Jason Swedlow - Jason Swedlow

Jason R. Swedlow
narozený (1961-06-20) 20. června 1961 (věk 59)
Los Angeles, Kalifornie
Národnostamerický
Alma materUniversity of California, San Francisco
Známý jakoOtevřené prostředí pro mikroskopii (OME )
OceněníBBSRC Inovátor roku Člen Královské společnosti v Edinburghu
Vědecká kariéra
PoleBuněčná biologie & Bioimage informatika
InstituceUniversity of Dundee
TezeDistribuce a dynamika DNA topoizomerázy II v chromosomech Drosophila  (1994)
Doktorský poradceDavid Agard & John Sedat
webová stránkaOME
Profil výzkumu

Jason Swedlow je americký -narozený buněčný biolog a světelný mikroskop, který je profesorem kvantitativní buněčné biologie na School of Life Sciences, University of Dundee, Skotsko. Je spoluzakladatelem Otevřené prostředí pro mikroskopii a Software Glencoe.

Vzdělání a kariéra

Prof. Swedlow získal titul B.A. v chemii od Brandeis University v Waltham, Massachusetts, v roce 1982. Poté získal titul Ph.D. v Biofyzika z UCSF v roce 1994 pod vedením Dr. David Agard a Dr. John Sedat. Po postdoktorandském stáži s Dr. Tim Mitchison na UCSF a poté Harvardská lékařská škola, Dr. Swedlow založil vlastní laboratoř v roce 1998 ve Wellcome Trust Biocentre, University of Dundee jako pracovník kariérního rozvoje společnosti Wellcome Trust. V roce 2002 mu bylo uděleno Senior Research Fellowship Wellcome Trust a profesorem kvantitativní buněčné biologie v roce 2007. V roce 2012 byl jmenován Fellow of the Royal Society of Edinburgh.

Výzkum

Výzkum prof. Swedlowa[1] se zaměřuje na mechanismy a regulaci chromozóm segregace během mitotiky buněčné dělení[2][3][4][5][6][7]a vývoj softwarových nástrojů pro přístup, zpracování, sdílení a publikování velkých souborů vědeckých obrazů.[8][9][10][11][12][13][14] Vede mezinárodní konsorcium OME, které vyvíjí a vydává open source software pro biologické zobrazování a Software Glencoe, která komercializuje a upravuje technologii OME pro použití v akademickém a biofarmaceutickém výzkumu (např. Columbus z PerkinElmer, CellLibrarian z Yokogawa, a Amira z Thermo Fisher Scientific. Účastní se Euro-BioImaging, Globální bioobrazy, a je spoluzakladatelem společnosti BioImagingUK, konsorcium britských vědců v oboru zobrazování, kteří vyvíjejí, používají nebo spravují zobrazovací řešení pro výzkum biologických věd. S využitím technologie OME spolupracoval EMBL-EBI rozvíjet Zdroj dat obrazu, veřejný datový zdroj pro referenční obrázky z bioimagingu.

Výuka

Prof. Swedlow působil jako fakulta (od roku 1997) a spoluředitel (2009 - 2014) kurzu analytické a kvantitativní světelné mikroskopie na Mořská biologická laboratoř v Woods Hole, Massachusetts, a podílí se jako fakulta na NCBS Kurz mikroskopie v Bangalore.

Rodina

Prof. Swedlow je ženatý s Dr. Melpomeni Platani a má dvě děti, Jana a Lenu.

