LPP (gen) - LPP (gene)

LPP
Identifikátory
Aliasy	LPP, LIM doména obsahující preferovaného translokačního partnera v lipomu
Externí ID	OMIM: 600700 MGI: 2441849 HomoloGene: 4075 Genové karty: LPP
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	188,890,671 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	24,992,578 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• buněčné spojení; • buněčná membrána; • membrána; • buněčné jádro; • ohnisková adheze; • cytoplazma; • cytosol; • stresové vlákno;
Biologický proces	• buněčná adheze; • biologický proces; • buněčná adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4026
	210126
	ENSG00000145012
	ENSMUSG00000033306
	Q93052
	Q8BFW7
NM_001167671; NM_001167672; NM_005578; NM_001375455; NM_001375456;
	NM_001375457; NM_001375458; NM_001375459; NM_001375460; NM_001375461; NM_001375462; NM_001375463; NM_001375464; NM_001375465
	NM_001145952; NM_001145954; NM_178665
NP_001161143; NP_001161144; NP_005569; NP_001362384; NP_001362385;
	NP_001362386; NP_001362387; NP_001362388; NP_001362389; NP_001362390; NP_001362391; NP_001362392; NP_001362393; NP_001362394
	NP_001139424; NP_001139426; NP_848780
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Lipoma preferovaný partner je protein že u lidí je kódován LPP gen.^[5]^[6]

Funkce

Lipom preferovaný partner je podčeleď LIM doména proteiny, které se vyznačují an N-terminál region bohatý na prolin a tři C-terminál LIM domén. Kódovaný protein se lokalizuje na periferní buňku v ohniskových adhezích a může se podílet na buněčnébuněčná adheze a pohyblivost buněk. Tento protein také prochází jádrem a může fungovat jako transkripční koaktivátor. Tento gen se nachází na spojnici určitých chromozomálních translokací souvisejících s onemocněním, které vedou k expresi fúzní proteiny které mohou podporovat růst nádorů.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145012 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033306 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Petit MM, Mols R, Schoenmakers EF, Mandahl N, Van de Ven WJ (únor 1997). „LPP, preferovaný gen fúzního partnera HMGIC v lipomech, je novým členem rodiny proteinových genů LIM“. Genomika. 36 (1): 118–29. doi:10.1006 / geno.1996.0432. PMID 8812423.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LPP LIM doména obsahující preferovaného translokačního partnera v lipomu“.

