktorům“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (2): 1479–85. doi:10.1128 / mcb.19.2.1479. PMC 116076. PMID 9891081.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Leung JK, Berube N, Venable S, Ahmed S, Timchenko N, Pereira-Smith OM (říjen 2001). „MRG15 aktivuje promotor B-myb tvorbou jaderného komplexu s proteinem retinoblastomu a novým proteinem PAM14“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (42): 39171–8. doi:10,1074 / jbc.M103435200. PMID 11500496.
Yochum GS, Ayer DE (listopad 2002). „Role faktorů úmrtnosti MORF4, MRGX a MRG15 v transkripční represi prostřednictvím asociací s Pf1, mSin3A a Transducin-like Enhancer of Split“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (22): 7868–76. doi:10.1128 / MCB.22.22.7868-7876.2002. PMC 134742. PMID 12391155.
Pardo PS, Leung JK, Lucchesi JC, Pereira-Smith OM (prosinec 2002). „MRG15, nový chromodoménový protein, je přítomen ve dvou odlišných multiproteinových komplexech zapojených do transkripční aktivace“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (52): 50860–6. doi:10,1074 / jbc.M203839200. PMID 12397079.
Cai Y, Jin J, Tomomori-Sato C, Sato S, Sorokina I, Parmely TJ, Conaway RC, Conaway JW (říjen 2003). "Identifikace nových podjednotek multproteinového savčího komplexu histon-acetyltransferázy obsahujícího TRRAP / TIP60". The Journal of Biological Chemistry. 278 (44): 42733–6. doi:10,1074 / jbc.C300389200. PMID 12963728.
Tominaga K, Leung JK, Rookard P, Echigo J, Smith JR, Pereira-Smith OM (prosinec 2003). „MRGX je nový regulátor transkripce, který vykazuje aktivaci nebo represi promotoru B-myb způsobem závislým na typu buňky“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (49): 49618–24. doi:10,1074 / jbc.M309192200. PMID 14506250.
Doyon Y, Selleck W, Lane WS, Tan S, Côté J (březen 2004). "Strukturální a funkční zachování komplexu histon acetyltransferázy NuA4 z kvasinek na člověka". Molekulární a buněčná biologie. 24 (5): 1884–96. doi:10.1128 / MCB.24.5.1884-1896.2004. PMC 350560. PMID 14966270.
Tominaga K, Magee DM, Matzuk MM, Pereira-Smith OM (říjen 2004). „PAM14, nový protein asociovaný s MRG a Rb, není vyžadován pro vývoj a funkci T-buněk u myší“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (19): 8366–73. doi:10.1128 / MCB.24.19.8366-8373.2004. PMC 516751. PMID 15367658.
Wan D, Gong Y, Qin W, Zhang P, Li J, Wei L, Zhou X, Li H, Qiu X, Zhong F, He L, Yu J, Yao G, Jiang H, Qian L, Yu Y, Shu H , Chen X, Xu H, Guo M, Pan Z, Chen Y, Ge C, Yang S, Gu J (listopad 2004). „Rozsáhlý screening transfekce cDNA na geny související s vývojem a progresí rakoviny“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (44): 15724–9. doi:10.1073 / pnas.0404089101. PMC 524842. PMID 15498874.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413.
Cai Y, Jin J, Florens L, Swanson SK, Kusch T, Li B, Workman JL, Washburn MP, Conaway RC, Conaway JW (duben 2005). „Savčí protein YL1 je společnou podjednotkou komplexů histon-acetyltransferázy a SRCAP TRRAP / TIP60“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (14): 13665–70. doi:10,1074 / jbc.M500001200. PMID 15647280.

Galerie PDB
2aql: Krystalová struktura domény MRG15 MRG 2f5j: Krystalová struktura domény MRG z lidského MRG15 2f5k: Krystalová struktura chromo domény lidského MRG15

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.