LARP1 - LARP1

LARP1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyLARP1, LARP, člen rodiny domén La ribonukleoproteinů 1, La ribonukleoprotein 1, translační regulátor, Lar1, Lhp1
Externí IDOMIM: 612059 MGI: 1890165 HomoloGene: 9089 Genové karty: LARP1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 5 (lidský)
Chr.Chromozom 5 (lidský)[1]
Chromozom 5 (lidský)
Genomické umístění pro LARP1
Genomické umístění pro LARP1
Kapela5q33.2Start154,712,843 bp[1]
Konec154,817,605 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE LARP1 212193 s na fs.png

PBB GE LARP1 212137 na fs.png

PBB GE LARP1 210966 x na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

23367

73158

Ensembl

ENSG00000155506

ENSMUSG00000037331

UniProt

Q6PKG0

Q6ZQ58

RefSeq (mRNA)

NM_028451

RefSeq (protein)

NP_082727

Místo (UCSC)Chr 5: 154,71 - 154,82 MbChr 11: 58,01 - 58,06 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein související s La (LARP1) je 150 kDa protein že u lidí je kódován LARP1 gen.[5][6][7] LARP1 je nový cíl savčího cíle signální dráhy komplexu rapamycinového komplexu 1 (mTORC1), což je obvod často hyperaktivovaný u rakoviny, který reguluje buněčný růst a proliferaci primárně regulací syntézy proteinů.[8]

Funkce

LARP1 je největší ze 7členné rodiny proteinů LARP (další jsou: LARP1B, LARP3 (neboli originální La nebo SSB), LARP4A, LARP4B, LARP6 a LARP7).[9] Všechny proteiny LARP, včetně lidských LARP, obsahují 2 konzervované oblasti. První konzervovaná oblast sdílí homologii s La proteiny (nazývá se La motiv, viz SSB ) zatímco druhá konzervovaná oblast (nazývaná LA- motiv) je omezena na proteiny LARP. LARP1 a 1B také obsahují konzervovanou „oblast DM15“ na svém C-konci.[10] Tato oblast je jedinečná a bylo prokázáno, že je nutná pro vazbu RNA. Myš Larp1 je vyjádřena v hřbetní kořenová ganglia a mícha, stejně jako při vývoji orgánů charakterizovaných epiteliální -mezenchymální interakce.[6] Lidský LARP1 je přítomen v nízkých hladinách v normálních, embryonálních buňkách, ale je vysoce exprimován v epiteliálních rakovinách (jako jsou rakoviny vaječníků, kolorektální karcinom, prostata, nemalobuněčné plicní, hepatocelulární a cervikální karcinomy).[11][12][13][14] Některé studie ukázaly, že vysoké hladiny proteinu LARP1 korelují s horší prognózou u pacientů s rakovinou.[15][16]

LARP1 se váže na a reguluje translaci terminálního motivu oligopyrimidinu (TOP mRNA ) a mohou přímo komunikovat s 5 'čepice mRNA.[17][18] Bylo také prokázáno, že interaguje s 3 'koncovými a kódujícími oblastmi (CDS) jiných genů.[17] Protein LARP1 se kolokalizuje s stresové granule a P-těla,[19] které fungují při ukládání a degradaci RNA. Bylo navrženo, aby LARP1 fungoval v P-těla zmírnit hojnost konzervovaných Ras -MAPK mRNA. Shluk homologů LARP1 může fungovat tak, aby řídil expresi klíčových vývojových regulátorů.[19]

Několik studií prokázalo, že nedostatek LARP1 selektivně ovlivňuje nábor TOP mRNA do polysomů [Je zapotřebí reference]. V některých rakovinných buňkách nedostatek LARP1 snižuje proliferaci a aktivuje apoptotickou buněčnou smrt.[13] I když bylo v buňkách umlčených LARP1 hlášeno snížení množství proteinů kódovaných TOP mRNA, někteří vědci se domnívají, že to lze vysvětlit jednoduše sníženým počtem transkriptů TOP mRNA v buňkách s nedostatkem LARP1.

