KREMEN1 - KREMEN1

KREMEN1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5 FWS, 5 FWT, 5FWV
Identifikátory
Aliasy	KREMEN1KREMEN, KRM1, kringle obsahující transmembránový protein 1, ECTD13
Externí ID	OMIM: 609898 MGI: 1933988 HomoloGene: 12935 Genové karty: KREMEN1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	29,168,333 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	5,261,558 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • tělo neuronových buněk;
Biologický proces	• regulace kanonické signální dráhy Wnt; • buněčná komunikace; • Wnt signální cesta; • apoptotický proces; • negativní regulace osifikace; • vývoj končetin; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • negativní regulace regenerace axonů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	83999
	84035
	ENSG00000183762
	ENSMUSG00000020393
	Q96MU8
	Q99N43
	NM_001039570; NM_032045; NM_153379
	NM_032396
	NP_001034659; NP_114434
	NP_115772
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kremen protein 1 je protein že u lidí je kódován KREMEN1 gen.^[5]^[6] Kremen1 je konzervován u strunatců včetně amphioxus^[7] a většina druhů obratlovců.^[8] Protein je transmembránový receptor typu I ligandů Dickkopf1,^[9] Dickkopf2, Dickkopf3, Dickkopf4, EpCAM^[10] a Rspondin1.

Funkce

Tento gen kóduje vysokoafinitní transmembránový receptor dickkopf homologu 1 (DKK1), který funkčně spolupracuje s DKK1 při blokování signalizace bez křídel (WNT) / beta-katenin. Kódovaný protein je součástí membránového komplexu, který moduluje kanonickou signalizaci WNT prostřednictvím proteinu 6 souvisejícího s lipoproteinovými receptory (LRP6). Obsahuje extracelulární kringle, WSC a CUB domény. Alternativně byly u tohoto genu pozorovány sestřižené varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[6]

Kremen1 má také funkci při indukci buněčné smrti apoptózou.^[8] Tato proapototická aktivita je podmíněná a závisí na nepřítomnosti ligandu Dickkopf1.^[8] Tato pozorování vedla ke klasifikaci tohoto proteinu jako a Receptor závislosti.

Vyřazení myši z Kremen1 a jeho paralogu Kremen2 je životaschopné a plodné.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183762 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020393 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nakamura T, Aoki S, Kitajima K, Takahashi T, Matsumoto K, Nakamura T (březen 2001). „Molekulární klonování a charakterizace Kremen, nového transmembránového proteinu obsahujícího kringle“. Biochim Biophys Acta. 1518 (1–2): 63–72. doi:10.1016 / s0167-4781 (01) 00168-3. PMID 11267660.
^ ^A ^b „Entrez Gene: KREMEN1 kringle obsahující transmembránový protein 1“.
^ Zhang, Yujun; Mao, Bingyu (01.09.2010). „Embryonální exprese a evoluční analýza genů rodiny Amphioxus Dickkopf a Kremen“. Journal of Genetics and Genomics = Yi Chuan Xue Bao. 37 (9): 637–645. doi:10.1016 / S1673-8527 (09) 60082-5. ISSN 1673-8527. PMID 20933216.
^ ^A ^b ^C Causeret, F .; Sumia, I .; Pierani, A. (2016-02-01). „Kremen1 a Dickkopf1 kontrolují přežití buněk způsobem nezávislým na Wnt“. Buněčná smrt a diferenciace. 23 (2): 323–332. doi:10.1038 / cdd.2015.100. ISSN 1476-5403. PMC 4716294. PMID 26206087.
^ Mao, Bingyu; Wu, Wei; Davidson, Gary; Marhold, Joachim; Li, Mingfa; Mechler, Bernard M .; Delius, Hajo; Hoppe, Dana; Stannek, Peter (06.06.2002). „Kremenské proteiny jsou receptory Dickkopf, které regulují signalizaci Wnt / beta-katenin“. Příroda. 417 (6889): 664–667. doi:10.1038 / příroda756. ISSN 0028-0836. PMID 12050670.
^ Lu, Huiqiang; Ma, červen; Yang, Yun; Shi, Wenchao; Luo, Lingfei (11.03.2013). „EpCAM je endodermově specifický derepresor Wnt, který povoluje vývoj jater“. Vývojová buňka. 24 (5): 543–553. doi:10.1016 / j.devcel.2013.01.021. ISSN 1878-1551. PMID 23484855.
^ Ellwanger, Kristina; Saito, Hiroaki; Clément-Lacroix, Philippe; Maltry, Nicole; Niedermeyer, Joachim; Lee, Woon Kyu; Baron, Roland; Rawadi, Georges; Westphal, Heiner (2008-08-01). „Cílené narušení Wnt regulátoru Kremen vyvolává defekty končetin a vysokou hustotu kostí“. Molekulární a buněčná biologie. 28 (15): 4875–4882. doi:10.1128 / MCB.00222-08. ISSN 1098-5549. PMC 2493355. PMID 18505822.

