Jonathan Eisen - Jonathan Eisen

Jonathan Eisen
Jonathan Eisen - PLOS Biology desáté výročí (oříznuto) .png
Eisen v roce 2013
narozený
Jonathan Andrew Eisen

(1968-08-31) 31. srpna 1968 (věk 52)
Národnostamerický
Alma mater
Známý jako
Ocenění
Vědecká kariéra
Pole
Instituce
TezeVývoj genů, proteinů a procesů opravy DNA  (1998)
Doktorský poradcePhilip Hanawalt
webová stránkawww.genomecenter.ucdavis.edu/lidé/ jaeisen

Jonathan Andrew Eisen (narozen 31. srpna 1968)[5] je americký evoluční biolog, v současné době pracuje v University of California, Davis.[6][7] Jeho akademický výzkum je v oborech evoluční biologie, genomika a mikrobiologie a je akademickým šéfredaktorem otevřený přístup časopis PLOS Biology.[8][9][10][11][12]

Vzdělávání

Eisen dokončil vysokoškolské studium na Harvardská vysoká škola v roce 1990 vydělával AB v biologii.[13] Promoval jako doktor filozofie z Stanfordská Univerzita v roce 1998 s prací o vývoji DNA opravných genů, proteinů a procesů v roce 1998, pod vedením Philip Hanawalt.[14]

Výzkum

Eisen vystupoval v komiksu od Jorge Cham Při příležitosti Týden otevřeného přístupu 2012.

Eisenův výzkum[4][15][16] se zaměřuje na původ novosti, na to, jak vznikají nové procesy a funkce v živých věcech. Při studiu se zaměřuje na sekvenování a analýzu genomů organismů, zejména mikrobů a jejich použití fylogenomické analýza.

V roce 2011 byl Eisen oceněn Cena Benjamina Franklina (bioinformatika) za podporu otevřeného přístupu v biologických vědách.[17]

Eisen spolu s Nick Barton, Derek E.G. Briggs, David B. Goldstein a Nipam H. Patel je autorem vysokoškolské učebnice, Vývoj, který integruje molekulární biologii, genomiku a lidskou genetiku s tradičními evolučními studiemi.[1] Podle Google Scholar[4] jeho nejcitovanější recenzované práce jsou o genomové sekvenci Plasmodium falciparum,[18] sekvenování Sargasové moře[19] a referát o genomu Thermotoga maritima.[20]

Před prací v UC Davis působil jako vyšetřovatel ve společnosti Institut pro genomický výzkum.

Eisen a jeho práce jsou běžně diskutovány ve vědeckém a populárním tisku. Jako příklady lze uvést článek New York Times o Genomické encyklopedii bakterií a Archea v roce 2009[21] a rozsáhlé pokrytí prací na hledání „čtvrté domény“ života.[22][23] Kromě toho se o práci na blogování a mikroblogování Eisen často píše, například včetně.[24][25][26] Jeho bratr Michael Eisen je také biolog.

Ceny a vyznamenání

Eisen byl oceněn Cena Benjamina Franklina (bioinformatika) v roce 2011 a Časopis Esquire Nejlepší a nejjasnější v roce 2002.[27] Získal cenu Walter J. Gores Award, cenu fakulty za vynikající výsledky ve výuce.[2] Byl zvolen Fellow na Americká společnost pro mikrobiologii (FAAM).[3]

