LYK5 - LYK5

STRADA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1UPK, 2WTK, 3GNI
Identifikátory
Aliasy	STRADA, LYK5, NY-BR-96, PMSE, STRAD, Stlk, kinázový adaptér alfa související se STE20, STRAD alfa, adaptér alfa související se STE20
Externí ID	OMIM: 608626 MGI: 1919399 HomoloGene: 12448 Genové karty: STRADA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	63,741,986 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	106,202,168 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita aktivátoru proteinové serin / threonin kinázy; • aktivita aktivátoru proteinkinázy; • aktivita proteinkinázy; • ATP vazba; • vazba nukleotidů; • vazba kinázy; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• export bílkovin z jádra; • buněčný cyklus; • fosforylace bílkovin; • zástava buněčného cyklu; • pozitivní regulace aktivity proteinu serin / threonin kinázy; • aktivace aktivity proteinkinázy; • regulace mitotického buněčného cyklu; • stresem aktivovaná signální kaskáda protein kinázy; • regulace apoptotického procesu; • Kaskáda MAPK; • signální transdukce fosforylací proteinů; • morfogeneze projekce neuronů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	92335
	72149
	ENSG00000266173
	ENSMUSG00000069631
	Q7RTN6
	Q3UUJ4
NM_001003786; NM_001003787; NM_001003788; NM_001165969; NM_001165970;
	NM_153335; NM_001363786; NM_001363787; NM_001363788; NM_001363789; NM_001363790; NM_001363791
	NM_001252448; NM_001252449; NM_028126
NP_001003786; NP_001003787; NP_001003788; NP_001159441; NP_001159442;
	NP_699166; NP_001350715; NP_001350716; NP_001350717; NP_001350718; NP_001350719; NP_001350720
	NP_001239377; NP_001239378; NP_082402
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein kináza LYK5, také známý jako LYK5 nebo STRADα, je člověk protein a také označuje gen kódování.^[5]^[6]

Funkce

Endogenní LKB1 a STRADa tvoří komplex, ve kterém STRADa aktivuje LKB1, což vede k fosforylace obou partnerů. Odstranění endogenního LYK5 do malá interferující RNA ruší indukovanou LKB1 Fáze G1 zatknout.^[6] STRADα se stabilizuje LKB1 protein in vivo i in vitro a je schopen vyvolat více axonů v myších embryonálních kortikálně kultivovaných neuronech, když je nadměrně exprimován LKB1. STRADa je vysoce sestříhaný in vivo, a to je jak vývojově regulované, tak tkáňově specifické, ale jedinečné funkce variant sestřihu ještě nejsou pochopeny.^[7]

Vazba nemoci

Mutace v genu LYK5 / STRADα jsou spojeny s polyhydramnios, megalencefalie a symptomatické epilepsie (souhrnně označovaný jako PMSE syndrom).^[8]

Interakce

STRADα bylo prokázáno komunikovat s LKB1 a MO25.^[6]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000266173 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069631 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: LYK5 protein kinase LYK5“.
^ ^A ^b ^C Baas AF, Boudeau J, GP Sapkota, Smit L, Medema R, Morrice NA, Alessi DR, Clevers HC (červen 2003). "Aktivace tumor supresorové kinázy LKB1 pomocí STE20 podobné pseudokinázy STRAD". EMBO J.. 22 (12): 3062–72. doi:10.1093 / emboj / cdg292. PMC 162144. PMID 12805220.
^ Veleva-Rotse BO, Smart JL, Baas AF, Edmonds B, Zhao ZM, Brown A, Klug LR, Hansen K, Reilly G, Gardner AP, Subbiah K, Gaucher EA, Clevers H, Barnes AP (2014). „Pseudokinázy STRAD regulují axogenezi a stabilitu LKB1“. Neural Dev. 9 (5): 5. doi:10.1186/1749-8104-9-5. PMC 4016016. PMID 24594058./
^ Puffenberger EG, Strauss KA, Ramsey KE, Craig DW, Stephan DA, Robinson DL, Hendrickson CL, Gottlieb S, Ramsay DA, Siu VM, Heuer GG, Crino PB, Morton DH (červenec 2007). „Polyhydramnion, megalencefalie a symptomatická epilepsie způsobená homozygotní delecí 7 kilobáz v LYK5“. Mozek. 130 (Pt 7): 1929–1941. doi:10.1093 / mozek / awm100. PMID 17522105.
^ Boudeau J, Scott JW, Resta N, Deak M, Kieloch A, Komander D, Hardie DG, Prescott AR, van Aalten DM, Alessi DR (prosinec 2004). „Analýza komplexu LKB1-STRAD-MO25“. J. Cell Sci. 117 (Pt 26): 6365–75. doi:10.1242 / jcs.01571. PMID 15561763.