Další čtení

Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mao B, Wu W, Davidson G a kol. (2002). „Kremenské proteiny jsou receptory Dickkopf, které regulují signalizaci Wnt / beta-katenin“. Příroda. 417 (6889): 664–7. doi:10.1038 / příroda756. PMID 12050670.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183762 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020393 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11267660-5] Nakamura T, Aoki S, Kitajima K, Takahashi T, Matsumoto K, Nakamura T (březen 2001). „Molekulární klonování a charakterizace Kremen, nového transmembránového proteinu obsahujícího kringle“. Biochim Biophys Acta. 1518 (1–2): 63–72. doi:10.1016 / s0167-4781 (01) 00168-3. PMID 11267660.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: KREMEN1 kringle obsahující transmembránový protein 1“.

[7] Zhang, Yujun; Mao, Bingyu (01.09.2010). „Embryonální exprese a evoluční analýza genů rodiny Amphioxus Dickkopf a Kremen“. Journal of Genetics and Genomics = Yi Chuan Xue Bao. 37 (9): 637–645. doi:10.1016 / S1673-8527 (09) 60082-5. ISSN 1673-8527. PMID 20933216.

[:0-8] A ^b ^C Causeret, F .; Sumia, I .; Pierani, A. (2016-02-01). „Kremen1 a Dickkopf1 kontrolují přežití buněk způsobem nezávislým na Wnt“. Buněčná smrt a diferenciace. 23 (2): 323–332. doi:10.1038 / cdd.2015.100. ISSN 1476-5403. PMC 4716294. PMID 26206087.

[9] Mao, Bingyu; Wu, Wei; Davidson, Gary; Marhold, Joachim; Li, Mingfa; Mechler, Bernard M .; Delius, Hajo; Hoppe, Dana; Stannek, Peter (06.06.2002). „Kremenské proteiny jsou receptory Dickkopf, které regulují signalizaci Wnt / beta-katenin“. Příroda. 417 (6889): 664–667. doi:10.1038 / příroda756. ISSN 0028-0836. PMID 12050670.

[10] Lu, Huiqiang; Ma, červen; Yang, Yun; Shi, Wenchao; Luo, Lingfei (11.03.2013). „EpCAM je endodermově specifický derepresor Wnt, který povoluje vývoj jater“. Vývojová buňka. 24 (5): 543–553. doi:10.1016 / j.devcel.2013.01.021. ISSN 1878-1551. PMID 23484855.

[11] Ellwanger, Kristina; Saito, Hiroaki; Clément-Lacroix, Philippe; Maltry, Nicole; Niedermeyer, Joachim; Lee, Woon Kyu; Baron, Roland; Rawadi, Georges; Westphal, Heiner (2008-08-01). „Cílené narušení Wnt regulátoru Kremen vyvolává defekty končetin a vysokou hustotu kostí“. Molekulární a buněčná biologie. 28 (15): 4875–4882. doi:10.1128 / MCB.00222-08. ISSN 1098-5549. PMC 2493355. PMID 18505822.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]