Další čtení

Schoenmakers EF, Wanschura S, Mols R a kol. (1995). „Opakované přesmyky v genu pro proteinovou skupinu s vysokou mobilitou, HMGI-C, u benigních mezenchymálních nádorů“. Nat. Genet. 10 (4): 436–44. doi:10.1038 / ng0895-436. PMID 7670494. S2CID 29935721.
Petit MM, Swarts S, Bridge JA, Van de Ven WJ (1998). "Exprese recipročních fúzních transkriptů genů HMGIC a LPP v parostálním lipomu". Genetika rakoviny. Cytogenet. 106 (1): 18–23. doi:10.1016 / S0165-4608 (98) 00038-7. PMID 9772904.
Petit MM, Fradelizi J, Golsteyn RM a kol. (2000). „LPP, aktinový cytoskeletový protein související se zyxinem, zajišťuje jaderný exportní signální a transkripční aktivační kapacitu“. Mol. Biol. Buňka. 11 (1): 117–29. doi:10,1091 / mbc.11.1.117. PMC 14761. PMID 10637295.
Rogalla P, Lemke I, Kazmierczak B, Bullerdiek J (2001). „Stejný fúzní transkript HMGIC-LPP je důsledně exprimován v plicních chondroidních hamartomech s t (3; 12) (q27-28; q14-15).“ Geny Chromozomy Rakovina. 29 (4): 363–6. doi:10.1002 / 1098-2264 (2000) 9999: 9999 <1 :: AID-GCC1043> 3.0.CO; 2-N. PMID 11066083.
Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S a kol. (2001). "Vytvoření knihoven exprese proteinů v celém genomu pomocí náhodné aktivace genové exprese". Nat. Biotechnol. 19 (5): 440–5. doi:10.1038/88107. PMID 11329013. S2CID 25064683.
Dahéron L, Veinstein A, Brizard F a kol. (2001). „Lidský gen LPP je fúzován s MLL při sekundární akutní leukémii s t (3; 11) (q28; q23)“. Geny Chromozomy Rakovina. 31 (4): 382–9. doi:10,1002 / gcc.1157. PMID 11433529. S2CID 32921978.
Lemke I, Rogalla P, Bullerdiek J (2002). „Nový fúzní gen LPP naznačuje klíčovou roli zkrácených proteinů LPP v lipomech a plicních chondroidních hamartomech.“ Cytogenet. Cell Genet. 95 (3–4): 153–6. doi:10.1159/000059338. PMID 12063392. S2CID 42951388.
Petit MM, Meulemans SM, Van de Ven WJ (2003). „Ohnisková adheze a schopnost jaderného cílení proteinu preferovaného partnera lipomu s obsahem LIM (LPP)“. J. Biol. Chem. 278 (4): 2157–68. doi:10,1074 / jbc.M206106200. PMID 12441356.
Lemke I, Rogalla P, Grundmann F a kol. (2003). "Exprese fúzního transkriptu HMGA2-LPP pouze u 1 ze 61 karyotypicky normálních plicních chondroidních hamartomů". Genetika rakoviny. Cytogenet. 138 (2): 160–4. doi:10.1016 / S0165-4608 (02) 00595-2. PMID 12505264.
Salomon AR, Ficarro SB, Brill LM a kol. (2003). „Profilování drah fosforylace tyrosinu v lidských buňkách pomocí hmotnostní spektrometrie“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (2): 443–8. doi:10.1073 / pnas.2436191100. PMC 141014. PMID 12522270.
Li B, Zhuang L, Reinhard M, Trueb B (2003). „Lipom preferovaný partner LPP interaguje s alfa-aktininem“. J. Cell Sci. 116 (Pt 7): 1359–66. doi:10.1242 / jcs.00309. PMID 12615977.
Gorenne I, Nakamoto RK, Phelps CP a kol. (2003). "LPP, protein LIM vysoce vyjádřený v hladkém svalu". Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 285 (3): C674–85. doi:10.1152 / ajpcell.00608.2002. PMID 12760907.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB a kol. (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Petit MM, Meulemans SM, Alen P a kol. (2006). „Nádorový supresor Scrib interaguje s proteinem LPP souvisejícím se zyxiny, který se pohybuje mezi místy adheze buněk a jádrem“. BMC Cell Biol. 6 (1): 1. doi:10.1186/1471-2121-6-1. PMC 546208. PMID 15649318.
Zhang Y, Wolf-Yadlin A, Ross PL a kol. (2005). „Časově rozlišená hmotnostní spektrometrie míst fosforylace tyrosinu v signální síti receptoru epidermálního růstového faktoru odhaluje dynamické moduly“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (9): 1240–50. doi:10,1074 / mcp.M500089-MCP200. PMID 15951569.
Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R a kol. (2005). „Kvantitativní analýza fosfoproteomu pomocí dendrimerové konjugační chemie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Nat. Metody. 2 (8): 591–8. doi:10.1038 / nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
von Ahsen I, Rogalla P, Bullerdiek J (2006). "Expresní vzorce fúzního transkriptu LPP-HMGA2 v plicních chondroidních hamartomech s t (3; 12) (q27 přibližně 28; q14 přibližně 15)". Genetika rakoviny. Cytogenet. 163 (1): 68–70. doi:10.1016 / j.cancergencyto.2005.02.023. PMID 16271958.
Kubo T, Matsui Y, Goto T a kol. (2006). „Nadexprese fúzních transkriptů HMGA2-LPP podporuje expresi kolagenového genu alfa 2 typu XI“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 340 (2): 476–81. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.12.042. PMID 16375854.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145012 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033306 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8812423-5] Petit MM, Mols R, Schoenmakers EF, Mandahl N, Van de Ven WJ (únor 1997). „LPP, preferovaný gen fúzního partnera HMGIC v lipomech, je novým členem rodiny proteinových genů LIM“. Genomika. 36 (1): 118–29. doi:10.1006 / geno.1996.0432. PMID 8812423.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: LPP LIM doména obsahující preferovaného translokačního partnera v lipomu“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]