Motiv vedoucí RNA Lactis-leu-phe - Lactis-leu-phe leader RNA motif

Konsensuální sekundární struktura lactis-leu / phe vedoucí RNA. Tento údaj je převzat z předchozí publikace.[1]
vedoucí RNA leu / phe z Lactococcus lactis
Identifikátory
Symbolleu-phe_leader
RfamRF01743
Další údaje
RNA typCis-reg; vůdce;
DoményBakterie;
TAKSO: 0005836
PDB strukturPDBe

The motiv RNA leu / phe-leader (také lactis-leu / phe-leader motiv) je konzervovaný RNA struktura identifikována bioinformatika.[1] Tyto RNA fungují jako vedoucí peptidů. Obsahují krátký otevřený čtecí rámec (ORF), který obsahuje mnoho kodony pro leucin nebo fenylalanin. Za normálních okolností výraz po proudu geny je potlačen. Nicméně, když buněčné koncentrace relevantní aminokyselina je nízký, ribozom pozastavení vede k alternativní struktuře, která umožňuje downstream genovou expresi.

Vůdci Leu / phe této struktury jsou známí pouze u druhů Lactococcus lactis, a je v podstatě stejný jako dříve charakterizovaný leucin vůdce ve stejném druhu.[2] Další homology byly odkryty, které obsahují kodony fenylalaninu místo kodonů leucinů, a jsou proti proudu genů zapojených do syntézy fenylalaninu místo leucinů.

Reference

  1. ^ A b Weinberg Z, Wang JX, Bogue J a kol. (Březen 2010). „Srovnávací genomika odhaluje 104 kandidátských strukturovaných RNA z bakterií, archea a jejich metagenomů“. Genome Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Kok J (říjen 1996). „Indukovatelná genová exprese a environmentálně regulované geny v bakteriích mléčného kvašení“ (PDF). Antonie van Leeuwenhoek. 70 (2–4): 129–145. doi:10.1007 / BF00395930. PMID  8879404.

externí odkazy