Hyaloperonospora - Hyaloperonospora - Wikipedia

Hyaloperonospora
Hyaloperonospora brassicae.jpg
Hyaloperonospora brassicae na zelí
Vědecká klasifikace E
Clade:SAR
Kmen:Oomycota
Objednat:Peronosporales
Rodina:Peronosporaceae
Rod:Hyaloperonospora
Konstantní.

Hyaloperonospora je rod oomycete, obligátních, rostlinných patogenů, který byl původně považován za součást Peronospora.[1] Druhy v této skupině produkují chorobu zvanou peronospóra a mohou infikovat mnoho důležitých plodin.[1] Z 19 rodů plísní produkujících rody, Hyaloperonospora byl seskupen s Perofascia v plesnivých plísních.[1] Ve skupině plísní Hyaloperonospora je třetí největší rod.[1] Nejznámějším druhem rodu je Hyaloperonospora parasitica, nebo také známý jako Hyaloperonospora arabidopsis.[2] Tento druh se stal modelovým organismem díky své schopnosti infikovat modelovou rostlinu Arabidopsis thaliana.[2] Používá se ke studiu interakcí rostlin a patogenů a je v současné době jediný Hyaloperonospora druh, který má shromážděný genom.[2]

Dějiny

V roce 2002 Hyaloperonospora byl objeven a popsán Constantinescu, O. a Fatehi, J. pomocí morfologických a molekulárních charakteristik.[3]. Později Göker et al., také použili molekulární fylogenetické techniky ukazující, že skupina byla dostatečně odlišná od druhé Peronospora druh za svůj vlastní taxon.[4] Hyaloperonospora spolu s Perofascia byli prvními plísněmi popsanými pomocí jejich molekulárních fylogenií.[1]

Stanoviště a ekologie

Hyaloperonospora lze nalézt na rostlinách asi 20 různých kmenů Brassicaceae.[1] Obecně je lze najít kdekoli, kde roste jejich hostitelská rostlina, kvůli transportu člověka z obchodu se semeny.[1] Hyaloperonospora parasitica je na rozdíl od většiny ostatních druhů v rodině tím, že má velmi široký rozsah hostitelů a infikuje různé plodiny[Citace je zapotřebí ]. Další důležitá interakce je s Hyaloperonospora brassicae, který má také širší rozsah hostitelů infikujících mnoho Brassica druh[Citace je zapotřebí ].

Obecná forma a struktura

Hyaloperonospora se liší od Perofascia v tom, že jeho sporangiofory jsou podobné stromům, jeho haustoria jsou laločnaté až kulovité a stěny jeho oporpor jsou relativně tenčí.[1]

Životní historie se neliší od historie Peronosporarod, který Hyaloperonospora druhy, které byly dříve klasifikovány pod[Citace je zapotřebí ]. Začíná to jako sporangie, což je malá spórovitá struktura, a když přistane vedle listové stomie, vyklíčí zárodečnou trubici.[5] Zárodková trubice vstupuje do buňky listu a vytváří haustorium, které umožňuje plísni přijímat živiny z listu.[5] Plíseň bude i nadále růst a hyfy zasahují do mezibuněčného prostoru listu.[5] Tato invaze zabije některé z listových buněk a na listu se vyvine léze následovaná nekrózou.[5] Pokud jsou podmínky příznivé, plíseň projde nepohlavním množením a z listu vyprodukuje strom sporangioforů.[5] Sporangiofory produkují konidie, které mohou být větrem rozptýleny do jiné rostliny.[5] Pokud by byly podmínky v listu nepříznivé, může plíseň projít pohlavní reprodukcí a produkovat haploidní anteridie a haploidní oogonii prostřednictvím meiózy.[5] Tyto dvě struktury jsou jedinými nediploidními fázemi Hyaloperonospora.[5] Antheridia bude fúzovat s oogonií indukující plazmogamii následovanou karyogamií za vzniku diploidních oospór.[5] Oospory pak budou rozptýleny větrem, aby infikovaly více rostlin.[5]

Praktický význam

Hyaloperonospora arabidopsis infikuje modelovou rostlinu Arabidopsis thalianaa asociací se stal vzorovým patogenem pro studium interakcí rostlin a patogenů.[2] Studium těchto interakcí by nám mělo poskytnout vhled do toho, jak můžeme účinněji chránit naše plodiny před smrtícími eukaryotickými patogeny. Používá se také jako model v Arabidopsis Prohlížeč eFP jako jeden z devíti biotických stresů.[6]

Genomika a genetika

The Hyaloperonospora arabidopsis genom byl poprvé sekvenován a sestaven v roce 2008 pomocí sekvenování Sanger a Illumina společností Baxter et al.[7] Uváděli velikost genomu 78 Mb s 9,5násobným pokrytím jaderného genomu a neshromáždili mitochondriální genom.[7] Zjistili také, že 42% genomu sestávalo z opakujících se prvků.[7] Pomocí programu pro detekci genových modelů bylo předpovězeno 14 543 genů kódujících proteiny.[7]

V roce 2015 další dva izoláty Hyaloperonospora arabidopsis byly sekvenovány pomocí Illumina HiSeq s 90násobným pokrytím a uváděly velikosti genomu 70 Mb a 74 Mb[Citace je zapotřebí ].

Druhy zahrnují

Reference

  1. ^ A b C d E F G h Thines, M., & Choi, Y. J. (2015). „Evoluce, rozmanitost a taxonomie Peronosporaceae se zaměřením na rod Peronospora". Fytopatologie. 106 (1): 6–18. doi:10.1094 / PHYTO-05-15-0127-RVW. PMID  26649784.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  2. ^ A b C d Coates, M. E., & Beynon, J. L. (2010). "Hyaloperonospora arabidopsidis jako model patogenu ". Roční přehled fytopatologie. 48: 329–45. doi:10.1146 / annurev-phyto-080508-094422. PMID  19400636.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  3. ^ Constantinescu, O. & Fatehi, J. (2002). "Houby podobné Peronospora (Chromista, Peronosporales) parazitické na Brassicaceae a příbuzných hostitelích". Nova Hedwigia. 74: 291–338. doi:10.1127/0029-5035/2002/0074-0291.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  4. ^ Göker, M., Voglmayr, H., Riethmüller, A., Weiß, M., & Oberwinkler, F. (2003). „Taxonomické aspekty Peronosporaceae odvozené z Bayesovské molekulární fylogenetiky“. Canadian Journal of Botany. 81 (7): 672–683. doi:10.1139 / b03-066.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  5. ^ A b C d E F G h i j Krsteska, V., Dimeska, V., Stojkov, S., & Stojanoski, P. (2015). "Peronospora tabacina A. původce choroby způsobené modrou plísní na tabáku ". Bulharský věstník zemědělské vědy. 21: 132–139.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  6. ^ Winter, D., Vinegar, B., Nahal, H., Ammar, R., Wilson, G. V. a Provart, N. J. (2007). „Prohlížeč„ Electronic Fluorescent Pictograph “pro zkoumání a analýzu rozsáhlých souborů biologických dat“. PLOS ONE. 2 (8): e718. doi:10.1371 / journal.pone.0000718. PMC  1934936. PMID  17684564.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  7. ^ A b C d Baxter, L., Tripathy, S., Ishaque, N., Boot, N., Cabral, A., Kemen, E., ... & Bittner-Eddy, P. (2010). "Podpisy adaptace na závazek biotrofie v EU Hyaloperonospora arabidopsidis genom ". Věda. 330 (6010): 1549–1551. doi:10.1126 / science.1195203. PMC  3971456. PMID  21148394.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)