Standardní obrazová cytometrie - Image Cytometry Standard
Přípona názvu souboru | .ics, .ids |
---|---|
Typ formátu | Formáty obrazových souborů |
The Standardní obrazová cytometrie (ICS) je digitální multidimenzionální obraz formát souboru použito v humanitní vědy mikroskopie. Ukládá nejen obrazová data, ale také mikroskopické parametry popisující optiku během snímání.
ICS byl poprvé navržen v: P. Dean, L. Mascio, D. Ow, D. Sudar, J. Mullikin, Navrhovaný standard pro datové soubory obrazové cytometrie, Cytometry, n. 11, str. 561-569, 1990 [1].
Původní formát souboru ICS ve skutečnosti používá dva samostatné soubory: textový soubor záhlaví s příponou .ics a další, mnohem větší a se skutečnými daty obrazu, s příponou .ids. To umožňuje komprimaci dat, zatímco ponecháte soubor záhlaví přístupný. Na druhou stranu novější formát souboru ICS2 používá pouze jeden jediný soubor .ics se záhlaví i daty dohromady.
Soubor .ics ve formátu dvou souborů je textový soubor s poli oddělenými znakem záložky a řádky končící na nový řádek charakter. V novějším formátu ICS2 tato textová hlavička předchází binární data.
Formát ICS je schopen ukládat:
- vícerozměrná a vícekanálová data
- obrázky v 8, 16, 32 nebo 64 bitových celých číslech, 32 nebo 64 bitech s plovoucí desetinnou čárkou a s plovoucí desetinnou čárkou komplexní data
- všechny mikroskopické parametry přímo související s tvorbou obrazu
- komentáře ve volném formátu
externí odkazy
- Zdroje pro knihovnu pro čtení / zápis souborů ICS vydané pod licencí LGPL v2.1: https://github.com/svi-opensource/libics. Aktuální verze je 1.6.3 vydaná 24. května 2019.
- Pythonské rozhraní k libics: pylibici
- Otvírák ICS pro Obrázek J..
- Bioformáty pro Fidži_ (software) / Obrázek J..