LIME1 - LIME1

LIME1
Identifikátory
Aliasy	LIME1, LIME, LP8067, dJ583P15.4, Lck interagující transmembránový adaptér 1
Externí ID	OMIM: 609809 MGI: 1919949 HomoloGene: 56785 Genové karty: LIME1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	63,739,103 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	181,383,628 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba protein kinázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • membrána; • extracelulární; • Spliceozomální komplex uvolňující post-mRNA typu U2; • Komplex receptorů B buněk;
Biologický proces	• Signální dráha receptoru B buněk; • Signální dráha receptoru T buněk; • adaptivní imunitní odpověď; • proces imunitního systému; • demontáž spliceozomálního komplexu; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • regulace aktivity MAP kinázy; • regulace uvolňování sekvestrovaného iontu vápníku do cytosolu; • regulace signalizace NIK / NF-kappaB;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54923
	72699
	ENSG00000203896
	ENSMUSG00000090077
	Q9H400
	Q9EQR5
	NM_017806; NM_001305654; NM_001305655
	NM_023684
	NP_001292583; NP_001292584; NP_060276
	NP_076173
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Lck interagující transmembránový adaptér 1 je protein že u lidí je kódován LIME1 gen.^[5]^[6]

LIME1 je transmembránový adaptér spojený s raftem fosfoprotein to je přednostně vyjádřeno v hemopoetický buňky T buňky (Brdičková a kol., 2003; Hur a kol., 2003). [Dodáváno společností OMIM]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000203896 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000090077 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (prosinec 2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LIME1 Lck interagující transmembránový adaptér 1“.

Další čtení

Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Hur EM, Son M, Lee OH a kol. (2004). „LIME, nový transmembránový adaptérový protein, sdružuje se s p56lck a zprostředkovává aktivaci T buněk“. J. Exp. Med. 198 (10): 1463–73. doi:10.1084 / jem.20030232. PMC 2194117. PMID 14610044.
Brdicková N, Brdicka T, Angelisová P, et al. (2004). „LIME: New Membrane Raft-associated Adapter Protein Involve in CD4 and CD8 Coreceptor Signaling“. J. Exp. Med. 198 (10): 1453–62. doi:10.1084 / jem.20031484. PMC 2194115. PMID 14610046.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových regionech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wan D, Gong Y, Qin W a kol. (2004). „Rozsáhlý screening transfekce cDNA na geny související s vývojem a progresí rakoviny“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (44): 15724–9. doi:10.1073 / pnas.0404089101. PMC 524842. PMID 15498874.
Tedoldi S, Paterson JC, Hansmann ML a kol. (2006). „Transmembránové molekuly adaptéru: nová kategorie markerů lymfoidních buněk“. Krev. 107 (1): 213–21. doi:10.1182 / krev-2005-06-2273. PMID 16160011.
Ahn E, Lee H, Yun Y (2006). "LIME funguje jako transmembránový adaptér zprostředkující aktivaci B-buněk závislých na BCR." Krev. 107 (4): 1521–7. doi:10.1182 / krev-2005-05-1859. PMID 16249387.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000203896 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000090077 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12477932-5] Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (prosinec 2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: LIME1 Lck interagující transmembránový adaptér 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]