IGBP1 - IGBP1

IGBP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4IYP
Identifikátory
Aliasy	IGBP1, ALPHA-4, IBP1, protein vázající imunoglobulin (CD79A) 1, protein vázající imunoglobulin 1, alfa4
Externí ID	OMIM: 300139 MGI: 1346500 HomoloGene: 44067 Genové karty: IGBP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	70,166,324 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	100,516,125 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita regulátoru proteinové fosfatázy; • vazba proteinové fosfatázy 2A;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu; • reakce na interleukin-1; • regulace pohybu na bázi mikrotubulů; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • reakce na faktor nekrózy nádoru; • Aktivace B buněk; • regulace přenosu signálu; • negativní regulace stresem aktivované kaskády MAPK; • signální transdukce; • regulace defosforylace; • regulace aktivity fosfoprotein fosfatázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3476
	18518
	ENSG00000089289
	ENSMUSG00000031221
	P78318
	Q61249
	NM_001551; NM_001370192; NM_001370193; NM_001370194
	NM_008784
	NP_001542; NP_001357121; NP_001357122; NP_001357123
	NP_032810
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Imunoglobulin vázající protein 1 je protein že u lidí je kódován IGBP1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Proliferace a diferenciace B buněk závisí na komplexu receptoru antigenu B-buněk (BCR). Vazba antigenů na specifické receptory B-buněk vede k fosforylační reakci tyrosinu prostřednictvím komplexu BCR a vede k mnoha signálním transdukčním cestám.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že IGBP1 komunikovat s PPP4C,^[7]^[8]^[9] PPP6C^[8]^[9] a PPP2CA.^[8]^[9]^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000089289 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031221 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Onda M, Inui S, Maeda K, Suzuki M, Takahashi E, Sakaguchi N (prosinec 1997). „Exprese a chromozomální lokalizace lidského genu alfa 4 / IGBP1, jehož struktura úzce souvisí s kvasinkovým proteinem TAP42 signální transdukční dráhy citlivé na rapamycin“. Genomika. 46 (3): 373–8. doi:10.1006 / geno.1997.5048. PMID 9441740.
^ ^A ^b "Entrez Gene: IGBP1 imunoglobulin (CD79A) vazebný protein 1".
^ Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.
^ ^A ^b ^C Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“ (PDF). Molekulární a buněčná proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932. S2CID 7531012.
^ ^A ^b ^C Chen J, Peterson RT, Schreiber SL (červen 1998). "Alfa 4 se asociuje s proteinovými fosfatázami 2A, 4 a 6". Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 247 (3): 827–32. doi:10.1006 / bbrc.1998.8792. PMID 9647778.
^ Goudreault M, D'Ambrosio LM, Kean MJ, Mullin MJ, Larsen BG, Sanchez A, Chaudhry S, Chen GI, Sicheri F, Nesvizhskii AI, Aebersold R, Raught B, Gingras AC (leden 2009). „Síť s vysokou hustotou interakce fosfatázy PP2A identifikuje nový komplex fosfatázy a kinázy interagující se striatinem spojený s proteinem cerebrální kavernózní malformace 3 (CCM3)“. Molekulární a buněčná proteomika. 8 (1): 157–71. doi:10,1074 / mcp.M800266-MCP200. PMC 2621004. PMID 18782753.
^ Chung H, Nairn AC, Murata K, Brautigan DL (srpen 1999). „Mutace Tyr307 a Leu309 v katalytické podjednotce proteinové fosfatázy 2A podporuje asociaci s podjednotkou alfa 4, která podporuje defosforylaci elongačního faktoru-2“. Biochemie. 38 (32): 10371–6. doi:10,1021 / bi990902g. PMID 10441131.

