Jadomycin - Jadomycin - Wikipedia

Jadomycin B.
Jadomycin B.png
Jména
Ostatní jména
Jadomycin L-isoleucin
Identifikátory
3D model (JSmol )
ChEBI
ChEMBL
ChemSpider
KEGG
Vlastnosti
C30H31NÓ9
Molární hmotnost549.576 g · mol−1
VzhledTmavě červeno-fialová pevná látka
RozpustnostRozpustný v různých organických rozpouštědlech[vágní ]
Pokud není uvedeno jinak, jsou uvedeny údaje o materiálech v nich standardní stav (při 25 ° C [77 ° F], 100 kPa).
Reference Infoboxu

A jadomycin je přírodní produkt produkovaný Streptomyces venezuelae ISP5230 (ATCC10712[1]), organismus, který je nejznámější pro výrobu antibiotika chloramfenikol. Název jadomycin se používá pro rodinu příbuzných angucyklinů, které se vyznačují E kruhem (obvykle oxoazolonovým kruhem), který je odvozen od aminokyseliny. Inkorporace aminokyselin, která tvoří E-kruh, je spíše chemickou reakcí než enzymatickou, což je v biosyntéze neobvyklý jev. Proto bylo objeveno množství jadomycinů obsahujících různé aminokyseliny. Jadomycin A byl první sloučeninou z této rodiny, která byla izolována a představuje angucylickou páteř L-izoleucin zabudovaný do E-kroužku.[2] Příbuzný analog, jadomycin B, je modifikován glykosylací s 2,6-dideoxy cukrem, L-digitoxóza.[3] Jadomyciny mají cytotoxické a antibakteriální vlastnosti.

Biosyntéza

Klastr genomu biosyntézy jadomycinu je dobře charakterizován. Biosyntéza jadomycinu zahrnuje typ II polyketid syntáza (T2Pks) sestava pro generování angucyklinové složky,[4] a dideoxycukrovou dráhu pro generování NDP-L-digitoxózy dárce cukru.[5] Studie zahrnovaly JadG, závislý na FAD oxygenáza, v kruhovém štěpení požadovaném pro začlenění aminokyselin.[6] JadS glykosyltransferáza která přenáší L-digitoxózu, se ukázala být flexibilní, pokud jde o dárce cukru.[7][8][9]

Analogy založené na modifikaci E-kroužku

Jadomycin analogy byly získány kulturou S. venezuelae v přítomnosti jediné aminokyseliny. Rozmanitost jadomycinů zahrnuje ty, které obsahují přirozeně se vyskytující aminokyseliny,[10] neproteinogenní aminokyseliny,[11][12] a syntetické aminokyseliny s rukojetí umožňujícími další chemickou modifikaci.[13][14]