Reference

  1. ^ A b Nipam H. Patel; Barton, Nicholas John; Derek E. G. Briggs; Eisen, Jonathan; Goldstein, David I. (2007). Vývoj. Plainview, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press. ISBN  978-0-87969-684-9.
  2. ^ A b Kancelář univerzitního registrátora - ceny Waltera J. Gorese Studentské záležitosti
  3. ^ A b http://www.ucdmc.ucdavis.edu/publish/news/leadership/6291 UC DAVIS PROFESSOR NÁZVOVÁN AMERICKÁ AKADEMIE MIKROBIOLOGIE FELLOW
  4. ^ A b C Jonathan A. Eisen publikace indexované podle Google Scholar Upravte to na Wikidata
  5. ^ Gegger, Laura (24. prosince 2012). „To bylo pár jejich oblíbených věcí“. The New York Times. Jonathan Eisen: 44 let, evoluční biolog, University of California, Davis a šéfredaktor akademie PLoS Biology
  6. ^ http://phylogenomics.wordpress.com Web pro laboratoř Jonathana A. Eisena
  7. ^ http://phylogenomics.blogspot.com Blog Jonathana Eisena, Strom života
  8. ^ Eisen, J. A. (2008). „PLoS Biology 2.0“. PLoS Biology. 6 (2): e48. doi:10.1371 / journal.pbio.0060048. PMC  2253640. PMID  18303952.
  9. ^ „Nová doména života: Spousta dalších brouků v moři, The Economist“. 24. března 2011. Citováno 9. června 2011. článek o Jonathanu Eisenovi v Ekonom
  10. ^ Eisen, publikace Jonathana A. indexováno podle Scopus bibliografická databáze. (vyžadováno předplatné)
  11. ^ Arabidopsis Genome Initiative, I. (2000). „Analýza genomové sekvence kvetoucí rostliny Arabidopsis thaliana“. Příroda. 408 (6814): 796–815. Bibcode:2000Natur.408..796T. doi:10.1038/35048692. PMID  11130711.
  12. ^ Jonathan Eisen: Seznamte se se svými mikroby (TEDMED 2012)
  13. ^ "Jonathan Eisen» fakulta ". UC Davis Genome Center. Citováno 25. ledna 2015.
  14. ^ Eisen, Jonathan Andrew (1998). Vývoj genů, proteinů a procesů opravy DNA (Disertační práce). Stanfordská Univerzita.
  15. ^ Seznam publikací z Microsoft Academic
  16. ^ Jonathan A. Eisen na DBLP Bibliografický server Upravte to na Wikidata
  17. ^ Zaměstnanci Bio-IT World (15. března 2011). „UC Davis 'Jonathan Eisen vyhrál Cenu Benjamina Franklina 2011“. Svět bio-IT. Citováno 23. března 2011.
  18. ^ Gardner, M. J .; Hall, N .; Fung, E .; White, O .; Berriman, M .; Hyman, R. W .; Carlton, J. M .; Pain, A .; Nelson, K.E .; Bowman, S .; Paulsen, I. T .; James, K .; Eisen, J. A .; Rutherford, K .; Salzberg, S.L .; Craig, A .; Kyes, S .; Chan, M. S .; Nene, V .; Shallom, S. J .; Suh, B .; Peterson, J .; Angiuoli, S .; Pertea, M .; Allen, J .; Selengut, J .; Haft, D .; Mather, M. W .; Vaidya, A. B .; Martin, D. M. A. (2002). "Sekvence genomu parazita lidské malárie Plasmodium falciparum". Příroda. 419 (6906): 498–511. Bibcode:2002 Natur.419..498G. doi:10.1038 / nature01097. PMC  3836256. PMID  12368864.
  19. ^ Venter, J. C .; Remington, K .; Heidelberg, J .; Halpern, A .; Rusch, D .; Eisen, J .; Wu, D .; Paulsen, I .; Nelson, K .; Nelson, W .; Fouts, D. E.; Levy, S .; Knap, A. H .; Lomas, M. W .; Nealson, K .; White, O .; Peterson, J .; Hoffman, J .; Parsons, R .; Baden-Tillson, H .; Pfannkoch, C .; Rogers, Y. H .; Smith, H. O. (2004). „Environmentální genomové brokovnice v Sargasovém moři“. Věda. 304 (5667): 66–74. Bibcode:2004Sci ... 304 ... 66V. CiteSeerX  10.1.1.124.1840. doi:10.1126 / science.1093857. PMID  15001713.
  20. ^ Fraser, C. M .; Clayton, K. E .; Gill, R. A .; Gwinn, S. R .; Dodson, M. L .; Haft, R. J .; Hickey, D. H .; Peterson, E. K .; Nelson, J. D .; Ketchum, W. C .; McDonald, K. A .; Utterback, L .; Malek, T. R .; Linher, J. A .; Garrett, K. D .; Stewart, M. M .; Cotton, A. M .; Pratt, M. D .; Phillips, M. S .; Richardson, C. A .; Heidelberg, D .; Sutton, J .; Fleischmann, G. G .; Eisen, R. D .; White, J. A .; Salzberg, O .; Smith, S.L .; Venter, H. O .; Fraser, J. C. (1999). "Důkazy pro laterální přenos genů mezi Archeaou a bakteriemi ze sekvence genomu Thermotoga maritima". Příroda. 399 (6734): 323–329. Bibcode:1999 Natur.399..323N. doi:10.1038/20601. PMID  10360571.
  21. ^ Zimmer, Carl (29. prosince 2009). „Vědci zahájili genomický katalog hojných mikrobů na Zemi“. The New York Times.
  22. ^ "Spousta dalších brouků v moři". Ekonom. 24. března 2011.
  23. ^ Dickey Zakaib, G. (2011). „Výzva mikrobiální rozmanitosti: Venku na končetině“. Příroda. 476 (7358): 20–21. doi:10.1038 / 476020a. PMID  21814255.
  24. ^ Mandavilli, A. (2011). „Peer review: Trial by Twitter“. Příroda. 469 (7330): 286–287. Bibcode:2011 Natur.469..286M. doi:10.1038 / 469286a. PMID  21248816.
  25. ^ „The Scientist Magazine® - Magazines“. Archivovány od originál 12. dubna 2011. Citováno 7. srpna 2011.
  26. ^ Brumfiel, G. (2009). „Vědecká žurnalistika: Prolomení konvence?“. Příroda. 459 (7250): 1050–1051. doi:10.1038 / 4591050a. PMID  19553969.
  27. ^ Maverick - Esquire Archivováno 13. října 2012 v Wayback Machine

externí odkazy