LMO7 - LMO7

LMO7
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EAQ
Identifikátory
Aliasy	LMO7, FBX20, FBXO20, LOMP, LIM doména 7, LMO7b
Externí ID	OMIM: 604362 MGI: 1353586 HomoloGene: 83924 Genové karty: LMO7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	75,859,870 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	101,934,710 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • komplex ubikvitin ligázy; • buněčné jádro; • ohnisková adheze; • cytosol; • jaderný obal; • povrch buňky; • apikální plazmatická membrána;
Biologický proces	• regulace buněčné adheze; • ubikvitinace bílkovin; • regulace signalizace; • polyubikvitinace bílkovin; • posttranslační modifikace; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4008
	380928
	ENSG00000136153
	ENSMUSG00000033060
	Q8WWI1
	n / a
	NM_001306080; NM_005358; NM_015842; NM_015843; NM_001330583
	NM_201529; NM_001347628
NP_001293009; NP_001317512; NP_005349; NP_056667; NP_001353561;
	NP_001353562; NP_001353563; NP_001353565; NP_001293009.1
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

LIM doména pouze protein 7 je protein že u lidí je kódován LMO7 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje protein obsahující a kalponin homologická (CH) doména, a Doména PDZ a LIM doména. F-box (FBX) doména je přítomna v alternativních variantách sestřihu. Členové rodiny proteinů LIM nesou doménu LIM, jedinečnou doménu vázající zinek bohatou na cystein. Členové FBX protein rodina se účastní interakcí protein-protein. Kódovaný protein může být zapojen do interakcí protein-protein. Bylo popsáno několik alternativních variant sestřihu, ale jejich sekvence v plné délce nebyly stanoveny.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136153 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033060 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Putilina T, Jaworski C, Gentleman S, McDonald B, Kadiri M, Wong P (prosinec 1998). „Analýza lidské cDNA obsahující tkáňově specifickou alternativně sestříhanou LIM doménu“. Biochem Biophys Res Commun. 252 (2): 433–9. doi:10.1006 / bbrc.1998.9656. PMID 9826547.
^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (prosinec 1999). "Identifikace rodiny lidských proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LMO7 LIM doména 7“.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (6): 355–64. doi:10.1093 / dnares / 5.6.355. PMID 10048485.
Rozenblum E, Vahteristo P, Sandberg T a kol. (2002). „Genomová mapa 6 Mb oblasti na 13q21-q22 implikovaná ve vývoji rakoviny: identifikace a charakterizace kandidátních genů“. Hučení. Genet. 110 (2): 111–21. doi:10.1007 / s00439-001-0646-6. PMID 11935316.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Smith FD, Stark C a kol. (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Benzinger A, Muster N, Koch HB a kol. (2005). „Cílená proteomická analýza 14-3-3 sigma, efektoru p53 běžně umlčeného při rakovině“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (6): 785–95. doi:10,1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Kim J, Bhinge AA, Morgan XC, Iyer VR (2005). "Mapování interakcí DNA-protein ve velkých genomech analýzou sekvenčních značek genomového obohacení". Nat. Metody. 2 (1): 47–53. doi:10.1038 / nmeth726. PMID 15782160.
Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). "Globální fosfoproteom buněk HT-29 humánního adenokarcinomu tlustého střeva". J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. doi:10.1021 / pr050048h. PMID 16083285.
Iwabuchi K, Kaneko T, Kikuyama M (2006). „Iontový mechanismus mechanického vnímání v Characeae“. Plant Cell Physiol. 46 (11): 1863–71. doi:10.1093 / pcp / pci204. PMID 16192285.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243.
Holaska JM, Rais-Bahrami S, Wilson KL (2007). „Lmo7 je protein vázající emerin, který reguluje transkripci emerinu a mnoha dalších genů relevantních pro svaly“. Hučení. Mol. Genet. 15 (23): 3459–72. doi:10,1093 / hmg / ddl423. PMID 17067998.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136153 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033060 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9826547-5] Putilina T, Jaworski C, Gentleman S, McDonald B, Kadiri M, Wong P (prosinec 1998). „Analýza lidské cDNA obsahující tkáňově specifickou alternativně sestříhanou LIM doménu“. Biochem Biophys Res Commun. 252 (2): 433–9. doi:10.1006 / bbrc.1998.9656. PMID 9826547.

[pmid10531035-6] Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (prosinec 1999). "Identifikace rodiny lidských proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: LMO7 LIM doména 7“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]