LPXN - LPXN

LPXN
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X3H, 4XEF, 4XEK, 4XEV
Identifikátory
Aliasy	LPXN, LDPL, leupaxin
Externí ID	OMIM: 605390 MGI: 2147677 HomoloGene: 3536 Genové karty: LPXN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	58,578,220 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	12,833,807 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • perinukleární oblast cytoplazmy; • podosomy; • buněčné spojení; • buněčná membrána; • buněčná projekce; • buněčné jádro; • ohnisková adheze; • membrána; • cytosol; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• negativní regulace signální dráhy receptoru B buněk; • negativní regulace buněčné adheze; • buněčná adheze; • regulace buněčné adheze zprostředkované integrinem; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • signální transdukce; • sestava makromolekulárního komplexu; • regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9404
	107321
	ENSG00000110031
	ENSMUSG00000024696
	O60711
	Q99N69
	NM_001143995; NM_001307951; NM_004811
	NM_134152; NM_001361971
	NP_001137467; NP_001294880; NP_004802
	NP_598913; NP_001348900
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Leupaxin je protein že u lidí je kódován LPXN gen.^[5]^[6]

Produkt kódovaný tímto genem je přednostně exprimován v hematopoetických buňkách a je nejvíce homologní s proteinem fokální adheze, paxillinem. Může fungovat při signalizaci specifické pro daný buněčný typ přidružením k PYK2, členu rodiny kinázových ohniskových adhezí. Jako substrát pro tyrosinkinázu v lymfoidních buňkách může tento protein také fungovat a být regulován aktivitou tyrosinkinázy.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110031 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024696 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lipsky BP, Beals CR, Staunton DE (červen 1998). „Leupaxin je nový protein domény LIM, který tvoří komplex s PYK2“. J Biol Chem. 273 (19): 11709–13. doi:10.1074 / jbc.273.19.11709. PMID 9565592.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LPXN leupaxin“.

Další čtení

Chew V, Lam KP (2007). „Leupaxin negativně reguluje signalizaci receptoru B buněk“. J. Biol. Chem. 282 (37): 27181–91. doi:10,1074 / jbc.M704625200. PMID 17640867.
Sahu SN, Nunez S, Bai G, Gupta A (2007). „Interakce Pyk2 a PTP-PEST s leupaxinem v buňkách rakoviny prostaty“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 292 (6): C2288–96. doi:10.1152 / ajpcell.00503.2006. PMID 17329398.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R a kol. (2005). „Kvantitativní analýza fosfoproteomu pomocí dendrimerové konjugační chemie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Nat. Metody. 2 (8): 591–8. doi:10.1038 / nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
Watanabe N, Amano N, Ishizuka H, Mashima K (2005). "Leupaxin se váže na PEST doménu tyrosin fosfatázy PEP". Mol. Buňka. Biochem. 269 (1–2): 13–7. doi:10.1007 / s11010-005-2149-6. PMID 15786712. S2CID 21854825.
Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB a kol. (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Gupta A, Lee BS, Khadeer MA a kol. (2003). „Leupaxin je kritický adaptační protein v adhezní zóně osteoklastů“. J. Bone Miner. Res. 18 (4): 669–85. doi:10.1359 / jbmr.2003.18.4.669. PMID 12674328. S2CID 24743841.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Liu S, Thomas SM, Woodside DG a kol. (2000). „Vazba paxilinu na integriny alfa4 modifikuje biologicky závislé na integrinu“. Příroda. 402 (6762): 676–81. doi:10.1038/45264. PMID 10604475. S2CID 2770368.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110031 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024696 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9565592-5] Lipsky BP, Beals CR, Staunton DE (červen 1998). „Leupaxin je nový protein domény LIM, který tvoří komplex s PYK2“. J Biol Chem. 273 (19): 11709–13. doi:10.1074 / jbc.273.19.11709. PMID 9565592.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: LPXN leupaxin“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]