Další čtení

Chen J, Peterson RT, Schreiber SL (červen 1998). "Alfa 4 se asociuje s proteinovými fosfatázami 2A, 4 a 6". Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 247 (3): 827–32. doi:10.1006 / bbrc.1998.8792. PMID 9647778.
Chung H, Nairn AC, Murata K, Brautigan DL (srpen 1999). „Mutace Tyr307 a Leu309 v katalytické podjednotce proteinové fosfatázy 2A podporuje asociaci s podjednotkou alfa 4, která podporuje defosforylaci elongačního faktoru-2“. Biochemie. 38 (32): 10371–6. doi:10,1021 / bi990902g. PMID 10441131.
Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (listopad 1999). „Antigeny rozpoznávané autologními protilátkami u pacientů s karcinomem z renálních buněk“. International Journal of Cancer. 83 (4): 456–64. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID 10508479.
Liu J, Prickett TD, Elliott E, Meroni G, Brautigan DL (červen 2001). „Fosforylace a mikrotubulární asociace proteinu Opitzova syndromu mid-1 je regulována proteinovou fosfatázou 2A prostřednictvím vazby na regulační podjednotku alfa 4“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (12): 6650–5. Bibcode:2001PNAS ... 98,6650L. doi:10.1073 / pnas.111154698. PMC 34408. PMID 11371618.
Krátký KM, Hopwood B, Yi Z, Cox TC (2002). „MID1 a MID2 homo- a heterodimerizují k upoutání regulační podjednotky PP2A citlivé na rapamycin, alfa 4, k mikrotubulům: důsledky pro klinickou variabilitu X-vázaného Opitzova syndromu GBBB a dalších vývojových poruch“. Buněčná biologie BMC. 3: 1. doi:10.1186/1471-2121-3-1. PMC 64779. PMID 11806752.
Graham JM, Wheeler P, Tackels-Horne D, Lin AE, Hall BD, květen M, krátký KM, Schwartz CE, Cox TC (listopad 2003). „Nový X-vázaný syndrom s agenezí corpus callosum, mentální retardací, kolobomem, mikrognatií a mutací genu Alpha 4 na Xq13“. American Journal of Medical Genetics Part A. 123A (1): 37–44. doi:10,1002 / ajmg.a.20504. PMID 14556245. S2CID 26545089.
Smetana JH, Oliveira CL, Jablonka W, Aguiar Pertinhez T, Carneiro FR, Montero-Lomeli M, Torriani I, Zanchin NI (duben 2006). "Struktura lidského alfa4 proteinu s nízkým rozlišením (IgBP1) a studie stability alfa4 a jeho kvasinkového ortologu Tap42". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bílkoviny a proteomika. 1764 (4): 724–34. doi:10.1016 / j.bbapap.2006.01.018. PMID 16517231.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000089289 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031221 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9441740-5] Onda M, Inui S, Maeda K, Suzuki M, Takahashi E, Sakaguchi N (prosinec 1997). „Exprese a chromozomální lokalizace lidského genu alfa 4 / IGBP1, jehož struktura úzce souvisí s kvasinkovým proteinem TAP42 signální transdukční dráhy citlivé na rapamycin“. Genomika. 46 (3): 373–8. doi:10.1006 / geno.1997.5048. PMID 9441740.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: IGBP1 imunoglobulin (CD79A) vazebný protein 1".

[pmid18715871-7] Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.

[pmid16085932-8] A ^b ^C Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“ (PDF). Molekulární a buněčná proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932. S2CID 7531012.

[pmid9647778-9] A ^b ^C Chen J, Peterson RT, Schreiber SL (červen 1998). "Alfa 4 se asociuje s proteinovými fosfatázami 2A, 4 a 6". Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 247 (3): 827–32. doi:10.1006 / bbrc.1998.8792. PMID 9647778.

[pmid18782753-10] Goudreault M, D'Ambrosio LM, Kean MJ, Mullin MJ, Larsen BG, Sanchez A, Chaudhry S, Chen GI, Sicheri F, Nesvizhskii AI, Aebersold R, Raught B, Gingras AC (leden 2009). „Síť s vysokou hustotou interakce fosfatázy PP2A identifikuje nový komplex fosfatázy a kinázy interagující se striatinem spojený s proteinem cerebrální kavernózní malformace 3 (CCM3)“. Molekulární a buněčná proteomika. 8 (1): 157–71. doi:10,1074 / mcp.M800266-MCP200. PMC 2621004. PMID 18782753.

[pmid10441131-11] Chung H, Nairn AC, Murata K, Brautigan DL (srpen 1999). „Mutace Tyr307 a Leu309 v katalytické podjednotce proteinové fosfatázy 2A podporuje asociaci s podjednotkou alfa 4, která podporuje defosforylaci elongačního faktoru-2“. Biochemie. 38 (32): 10371–6. doi:10,1021 / bi990902g. PMID 10441131.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]