IQGAP2 - IQGAP2

IQGAP2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3IEZ, 4EZA
Identifikátory
Aliasy	IQGAP2, IQ motiv obsahující protein aktivující GTPázu 2
Externí ID	OMIM: 605401 MGI: 2449975 HomoloGene: 101543 Genové karty: IQGAP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	76,708,132 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	95,892,483 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Rac GTPase vazba; • Vazba komplexu Arp2 / 3; • Aktivita inhibitoru GTPázy; • vazba aktinového vlákna; • Vazba Rho GTPázy; • aktinová vazba; • vazba fosfatidylinositol-3,4,5-trisfosfátu; • kalmodulinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • vláknitý aktin; • cytosol; • filopodium; • mikrovilli; • povrch buňky; • aktinový cytoskelet; • mikrotubuly; • extracelulární exosom; • lamellipodium; • buněčná membrána; • sekreční granulovaná membrána;
Biologický proces	• signální dráha receptoru aktivovaného trombinem; • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 regulace aktivity GTPázy; • Nukleace aktinu zprostředkovaná komplexem Arp2 / 3; • signální transdukce; • GO: 0034259 negativní regulace aktivity GTPázy; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10788
	544963
	ENSG00000145703
	ENSMUSG00000021676
	Q13576
	Q3UQ44
	NM_001285460; NM_001285461; NM_001285462; NM_006633
	NM_027711
	NP_001272389; NP_001272390; NP_001272391; NP_006624
	NP_081987
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein IQGAP2 podobný aktivaci Ras GTPázy je enzym že u lidí je kódován IQGAP2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny IQGAP. Protein obsahuje tři IQ domény, jednu doménu homologie kalponinu, jednu doménu Ras-GAP a jednu doménu WW. Interaguje s komponentami cytoskeletu, s molekulami adheze buněk a s několika signálními molekulami k regulaci morfologie a motility buněk.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že IQGAP2 komunikovat s CDC42^[5] a RAC1.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145703 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000021676 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Brill S, Li S, Lyman CW, Church DM, Wasmuth JJ, Weissbach L, Bernards A, Snijders AJ (září 1996). „Lidský protein IQGAP2 související s proteinem aktivujícím Ras GTPázu obsahuje potenciální aktinovou vazebnou doménu a interaguje s kalmodulinem a Ghopami rodiny Rho“. Mol. Buňka. Biol. 16 (9): 4869–78. doi:10,1128 / mcb.16.9.4869. PMC 231489. PMID 8756646.
^ ^A ^b „Entrez Gene: IQGAP2 IQ motiv obsahující protein aktivující GTPázu 2“.

Další čtení

McCallum SJ, Wu WJ, Cerione RA (1996). „Identifikace domnělého efektoru pro Cdc42Hs s vysokou sekvenční podobností s proteinem IQGAP1 souvisejícím s RasGAP a vazebným partnerem Cdc42Hs s podobností s IQGAP2“. J. Biol. Chem. 271 (36): 21732–7. doi:10.1074 / jbc.271.36.21732. PMID 8702968.
Yin H, Morioka H, Towle CA, Vidal M, Watanabe T, Weissbach L (2001). „Důkaz, že HAX-1 je interleukin-1 alfa N-terminální vazebný protein“. Cytokin. 15 (3): 122–37. doi:10.1006 / cyto.2001.0891. PMID 11554782.
Wennerberg K, Ellerbroek SM, Liu RY, Karnoub AE, Burridge K, Der CJ (2002). "RhoG signály paralelně s Rac1 a Cdc42". J. Biol. Chem. 277 (49): 47810–7. doi:10,1074 / jbc.M203816200. PMID 12376551.
Schmidt VA, Scudder L, Devoe CE, Bernards A, Cupit LD, Bahou WF (2003). „IQGAP2 funguje jako efektorový protein závislý na GTP při trombem vyvolané cytoskeletální reorganizaci trombocytů“. Krev. 101 (8): 3021–8. doi:10.1182 / krev-2002-09-2807. PMID 12515716.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Chew CS, Okamoto CT, Chen X, Qin HY (2005). „IQGAP jsou odlišně exprimovány a regulovány v polarizovaných epiteliálních buňkách žaludku“. Dopoledne. J. Physiol. Gastrointest. Játra Physiol. 288 (2): G376-87. doi:10.1152 / ajpgi.00290.2004. PMID 15458922.
Wang H, Huo R, Xu M, Lu L, Xu Z, Li J, Zhou Z, Sha J (2005). "Klonování a charakterizace nové varianty transkriptu IQGAP2 v lidských varlatech". DNA sekv. 15 (5–6): 319–25. doi:10.1080/10425170400009012. PMID 15621655. S2CID 22014226.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145703 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000021676 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8756646-5] A ^b ^C Brill S, Li S, Lyman CW, Church DM, Wasmuth JJ, Weissbach L, Bernards A, Snijders AJ (září 1996). „Lidský protein IQGAP2 související s proteinem aktivujícím Ras GTPázu obsahuje potenciální aktinovou vazebnou doménu a interaguje s kalmodulinem a Ghopami rodiny Rho“. Mol. Buňka. Biol. 16 (9): 4869–78. doi:10,1128 / mcb.16.9.4869. PMC 231489. PMID 8756646.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: IQGAP2 IQ motiv obsahující protein aktivující GTPázu 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]