LRRC4 - LRRC4

LRRC4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DL9, 3ZYI
Identifikátory
Aliasy	LRRC4, NGL-2, NAG14, repetice bohatá na leucin obsahující 4
Externí ID	OMIM: 610486 MGI: 2182081 HomoloGene: 36403 Genové karty: LRRC4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	128,032,107 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	28,831,747 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita inhibitoru proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • neuronová páteř; • buněčné spojení; • postsynaptická membrána; • dendritická páteř; • buněčná membrána; • synapse; • excitační synapse; • membrána; • Schafferův kolaterál - CA1 synapse; • glutamátergická synapse; • integrální součást membrány postsynaptické hustoty;
Biologický proces	• organizace synapse; • shlukování proteinu 95 postsynaptické hustoty; • regulace organizace synapsí; • negativní regulace aktivity proteinkinázy; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • negativní regulace kaskády JAK-STAT; • modulace chemického synaptického přenosu; • synaptická membrána adheze; • sestava excitační synapse;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	64101
	192198
	ENSG00000128594
	ENSMUSG00000049939
	Q9HBW1
	Q99PH1
	NM_022143
	NM_138682
	NP_071426
	NP_619623
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteiny bohaté na leucin bohaté na opakování 4 je protein že u lidí je kódován LRRC4 gen.^[5]^[6]

Tento gen je primárně významně downregulován mozkové nádory. Přesná funkce proteinu kódovaného tímto genem není známa.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128594 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049939 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wang JR, Li XL, Fan SQ, Tan C, Xiang JJ, Tang K, Wang R, Li GY (září 2003). „Exprese LRRC4 má potenciál snížit rychlost růstu a tumorigenezi glioblastomové buněčné linie U251.“ AI Zheng. 22 (9): 897–902. PMID 12969517.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LRRC4 bohatý na leucin obsahující 4“.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Nakashiba T, Ikeda T, Nishimura S a kol. (2000). „Netrin-G1: nový savčí netrin spojený s glykosylfosfatidylinositolem, který je funkčně odlišný od klasických netrinů“. J. Neurosci. 20 (17): 6540–50. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-17-06540.2000. PMC 6772945. PMID 10964959.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Lidský chromozom 7: sekvence DNA a biologie“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Lin JC, Ho WH, Gurney A, Rosenthal A (2004). „Netrin-G1 ligand NGL-1 podporuje růst thalamokortikálních axonů“. Nat. Neurosci. 6 (12): 1270–6. doi:10.1038 / nn1148. PMID 14595443. S2CID 28353131.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Zhang Q, Wang J, Fan S a kol. (2005). „Exprese a funkční charakterizace LRRC4, nového mozkově specifického člena nadrodiny LRR“. FEBS Lett. 579 (17): 3674–82. doi:10.1016 / j.febslet.2005.05.058. PMID 15967442. S2CID 19888187.
Zhang QH, Wang LL, Cao L a kol. (2005). "Studie nového mozku relativně specifického genu LRRC4 zapojeného do suprese gliomové tumorigeneze pomocí systému Tet-on". Acta Biochim. Biophys. Hřích. (Šanghaj). 37 (8): 532–40. doi:10.1111 / j.1745-7270.2005.00079.x. PMID 16077900.
Fan SQ, Wang JR, Huang H a kol. (2007). „[Funkce nového mozku specifického genu LRRC4]“. Zhonghua Zhong Liu Za Zhi. 27 (7): 393–6. PMID 16188120.
Zhang QH, Wu MH, Wang LL a kol. (2005). "Profilování rozdílně exprimovaných genů v buňkách nadměrně exprimovaných glioblastomem LRRC4 pomocí cDNA pole". Acta Biochim. Biophys. Hřích. (Šanghaj). 37 (10): 680–7. doi:10.1111 / j.1745-7270.2005.00100.x. PMID 16215635.
Wu M, Huang C, Gan K a kol. (2006). „LRRC4, domnělý tumor supresorový gen, vyžaduje funkční doménu repetitivních kazet bohatou na leucin, aby inhiboval proliferaci gliomových buněk in vitro modulací dráhy extracelulární signální kinázy / proteinové kinázy B / nukleárního faktoru-kappaB“. Mol. Biol. Buňka. 17 (8): 3534–42. doi:10,1091 / mbc.E05-11-1082. PMC 1525233. PMID 16723503.
Wu M, Gan K, Huang C a kol. (2007). "LRRC4 kontroluje in vitro invazi do buněk glioblastomu prostřednictvím inhibice exprese RPTP-zeta". J. Neurooncol. 80 (2): 133–42. doi:10.1007 / s11060-006-9173-6. PMID 16941076. S2CID 30590797.
Wu M, Huang C, Li X a kol. (2007). „LRRC4 inhibuje proliferaci, migraci a angiogenezi glioblastomových buněk snížením regulace exprese a odpovědí pleiotropních cytokinů“. J. Cell. Physiol. 214 (1): 65–74. doi:10.1002 / jcp.21163. PMID 17541939. S2CID 44665033.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9HBW1 (Protein 4 bohatý na leucin s opakováním) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128594 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049939 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12969517-5] Wang JR, Li XL, Fan SQ, Tan C, Xiang JJ, Tang K, Wang R, Li GY (září 2003). „Exprese LRRC4 má potenciál snížit rychlost růstu a tumorigenezi glioblastomové buněčné linie U251.“ AI Zheng. 22 (9): 897–902. PMID 12969517.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: LRRC4 bohatý na leucin obsahující 4“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]