Intrasporangium - Intrasporangium

Intrasporangium
Vědecká klasifikace
Doména:
Bakterie
Kmen:
Aktinobakterie
Třída:
Actinomycetales
Objednat:
Mikrokokaly
Rodina:
Intrasporangiaceae
Rod:
Intrasporangium

Kalakoutskii et al 1967
Druh

I. calvum
I. chromatireducens
I. mezophilum
I. oryzae

Intrasporangium je rod Gram pozitivní, nepohyblivý, endosporeforming bakterie. Jméno rodu odkazuje na schopnost tvořit sporangia intercalary v myceliální hyfy.[1] The rodina Intrasporangiaceae je pojmenována po rodu, a Intrasporangium je rod typu pro rodinu.[2]

Rod byl poprvé navržen v roce 1967. The druh druhu I. calvum byl poprvé izolován od vzduchu ve školní jídelně v Sovětský svaz.[1] Rod byl monospecifické do roku 2012, kdy byly do rodu přidány tři druhy. I. chromatireducens a I. mezophilum byly navrženy jako nové druhy a monospecifické Humihabitans oryzae byl překlasifikován jako I. oryzae.[3][4] Nový rod a druh Monashia flava byl navržen v roce 2016, ale později bylo zjištěno, že je členem Intrasporagium, s největší pravděpodobností kmen I. oryzae. Rod je v současné době zaniklý.[5][6]

Ačkoli první izolace Intrasporangium byl ze vzorku vzduchu, následné izolace byly hlavně z různých druhů půdy. Mezi půdní zdroje patří manganový důl,[3] bývalé místo zplyňování uhlí,[7] web obohacený uranem,[8] a rhizosféry a rýžové pole a ze dne Jatropha curcas.[4]

Reference

  1. ^ A b Kalakoutskii, L. V .; Kirillova, I. P .; Krassilinokov, N. A. (1. července 1967). „Nový rod Actinomycetales - Intrasporangium gen.nov“. Journal of General Microbiology. 48 (1): 79–85. doi:10.1099/00221287-48-1-79.
  2. ^ Stackebrandt, E .; Rainey, F. A .; Ward-Rainey, N.L. (1. dubna 1997). „Návrh nového hierarchického klasifikačního systému, Actinobacteria classis nov“. International Journal of Systematic Bacteriology. 47 (2): 479–491. doi:10.1099/00207713-47-2-479.
  3. ^ A b Liu, H .; Wang, H .; Wang, G. (25. března 2011). „Intrasporangium chromatireducens sp. Nov., Aktinobakterium redukující chromáty izolované z půdy těžící mangan a upravený popis rodu Intrasporangium“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62 (2): 403–408. doi:10.1099 / ijs.0.030528-0. PMID  21441371.
  4. ^ A b Yang, L.-L .; Ao, T .; Wang, X.-H .; On, J .; Klenk, H.-P .; Tang, S.-K .; Li, W.-J. (17. června 2011). „Návrh Intrasporangium mesophilum sp. Nov. A reklasifikace Humihabitans oryzae Kageyama et al. 2007 jako Intrasporangium oryzae comb. Nov“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62 (Pt 5): 1037–1041. doi:10.1099 / ijs.0.029934-0. PMID  21685254.
  5. ^ Azman, Adzzie-Shazleen; Zainal, Nurullhudda; Mutalib, Nurul-Syakima Ab; Yin, Wai-Fong; Chan, Kok-Gan; Lee, Learn-Han (1. února 2016). „Monashia flava gen. Nov., Sp. Nov., Aktinobakterie čeledi Intrasporangiaceae“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 66 (2): 554–561. doi:10.1099 / ijsem.0.000753. PMID  26556816.
  6. ^ Nouioui, Imen; Carro, Lorena; García-López, Marina; Meier-Kolthoff, Jan P .; Woyke, Tanja; Kyrpides, Nikos C .; Pukall, Rüdiger; Klenk, Hans-Peter; Goodfellow, Michael; Göker, Markus (22. srpna 2018). "Taxonomická klasifikace kmenových aktinobakterií na základě genomu". Hranice v mikrobiologii. 9: 2007. doi:10.3389 / fmicb.2018.02007. PMC  6113628. PMID  30186281.
  7. ^ Glavina Del Rio, Tijana; Chertkov, Olga; Yasawong, Montri; Lucas, Susan; Deshpande, Shweta; Cheng, Jan-Fang; Detter, Chris; Tapia, Roxanne; Han, Cliff; Goodwin, Lynne; Pitluck, Sam; Liolios, Konstantinos; Ivanova, Natalia; Mavromatis, Konstantinos; Pati, Amrita; Chen, Amy; Palaniappan, Krišna; Land, Miriam; Hauser, Loren; Chang, Yun-Juan; Jeffries, Cynthia D .; Rohde, Manfred; Pukall, Rüdiger; Sikorski, Johannes; Göker, Markus; Woyke, Tanja; Bristow, James; Eisen, Jonathan A .; Markowitz, Victor; Hugenholtz, Philip; Kyrpides, Nikos C .; Klenk, Hans-Peter; Lapidus, Alla (2010). "Kompletní sekvence genomu kmene typu Intrasporangium calvum (7 KIPT)". Standardy v genomických vědách. 3 (3): 294–303. doi:10,4056 / sigs.1263355. PMC  3035309. PMID  21304734.
  8. ^ Brodie, E. L .; DeSantis, T. Z .; Joyner, D.C .; Baek, S. M .; Larsen, J. T .; Andersen, G. L .; Hazen, T. C .; Richardson, P. M .; Herman, D. J .; Tokunaga, T. K.; Wan, J. M .; Firestone, M. K. (6. září 2006). „Uplatnění přístupu mikroarray o vysoké hustotě oligonukleotidů ke studiu dynamiky bakteriální populace během redukce a reoxidace uranu“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 72 (9): 6288–6298. doi:10.1128 / AEM.00246-06. PMID  16957256.