Reference

  1. ^ „Streptomyces venezuelae Ehrlich et al. ATCC ® 10712 ™". www.atcc.org. Citováno 2017-05-31.
  2. ^ Ayer, Stephen W .; McInnes, A. Gavin; Thibault, Pierre; Walter, John A .; Doull, Janice L .; Parnell, Tracy; Vining, Leo C. (1991-10-28). „Jadomycin, nové 8H-benz [b] oxazolo [3,2-f] fenanthridinové antibiotikum ze streptomyces venezuelae ISP5230“. Čtyřstěn dopisy. 32 (44): 6301–6304. doi:10.1016 / 0040-4039 (91) 80152-V.
  3. ^ DOULL, JANICE L .; AYER, STEPHEN W .; SINGH, AMRIT K .; THIBAULT, PIERRE (1993-05-25). „Výroba nového polyketidového antibiotika, jadomycinu B, Streptomyces venezuelae po tepelném šoku“. The Journal of Antibiotics. 46 (5): 869–871. doi:10,7164 / antibiotika. 46869. ISSN  0021-8820. PMID  8514643.
  4. ^ Han, Lei; Yang, Keqian; Ramalingam, Eswar; Mosher, Roy H .; Vining, Leo C. (1994). "Klonování a charakterizace genů polyketid syntázy pro biosyntézu jadomycinu B u Streptomyces venezuelae ISP5230". Mikrobiologie. 140 (12): 3379–3389. doi:10.1099/13500872-140-12-3379. PMID  7881555.
  5. ^ Wang, Liru; White, Robert L .; Vining, Leo C. (2002). „Biosyntéza dideoxysacharové složky jadomycinu B: geny v jádrovém klastru Streptomyces venezuelae ISP5230 pro sestavení l-digitoxosy a přenos na angucyklinový aglykon. Mikrobiologie. 148 (4): 1091–1103. doi:10.1099/00221287-148-4-1091. PMID  11932454.
  6. ^ Tibrewal, Nidhi; Pahari, Pallab; Wang, Guojun; Kharel, Madan K .; Morris, Caleb; Downey, Theresa; Hou, Yanpeng; Bugni, Tim S .; Rohr, Jürgen (2012). „Baeyer – Villiger C – C Bond štěpná reakce v biosyntéze Gilvocarcin a Jadomycin“. Journal of the American Chemical Society. 134 (44): 18181–18184. doi:10.1021 / ja3081154. PMC  3498853. PMID  23102024.
  7. ^ Jakeman, David L .; Borissow, Charles N .; Graham, Cathy L .; Timmons, Shannon C .; Reid, Taryn R .; Syvitski, Ray T. (2006-08-29). "Flexibilita substrátu 2,6-dideoxyglykosyltransferázy". Chemická komunikace. 0 (35): 3738–3740. doi:10.1039 / B608847C. ISSN  1364-548X. PMID  17047829.
  8. ^ Zapomeňte na S. M .; Na, Jungwook; McCormick, N.E .; Jakeman, D. L. (2017-03-28). „Biosyntetická delece genu 4,6-dehydratázy: izolace přírodního produktu glukosylovaného jadomycinu poskytuje pohled na substrátovou specificitu glykosyltransferázy JadS“. Organická a biomolekulární chemie. 15 (13): 2725–2729. doi:10.1039 / C7OB00259A. ISSN  1477-0539. PMID  28291274.
  9. ^ Li, Liyuan; Pan, Guohui; Zhu, Xifen; Fanoušek, Keqiang; Gao, Wubin; Ai, Guomin; Ren, Jinwei; Shi, Mingxin; Olano, Carlos (2017-04-20). "Inženýrské analogy nukleomycinu se změněnými cukernými skupinami odhalující JadS jako substrát flexibilní O-glykosyltransferázy". Aplikovaná mikrobiologie a biotechnologie. 101 (13): 5291–5300. doi:10.1007 / s00253-017-8256-r. ISSN  0175-7598. PMID  28429060. S2CID  11777539.
  10. ^ Jakeman, David L .; Farrell, jaro; Young, Wendy; Doucet, René J .; Timmons, Shannon C. (2005-03-01). „Nové jadomyciny: zabudování nepřirozených a přírodních aminokyselin“. Dopisy o bioorganické a léčivé chemii. 15 (5): 1447–1449. doi:10.1016 / j.bmcl.2004.12.082. PMID  15713404.
  11. ^ Jakeman, David L .; Graham, Cathy L .; Reid, Taryn R. (01.12.2005). "Nové a expandované jadomyciny obsahující neproteogenní aminokyseliny". Dopisy o bioorganické a léčivé chemii. 15 (23): 5280–5283. doi:10.1016 / j.bmcl.2005.08.047. PMID  16185863.
  12. ^ Zapomeňte na Stephanie M .; Robertson, Andrew W .; Overy, David P .; Kerr, Russell G .; Jakeman, David L. (2017-05-18). „Biosyntetické kongenery Furan a Laktam Jadomycin izolované z Streptomyces venezuelae ISP5230 kultivované s Nε-trifluoracetyl-l-lysinem“. Journal of Natural Products. 80 (6): 1860–1866. doi:10.1021 / acs.jnatprod.7b00152. ISSN  0163-3864. PMID  28520425.
  13. ^ Dupuis, Stephanie N .; Robertson, Andrew W .; Veinot, Thomas; Monro, Susan M. A .; Douglas, Susan E .; Syvitski, Ray T .; Goralski, Kerry B .; McFarland, Sherri A .; Jakeman, David L. (02.04.2012). „Syntetická diverzifikace přírodních produktů: polosyntéza a hodnocení triazol-jadomycinů“. Chemická věda. 3 (5): 1640. doi:10.1039 / C2SC00663D. ISSN  2041-6539.
  14. ^ Robertson, Andrew W .; Martinez-Farina, Camilo F .; Smithen, Deborah A .; Yin, Huimin; Monro, Susan; Thompson, Alison; McFarland, Sherri A .; Syvitski, Raymond T .; Jakeman, David L. (2015). „Osmičlenný prsten obsahující jadomyciny: důsledky pro neenzymatickou biosyntézu přírodních produktů“. Journal of the American Chemical Society. 137 (9): 3271–3275. doi:10.1021 / ja5114672. PMID  25692677.