Reference

  1. ^ Jason Swedlow publikace indexované podle Google Scholar
  2. ^ Andrews, P. D .; Ovechkina, Y .; Morrice, N .; Wagenbach, M .; Duncan, K .; Wordeman, L .; Swedlow, J. R. (2004). „Aurora B reguluje MCAK v mitotické centromere“. Vývojová buňka. 6 (2): 253–268. doi:10.1016 / s1534-5807 (04) 00025-5. PMID  14960279.
  3. ^ Posch, M .; Khoudoli, G. A .; Swift, S .; King, E. M .; Deluca, J. G .; Swedlow, J. R. (2010). "Sds22 reguluje aktivitu polární záře B a interakce mikrotubulů a kinetochorů při mitóze" (PDF). The Journal of Cell Biology. 191 (1): 61–74. doi:10.1083 / jcb.200912046. PMC  2953433. PMID  20921135.
  4. ^ Jaqaman, K .; King, E. M .; Amaro, A. C .; Winter, J. R .; Dorn, J. F .; Elliott, H.L .; McHedlishvili, N .; McClelland, S.E .; Porter, I.M .; Posch, M .; Toso, A .; Danuser, G .; McAinsh, A. D .; Meraldi, P .; Swedlow, J. R. (2010). „Vyrovnání kinetochorů uvnitř metafázové desky je regulováno tuhostí centromér a mikrotubulárními depolymerázami“. The Journal of Cell Biology. 188 (5): 665–679. doi:10.1083 / jcb.200909005. PMC  2835940. PMID  20212316.
  5. ^ Moser, S. C .; Bensaddek, D .; Ortmann, B .; Maure, J. F .; Mudie, S .; Blow, J. J .; Lamond, A. I .; Swedlow, J. R .; Rocha, S. (2013). „PHD1 spojuje progresi buněčného cyklu se snímáním kyslíku prostřednictvím hydroxylace centrosomálního proteinu Cep192“. Vývojová buňka. 26 (4): 381–392. doi:10.1016 / j.devcel.2013.06.014. PMC  3757158. PMID  23932902.
  6. ^ Porter, I.M .; Schleicher, K .; Porter, M .; Swedlow, J. R. (2013). "Bod1 reguluje proteinovou fosfatázu 2A v mitotických kinetochorech". Příroda komunikace. 4: 2677. doi:10.1038 / ncomms3677. PMC  3826647. PMID  24157919.
  7. ^ Esmaeeli-Nieh, Sahar; Fenčková, Michaela; Porter, Iain M .; Motazacker, M. Mahdi; Nijhof, Bonnie; Castells-Nobau, Anna; Asztalos, Zoltan; Weißmann, Robert; Behjati, Farkhondeh; Tzschach, Andreas; Felbor, Ute; Scherthan, Harry; Sayfati, Seyed Morteza; Ropers, H. Hilger .; Kahrizi, Kimia; Najmabadi, Hossein; Swedlow, Jason R .; Schenck, Annette; Kuss, Andreas W. (2016). „BOD1 je vyžadován pro kognitivní funkce u lidí a Drosophila“. Genetika PLOS. 12 (5): e1006022. doi:10.1371 / journal.pgen.1006022. PMC  4864283. PMID  27166630.
  8. ^ Swedlow, J. R .; Goldberg, I .; Brauner, E .; Sorger, P. K. (2003). „Informatika a kvantitativní analýza v biologickém zobrazování“. Věda. 300 (5616): 100–102. doi:10.1126 / science.1082602. PMC  3522889. PMID  12677061.
  9. ^ Goldberg, I.G .; Allan, C .; Burel, J. M .; Creager, D .; Falconi, A .; Hochheiser, H .; Johnston, J .; Mellen, J .; Sorger, P. K .; Swedlow, J. R. (2005). „Datový model otevřeného mikroskopického prostředí (OME) a ​​soubor XML: Otevřené nástroje pro informatiku a kvantitativní analýzu v biologickém zobrazování“. Genome Biology. 6 (5): R47. doi:10.1186 / gb-2005-6-5-r47. PMC  1175959. PMID  15892875.
  10. ^ Swedlow, J. R .; Goldberg, I.G .; Eliceiri, K. W .; Ome, C. (2009). „Informatika bioimage pro experimentální biologii *“. Roční přehled biofyziky. 38: 327–346. doi:10.1146 / annurev.biophys.050708.133641. PMC  3522875. PMID  19416072.
  11. ^ Allan, C .; Burel, J. M .; Moore, J .; Blackburn, C .; Linkert, M .; Loynton, S .; MacDonald, D .; Moore, W. J .; Neves, C .; Patterson, A .; Porter, M .; Tarkowska, A .; Loranger, B .; Avondo, J .; Lagerstedt, I .; Lianas, L .; Leo, S .; Ruce, K .; Hay, R. T .; Patwardhan, A .; Nejlepší, C .; Kleywegt, G. J .; Zanetti, G .; Swedlow, J. R. (2012). „OMERO: Flexibilní modelová správa dat pro experimentální biologii“. Přírodní metody. 9 (3): 245–253. doi:10.1038 / nmeth.1896. PMC  3437820. PMID  22373911.
  12. ^ Burel, JM; Besson, S; Blackburn, C; Carroll, M; Ferguson, RK; Flynn, H; Gillen, K; Leigh, R; Li, S; Lindner, D; Linkert, M; Moore, WJ; Ramalingam, B; Rozbicki, E; Tarkowska, A; Walczysko, P; Allan, C; Moore, J; Swedlow, JR (2015). „Publikování a sdílení vícerozměrných obrazových dat se společností OMERO“. Savčí genom. 26 (9–10): 441–7. doi:10.1007 / s00335-015-9587-6. PMC  4602067. PMID  26223880.
  13. ^ Li, S; Besson, S; Blackburn, C; Carroll, M; Ferguson, RK; Flynn, H; Gillen, K; Leigh, R; Lindner, D; Linkert, M; Moore, WJ; Ramalingam, B; Rozbicki, E; Rustici, G; Tarkowska, A; Walczysko, P; Williams, E; Allan, C; Burel, JM; Moore, J; Swedlow, JR (2016). „Správa metadat pro screening vysokého obsahu v OMERO“. Metody. 96: 27–32. doi:10.1016 / j.ymeth.2015.10.006. PMC  4773399. PMID  26476368.
  14. ^ Williams E, Moore J, Li SW, Rustici G, Tarkowska A, Chessel A a kol. (2017). „Zdroj dat obrazu: Platforma pro integraci a publikaci dat bioimage“. Nat metody. 14 (8): 775–781. doi:10.1038 / nmeth.4326. PMC  5536224. PMID  28775673.