IFT20 - IFT20

IFT20
Identifikátory
Aliasy	IFT20, intraflagelární transport 20
Externí ID	OMIM: 614394 MGI: 1915585 HomoloGene: 49559 Genové karty: IFT20
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	28,335,489 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	78,541,737 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • opsinová vazba; • Vazba Rab GTPázy;
Buněčná složka	• síť cis-Golgi; • Golgiho membrána; • centriole; • konec dendritu; • řasnatá základna; • ciliární bazální tělo; • pohyblivé cilium; • cytoplazma; • fotoreceptor spojující cilium; • cytoskelet; • buněčná projekce; • řasnatý hrot; • vnější segment fotoreceptoru; • centrosome; • stereocilium; • mikrovilli; • intraciliary transportní částice B; • Golgiho aparát; • kinociliární bazální tělo; • cilium;
Biologický proces	• vyhlazená signální dráha; • organizace projekce buněk; • neurogeneze; • proliferace nervových prekurzorů; • organizace vnějšího segmentu fotoreceptorové buňky; • diferenciace buněk srdečního svalu; • vývoj ledvin; • lokalizace proteinu do Golgiho aparátu; • transport opsinu; • regulace kanonické signální dráhy Wnt; • vizuální učení; • regulace sestavy autofagozomu; • regulace sestavy cilium; • stanovení rovinné polarity; • organizace stereocilium receptoru vnitřního ucha; • lokalizace proteinu do cilium; • lokalizace centrozomu; • vývoj kochley; • intraciliary transport; • intraciliary transport zapojený do shromáždění cilium; • cilium morfogeneze; • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • spermatogeneze; • regulace signální dráhy alfa-receptoru růstového faktoru odvozeného z krevních destiček; • diferenciace buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	90410
	55978
	ENSG00000109083
	ENSMUSG00000001105
	Q8IY31
	Q61025
NM_174887; NM_001267774; NM_001267775; NM_001267776; NM_001267777;
	NM_001267778
	NM_018854
NP_001254703; NP_001254704; NP_001254705; NP_001254706; NP_001254707;
	NP_777547
	NP_061342
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Intraflagelární transportní protein 20 homolog je protein že u lidí je kódován IFT20 gen.^[5] Gen se skládá ze 6 exonů a je umístěn na lidském chromozomu 17p11.1. Tento gen je exprimován v lidském mozku, plicích, ledvinách a slinivce břišní a nižší exprese byla také detekována v lidské placentě, játrech, brzlíku, prostatě a varlatech.^[6]

Intraflagelární transport (IFT), na kterém se podílejí molekulární motory a proteiny částic IFT, je velmi důležitý při sestavování a udržování mnoha řasinek / bičíků, jako jsou pohyblivé řasy, které řídí plavání buněk a embryí, nodální řasy, které generují zleva doprava asymetrie u embryí obratlovců a smyslové řasy, které detekují smyslové podněty u některých zvířat.^[6] Podjednotka IFT20 částice je lokalizována na golgiho komplex kromě bazálního těla a řasinek, kde byly nalezeny všechny předchozí proteiny částic IFT. V živých buňkách je fluorescenčně značený IFT20 vysoce dynamický a pohybuje se mezi komplexem Golgi a ciliem i podél řasnatých mikrotubulů.^[7] Ukázalo se, že IFT20 interaguje s SPEF2 ve varlatech a hraje roli v motilitě spermií.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109083 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001105 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: IFT20 intraflagellar transport 20 homolog (Chlamydomonas)“.
^ ^A ^b Yin G, Dai J, Ji C, Ni X, Shu G, Ye X, Dai J, Wu Q, Gu S, Xie Y, Zhao RC, Mao Y (prosinec 2003). "Klonování a charakterizace lidského genu IFT20". Mol. Biol. Rep. 30 (4): 255–60. doi:10.1023 / A: 1026365124176. PMID 14672413. S2CID 11836051.
^ Follit JA, Tuft RA, Fogarty KE, Pazour GJ (2006). „Intraflagellar Transport Protein IFT20 je spojován s komplexem Golgi a je vyžadován pro shromáždění řasinek“. Mol. Biol. Buňka. 17 (9): 3781–92. doi:10,1091 / mbc.E06-02-0133. PMC 1593158. PMID 16775004.
^ Sironen, Anu; Hanse, J .; Thomsen, B .; Andersson, M .; Vilkki, J .; Toppari, J .; Kotaja, N (2010). „Exprese SPEF2 během myší spermatogeneze a identifikace IFT20 jako interagujícího proteinu“. Biologie reprodukce. 82 (3): 580–590. doi:10.1095 / biolreprod.108.074971. PMID 19889948.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Baker SA, Freeman K, Luby-Phelps K, et al. (2003). „IFT20 spojuje kinesin II s savčím intraflagelovým transportním komplexem, který je konzervován v pohyblivých bičících a smyslových řasinkách“. J. Biol. Chem. 278 (36): 34211–8. doi:10,1074 / jbc.M300156200. PMID 12821668.
Jurczyk A, Gromley A, Redick S a kol. (2004). „Pericentrin tvoří komplex s intraflagelárními transportními proteiny a polycystin-2 a je nezbytný pro primární shromáždění řasinek“. J. Cell Biol. 166 (5): 637–43. doi:10.1083 / jcb.200405023. PMC 2172416. PMID 15337773.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109083 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001105 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: IFT20 intraflagellar transport 20 homolog (Chlamydomonas)“.

[pmid14672413-6] A ^b Yin G, Dai J, Ji C, Ni X, Shu G, Ye X, Dai J, Wu Q, Gu S, Xie Y, Zhao RC, Mao Y (prosinec 2003). "Klonování a charakterizace lidského genu IFT20". Mol. Biol. Rep. 30 (4): 255–60. doi:10.1023 / A: 1026365124176. PMID 14672413. S2CID 11836051.

[pmid16775004-7] Follit JA, Tuft RA, Fogarty KE, Pazour GJ (2006). „Intraflagellar Transport Protein IFT20 je spojován s komplexem Golgi a je vyžadován pro shromáždění řasinek“. Mol. Biol. Buňka. 17 (9): 3781–92. doi:10,1091 / mbc.E06-02-0133. PMC 1593158. PMID 16775004.

[Sironen_2-8] Sironen, Anu; Hanse, J .; Thomsen, B .; Andersson, M .; Vilkki, J .; Toppari, J .; Kotaja, N (2010). „Exprese SPEF2 během myší spermatogeneze a identifikace IFT20 jako interagujícího proteinu“. Biologie reprodukce. 82 (3): 580–590. doi:10.1095 / biolreprod.108.074971. PMID 19889948.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]