IFIT1 - IFIT1

IFIT1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4HOU
Identifikátory
Aliasy	IFIT1, C56, G10P1, IFI-56, IFI-56K, IFI56, IFIT-1, IFNAI1, ISG56, P56, RNM561, interferonem indukovaný protein s tetratrikopeptidovými opakováními 1
Externí ID	OMIM: 147690 MGI: 2148249 HomoloGene: 78213 Genové karty: IFIT1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	89,406,487 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	34,640,743 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • hostitelská buňka; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace aktivity helikázy; • reakce na virus; • pozitivní regulace replikace virového genomu; • negativní regulace replikace virového genomu; • negativní regulace obranné reakce na virus hostitelem; • buněčná odpověď na interferon typu I.; • GO: virový proces 0022415; • intracelulární transport virového proteinu v hostitelské buňce; • negativní regulace vazby na bílkoviny; • interferonová signální dráha typu I; • vrozený imunitní systém; • regulace obranné reakce na virus; • buněčná odpověď na exogenní dsRNA; • proces imunitního systému; • obranná reakce na virus; • reakce na bakterii; • buněčná odpověď na interferon-beta;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3434
	112419
	ENSG00000185745
	ENSMUSG00000067297
	P09914
	Q3U687
	NM_001548; NM_001270927; NM_001270928; NM_001270929; NM_001270930
	NM_053217; NM_001362130
	NP_001257856; NP_001257857; NP_001257858; NP_001257859; NP_001539
	NP_444447; NP_001349059
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Interferonem indukovaný protein s tetratrikopeptidovými opakováními 1 je protein že u lidí je kódován IFIT1 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185745 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067297 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lafage M, Clauss I, Couez D, Simonetti J, Wathelet MG, Huez G (červenec 1992). „Geny IFI-56K a IFI-54K indukovatelné interferonem a virem jsou lokalizovány na lidském chromozomu 10 v pásmech q23-q24“. Genomika. 13 (2): 458–60. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90272-T. PMID 1377167.
^ Wathelet MG, Clauss IM, Content J, Huez GA (červen 1988). „IFI-56K a IFI-54K interferonem indukovatelné lidské geny patří do stejné genové rodiny“. FEBS Lett. 231 (1): 164–71. doi:10.1016/0014-5793(88)80724-5. PMID 3360121. S2CID 22937671.
^ „Entrez Gene: IFIT1 interferonem indukovaný protein s tetratrikopeptidem opakuje 1“.

Další čtení

Wathelet MG, Clauss IM, Nols CB a kol. (1988). „Nové induktory odhalené analýzou sekvence promotoru dvou lidských genů aktivovaných interferonem“. Eur. J. Biochem. 169 (2): 313–21. doi:10.1111 / j.1432-1033.1987.tb13614.x. PMID 3121313.
Wathelet MG, Szpirer J, Nols CB a kol. (1988). "Klonování a chromozomální umístění lidských genů indukovatelných interferonem typu I". Somat. Cell Mol. Genet. 14 (5): 415–26. doi:10.1007 / BF01534709. PMID 3175763. S2CID 42406993.
Kusari J, Szabo P, Grzeschik KH, Sen GC (1987). "Chromozomální lokalizace interferonem indukovatelného lidského genu kódujícího mRNA 561". J. Interferon Res. 7 (1): 53–9. doi:10.1089 / jir.1987.7.53. PMID 3585080.
Wathelet M, Moutschen S, Defilippi P a kol. (1986). „Molekulární klonování, sekvence plné délky a předběžná charakterizace 56-kDa proteinu indukovaného lidskými interferony“. Eur. J. Biochem. 155 (1): 11–7. doi:10.1111 / j.1432-1033.1986.tb09452.x. PMID 3753936.
Chebath J, Merlin G, Metz R a kol. (1983). „Interferonem indukovaný 56 000 Mr protein a jeho mRNA v lidských buňkách: molekulární klonování a částečná sekvence cDNA“. Nucleic Acids Res. 11 (5): 1213–26. doi:10.1093 / nar / 11.5.1213. PMC 325791. PMID 6186990.
Rebouillat D, Marié I, Hovanessian AG (1998). „Molekulární klonování a charakterizace dvou příbuzných a interferonem indukovaných 56-kDa a 30-kDa proteinů vysoce podobných 2'-5 'oligoadenylát syntetáze“. Eur. J. Biochem. 257 (2): 319–30. doi:10.1046 / j.1432-1327.1998.2570319.x. PMID 9826176.
Guo J, Sen GC (2000). „Charakterizace interakce mezi interferonem indukovaným proteinem P56 a proteinem Int6 kódovaným lokalizací inzerce viru myšího mléčného nádoru“. J. Virol. 74 (4): 1892–9. doi:10.1128 / JVI.74.4.1892-1899.2000. PMC 111667. PMID 10644362.
Guo J, Peters KL, Sen GC (2000). "Indukce lidského proteinu P56 interferonem, dvouvláknovou RNA nebo virovou infekcí". Virologie. 267 (2): 209–19. doi:10.1006 / viro.1999.0135. PMID 10662616.
Guo J, Hui DJ, Merrick WC, Sen GC (2001). „Nová cesta translační regulace zprostředkovaná eukaryotickým iniciačním faktorem 3“. EMBO J.. 19 (24): 6891–9. doi:10.1093 / emboj / 19.24.6891. PMC 305884. PMID 11118224.
Patzwahl R, Meier V, Ramadori G, Mihm S (2001). „Zvýšená exprese genů regulovaných interferony v játrech pacientů s chronickou infekcí virem hepatitidy C: detekce supresivně-subtraktivní hybridizací“. J. Virol. 75 (3): 1332–8. doi:10.1128 / JVI.75.3.1332-1338.2001. PMC 114039. PMID 11152506.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gavrilov BG, Monastyrskaia GS, Velikodvorskaia TV a kol. (2003). „[Pozdní aktivace interferonem indukovaných genů IFI-54k a IFI-56k v lidských RH buňkách infikovaných virem klíšťové encefalitidy]“. Bioorg. Khim. 29 (2): 175–80. doi:10.1023 / a: 1023260415910. PMID 12708317. S2CID 34300356.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Terenzi F, Hui DJ, Merrick WC, Sen GC (2006). „Výrazné indukční vzorce a funkce dvou úzce souvisejících lidských interferonem indukovatelných lidských genů, ISG54 a ISG56“. J. Biol. Chem. 281 (45): 34064–71. doi:10,1074 / jbc.M605771200. PMID 16973618.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185745 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067297 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1377167-5] Lafage M, Clauss I, Couez D, Simonetti J, Wathelet MG, Huez G (červenec 1992). „Geny IFI-56K a IFI-54K indukovatelné interferonem a virem jsou lokalizovány na lidském chromozomu 10 v pásmech q23-q24“. Genomika. 13 (2): 458–60. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90272-T. PMID 1377167.

[pmid3360121-6] Wathelet MG, Clauss IM, Content J, Huez GA (červen 1988). „IFI-56K a IFI-54K interferonem indukovatelné lidské geny patří do stejné genové rodiny“. FEBS Lett. 231 (1): 164–71. doi:10.1016/0014-5793(88)80724-5. PMID 3360121. S2CID 22937671.

[entrez-7] „Entrez Gene: IFIT1 interferonem indukovaný protein s tetratrikopeptidem opakuje 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]