INTS6 - INTS6 - Wikipedia

INTS6
Identifikátory
Aliasy	INTS6, DBI-1, DDX26, DDX26A, DICE1, HDB, INT6, Notchl2, komplexní podjednotka integrátoru 6
Externí ID	OMIM: 604331 MGI: 1202397 HomoloGene: 8121 Genové karty: INTS6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	51,454,264 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	62,761,169 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transmembránového signalizačního receptoru;
Buněčná složka	• komplex integrátorů; • aktinový cytoskelet; • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• zpracování snRNA; • transkripce snRNA z promotoru RNA polymerázy II; • signální transdukce; • zpracování na 3'-konci snRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26512
	18130
	ENSG00000102786
	ENSMUSG00000035161
	Q9UL03
	Q6PCM2
	NM_001039937; NM_001039938; NM_001306091; NM_012141
	NM_008715
	NP_001035026; NP_001035027; NP_001293020; NP_036273
	NP_032741
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka komplexního integrátoru 6 je protein že u lidí je kódován INTS6 gen.^[5]^[6]^[7]

DEAD box proteiny, charakterizované konzervovaným motivem Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), jsou domnělé RNA helikázy. Protein kódovaný tímto genem je DEAD box protein, který je součástí komplexu, který interaguje s C-koncem RNA polymeráza II a podílí se na 3 'koncovém zpracování snRNA. Tento gen je navíc kandidátem supresor nádoru a nachází se v kritické oblasti ztráta heterozygotnosti (LOH). Tři varianty přepisu kódující dva různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102786 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035161 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wieland I, Arden KC, Michels D, Klein-Hitpass L, Bohm M, Viars CS, Weidle UH (říjen 1999). „Izolace DICE1: gen často ovlivněný LOH a downregulovaný v plicních karcinomech“. Onkogen. 18 (32): 4530–7. doi:10.1038 / sj.onc.1202806. PMID 10467397.
^ Baillat D, Hakimi MA, Naar AM, Shilatifard A, Cooch N, Shiekhattar R (říjen 2005). „Integrator, multiproteinový mediátor zpracování malé jaderné RNA, se asociuje s C-terminální repeticí RNA polymerázy II“. Buňka. 123 (2): 265–76. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.019. PMID 16239144.
^ ^A ^b „Entrez Gene: INTS6 integrační komplexní podjednotka 6“.

Další čtení

Buchsbaum S, Morris C, Bochard V, Jalinot P (2007). „Lidský INT6 interaguje s MCM7 a reguluje jeho stabilitu během S fáze buněčného cyklu“. Onkogen. 26 (35): 5132–44. doi:10.1038 / sj.onc.1210314. PMID 17310990.
Hernández M, Papadopoulos N, Almeida TA (2006). "Absence mutací v genu DICE1 / DDX26 v buněčných liniích lidské rakoviny s častými delecemi 13q14". Genetika rakoviny. Cytogenet. 163 (1): 91–2. doi:10.1016 / j.cancergencyto.2005.04.014. PMID 16271964.
Röpke A, Buhtz P, Böhm M a kol. (2005). "Hypermethylace promotoru CpG a downregulace exprese DICE1 u rakoviny prostaty". Onkogen. 24 (44): 6667–75. doi:10.1038 / sj.onc.1208824. PMID 16007164.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wieland I, Sell C, Weidle UH, Wieacker P (2005). "Ektopická exprese DICE1 potlačuje růst nádorových buněk". Oncol. Rep. 12 (2): 207–11. doi:10.3892 / nebo 12.2.207. PMID 15254679.
Dunham A, Matthews LH, Burton J a kol. (2004). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 13“. Příroda. 428 (6982): 522–8. doi:10.1038 / nature02379. PMC 2665288. PMID 15057823.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Li WJ, Hu N, Su H a kol. (2003). "Alelická ztráta na chromozomu 13q14 a mutace v deleci u genu pro rakovinu 1 v karcinomu dlaždicových buněk jícnu". Onkogen. 22 (2): 314–8. doi:10.1038 / sj.onc.1206098. PMID 12527901.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Wieland I, Röpke A, Stumm M a kol. (2002). "Molekulární charakterizace DICE1 (DDX26) tumor supresorového genu v buňkách karcinomu plic". Oncol. Res. 12 (11–12): 491–500. PMID 11939413.
Camargo AA, Nunes DN, Samaia HB a kol. (2002). „Molekulární charakterizace DDX26, lidské DEAD-box RNA helikázy, umístěné na chromozomu 7p12“. Braz. J. Med. Biol. Res. 34 (10): 1237–45. doi:10,1590 / s0100-879x2001001000002. PMID 11593297.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102786 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035161 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10467397-5] Wieland I, Arden KC, Michels D, Klein-Hitpass L, Bohm M, Viars CS, Weidle UH (říjen 1999). „Izolace DICE1: gen často ovlivněný LOH a downregulovaný v plicních karcinomech“. Onkogen. 18 (32): 4530–7. doi:10.1038 / sj.onc.1202806. PMID 10467397.

[pmid16239144-6] Baillat D, Hakimi MA, Naar AM, Shilatifard A, Cooch N, Shiekhattar R (říjen 2005). „Integrator, multiproteinový mediátor zpracování malé jaderné RNA, se asociuje s C-terminální repeticí RNA polymerázy II“. Buňka. 123 (2): 265–76. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.019. PMID 16239144.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: INTS6 integrační komplexní podjednotka 6“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]