Další čtení

Baas AF, Smit L, Clevers H (2004). "LKB1 tumor supresorový protein: PARtaker v polaritě buněk". Trends Cell Biol. 14 (6): 312–9. doi:10.1016 / j.tcb.2004.04.001. PMID 15183188.
Scanlan MJ, Gout I, Gordon CM, Williamson B, Stockert E, Gure AO, Jäger D, Chen YT, Mackay A, O'Hare MJ, Old LJ (2003). "Humorální imunita proti lidskému karcinomu prsu: definice antigenu a kvantitativní analýza exprese mRNA". Rakovina Immun. 1: 4. PMID 12747765.
Baas AF, Boudeau J, GP Sapkota, Smit L, Medema R, Morrice NA, Alessi DR, Clevers HC (2003). "Aktivace tumor supresorové kinázy LKB1 pomocí STE20 podobné pseudokinázy STRAD". EMBO J.. 22 (12): 3062–72. doi:10.1093 / emboj / cdg292. PMC 162144. PMID 12805220.
Boudeau J, Baas AF, Deak M, Morrice NA, Kieloch A, Schutkowski M, Prescott AR, Clevers HC, Alessi DR (2003). „MO25alpha / beta interagují s STRADalpha / beta a zvyšují tak jejich schopnost vázat, aktivovat a lokalizovat LKB1 v cytoplazmě“. EMBO J.. 22 (19): 5102–14. doi:10.1093 / emboj / cdg490. PMC 204473. PMID 14517248.
Milburn CC, Boudeau J, Deak M, Alessi DR, van Aalten DM (2004). "Krystalová struktura MO25 alfa v komplexu s C koncem adaptéru souvisejícího s pseudokinázou STE20". Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (2): 193–200. doi:10.1038 / nsmb716. PMID 14730349. S2CID 18401688.
Lizcano JM, Göransson O, Toth R, Deak M, Morrice NA, Boudeau J, Hawley SA, Udd L, Mäkelä TP, Hardie DG, Alessi DR (2005). „LKB1 je hlavní kináza, která aktivuje 13 kináz podrodiny AMPK, včetně MARK / PAR-1“. EMBO J.. 23 (4): 833–43. doi:10.1038 / sj.emboj.7600110. PMC 381014. PMID 14976552.
Boudeau J, Scott JW, Resta N, Deak M, Kieloch A, Komander D, Hardie DG, Prescott AR, van Aalten DM, Alessi DR (2005). „Analýza komplexu LKB1-STRAD-MO25“. J. Cell Sci. 117 (Pt 26): 6365–75. doi:10.1242 / jcs.01571. PMID 15561763.
Veleva-Rotse BO, Smart JL, Baas AF, Edmonds B, Zhao ZM, Brown A, Klug LR, Hansen K, Reilly G, Gardner AP, Subbiah K, Gaucher EA, Clevers H, Barnes AP (2014). „Pseudokinázy STRAD regulují axogenezi a stabilitu LKB1“. Neural Dev. 9 (5): 5. doi:10.1186/1749-8104-9-5. PMC 4016016. PMID 24594058.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000266173 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069631 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: LYK5 protein kinase LYK5“.

[pmid12805220-6] A ^b ^C Baas AF, Boudeau J, GP Sapkota, Smit L, Medema R, Morrice NA, Alessi DR, Clevers HC (červen 2003). "Aktivace tumor supresorové kinázy LKB1 pomocí STE20 podobné pseudokinázy STRAD". EMBO J.. 22 (12): 3062–72. doi:10.1093 / emboj / cdg292. PMC 162144. PMID 12805220.

[7] Veleva-Rotse BO, Smart JL, Baas AF, Edmonds B, Zhao ZM, Brown A, Klug LR, Hansen K, Reilly G, Gardner AP, Subbiah K, Gaucher EA, Clevers H, Barnes AP (2014). „Pseudokinázy STRAD regulují axogenezi a stabilitu LKB1“. Neural Dev. 9 (5): 5. doi:10.1186/1749-8104-9-5. PMC 4016016. PMID 24594058./

[pmid17522105-8] Puffenberger EG, Strauss KA, Ramsey KE, Craig DW, Stephan DA, Robinson DL, Hendrickson CL, Gottlieb S, Ramsay DA, Siu VM, Heuer GG, Crino PB, Morton DH (červenec 2007). „Polyhydramnion, megalencefalie a symptomatická epilepsie způsobená homozygotní delecí 7 kilobáz v LYK5“. Mozek. 130 (Pt 7): 1929–1941. doi:10.1093 / mozek / awm100. PMID 17522105.

[pmid15561763-9] Boudeau J, Scott JW, Resta N, Deak M, Kieloch A, Komander D, Hardie DG, Prescott AR, van Aalten DM, Alessi DR (prosinec 2004). „Analýza komplexu LKB1-STRAD-MO25“. J. Cell Sci. 117 (Pt 26): 6365–75. doi:10.1242 / jcs.01571. PMID 15561763.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]