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000155506 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037331 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (říjen 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID  9872452.
  6. ^ A b Chauvet S, Maurel-Zaffran C, Miassod R, Jullien N, Pradel J, Aragnol D (červenec 2000). „dlarp, ​​nový kandidátský Hoxův cíl ​​v Drosophile, jehož ortolog u myši je exprimován v místech interakcí epitel / mezenchymál“. Dynamika vývoje. 218 (3): 401–13. doi:10.1002 / 1097-0177 (200007) 218: 3 <401 :: AID-DVDY1009> 3.0.CO; 2-6. PMID  10878606.
  7. ^ „Entrez Gene: LARP1 La ribonukleoproteinová doménová rodina, člen 1“.
  8. ^ Tcherkezian J, Cargnello M, Romeo Y, Huttlin EL, Lavoie G, Gygi SP, Roux PP (únor 2014). „Proteomická analýza překladu závislého na čepici identifikuje LARP1 jako klíčový regulátor translace 5'TOP mRNA“. Genes Dev. 28 (4): 357–71. doi:10.1101 / gad.231407.113. PMC  3937514. PMID  24532714.
  9. ^ Bousquet-Antonelli C, Deragon JM (květen 2009). „Komplexní analýza nadrodiny proteinů La-motiv“. RNA. 15 (5): 750–64. doi:10.1261 / rna.1478709. PMC  2673062. PMID  19299548.
  10. ^ Lahr RM, Mack SM, Héroux A, Blagden SP, Bousquet-Antonelli C, Deragon JM, Berman AJ (září 2015). „La-příbuzný protein 1-specifická doména repuruje HEAT-like repetic k přímé vazbě na 5'TOP sekvenci“. Výzkum nukleových kyselin. 43 (16): 8077–88. doi:10.1093 / nar / gkv748. PMC  4652764. PMID  26206669.
  11. ^ Stavraka C, Blagden S (říjen 2015). „Proteiny související s La, rodina spojená s rakovinou“. Biomolekuly. 5 (4): 2701–22. doi:10,3390 / biom5042701. PMC  4693254. PMID  26501340.
  12. ^ Mura M, Hopkins TG, Michael T, Abd-Latip N, Weir J, Aboagye E, Mauri F, Jameson C, Sturge J, Gabra H, Bushell M, Willis AE, Curry E, Blagden SP (září 2015). „LARP1 post-transkripčně reguluje mTOR a přispívá k progresi rakoviny“. Onkogen. 34 (39): 5025–36. doi:10.1038 / dne 2014.428. PMC  4430325. PMID  25531318.
  13. ^ A b Hopkins TG, Mura M, Al-Ashtal HA, Lahr RM, Abd-Latip N, Sweeney K a kol. (Únor 2016). „Protein vázající RNA LARP1 je post-transkripční regulátor přežití a tumorigeneze u rakoviny vaječníků“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (3): 1227–46. doi:10.1093 / nar / gkv1515. PMC  4756840. PMID  26717985.
  14. ^ Xie C, Huang L, Xie S, Xie D, Zhang G, Wang P, Peng L, Gao Z (říjen 2013). „LARP1 předpovídá prognózu hepatocelulárního karcinomu v raném stadiu a AFP“. Journal of Translational Medicine. 11: 272. doi:10.1186/1479-5876-11-272. PMC  3814951. PMID  24159927.
  15. ^ Ye L, Lin ST, Mi YS, Liu Y, Ma Y, Sun HM, Peng ZH, Fan JW (listopad 2016). „Nadměrná exprese LARP1 předpovídá špatnou prognózu kolorektálního karcinomu a očekává se, že bude potenciálním terapeutickým cílem“. Biologie nádorů. 37 (11): 14585–14594. doi:10.1007 / s13277-016-5332-3. PMC  5126195. PMID  27614686.
  16. ^ Xu Z, Xu J, Lu H, Lin B, Cai S, Guo J, Zang F, Chen R (prosinec 2017). „LARP1 je regulován osou XIST / miR-374a a funguje jako onkogen u nemalobuněčného karcinomu plic“. Zprávy o onkologii. 38 (6): 3659–3667. doi:10.3892 / nebo 2017.6040. PMID  29039571.
  17. ^ A b Hong S, Freeberg MA, Han T, Kamath A, Yao Y, Fukuda T, Suzuki T, Kim JK, Inoki K (červen 2017). „LARP1 funguje jako molekulární přepínač pro translaci základní třídy mRNA zprostředkovanou mTORC1“. eLife. 6. doi:10,7554 / elife. 25237. PMC  5484620. PMID  28650797.
  18. ^ Lahr RM, Fonseca BD, Ciotti GE, Al-Ashtal HA, Jia JJ, Niklaus MR, Blagden SP, Alain T, Berman AJ (duben 2017). „Protein 1 související s La (LARP1) váže víčko mRNA a blokuje sestavu eIF4F na TOP mRNA“. eLife. 6. doi:10,7554 / elife.24146. PMC  5419741. PMID  28379136.
  19. ^ A b Nykamp K, Lee MH, Kimble J (červenec 2008). „Protein související s La elegans La, LARP-1, se lokalizuje na zárodečná těla P a zeslabuje signalizaci Ras-MAPK během oogeneze“. RNA. 14 (7): 1378–89. doi:10,1261 / rna.1066008. PMC  2441978. PMID  18515547.

Další čtení